条形банер-03

прадукты

Метагеномнае секвенирование -NGS

Лінія 62

Метагеном - гэта сукупнасць поўнага генетычнага матэрыялу змешанай супольнасці арганізмаў, напрыклад метагеномы навакольнага асяроддзя і чалавека. Ён змяшчае геномы як культываваных, так і некультывавальных мікраарганізмаў. Метагенамнае секвеніраванне Shotgun з дапамогай NGS дазваляе вывучаць гэтыя заблытаныя геномныя ландшафты, убудаваныя ва ўзоры навакольнага асяроддзя, забяспечваючы не толькі таксанамічнае прафіляванне, а таксама дэталёвае ўяўленне аб відавой разнастайнасці, дынаміцы колькасці і складаных структурах папуляцыі. Акрамя таксанамічных даследаванняў, метагеноміка стрэльбаў таксама прапануе перспектыву функцыянальнай геномікі, дазваляючы даследаваць закадзіраваныя гены і іх меркаваную ролю ў экалагічных працэсах. Нарэшце, усталяванне карэляцыйных сетак паміж генетычнымі элементамі і фактарамі навакольнага асяроддзя спрыяе цэласнаму разуменню складанага ўзаемадзеяння паміж мікробнымі супольнасцямі і іх экалагічным фонам. У заключэнне можна сказаць, што метагеномнае секвенаванне з'яўляецца ключавым інструментам для разгадкі геномных тонкасцяў разнастайных мікробных супольнасцей, асвятляючы шматгранныя адносіны паміж генетыкай і экалогіяй у гэтых складаных экасістэмах.

Платформы: Illumina NovaSeq і DNBSEQ-T7


Падрабязнасці абслугоўвання

Біяінфарматыка

Дэманстрацыйныя вынікі

Выбраныя публікацыі

Перавагі абслугоўвання

Метад прафілявання мікробнай супольнасці без вылучэння і культывавання: Дазваляе секвеніраванне генетычнага матэрыялу з арганізмаў, якія не культывуюцца.

Высокае дазвол: Выяўленне відаў з нізкай колькасцю ў пробах навакольнага асяроддзя.

Комплексны біяінфарматычны аналіз:Арыентаваны не толькі на таксанамічную разнастайнасць, але і на функцыянальную разнастайнасць супольнасці.

Шырокі вопыт:Маючы паслужны спіс паспяховага закрыцця некалькіх метагеномічных праектаў у розных галінах даследаванняў і апрацоўкі больш за 200 000 узораў, наша каманда прыўносіць багаты вопыт у кожны праект.

Спецыфікацыі абслугоўвання

Платформа секвенирования

Стратэгія паслядоўнасці

Рэкамендаваны даныя

Кантроль якасці

Illumina NovaSeq або DNBSEQ-T7

PE150

6-20 Гб

Q30≥85%

Патрабаванні да абслугоўвання

Канцэнтрацыя (нг/мкл)

Агульная колькасць (нг)

Аб'ём (мкл)

≥1

≥30

≥20

● Глеба/глей: 2-3г
● Кішачнае змесціва-жывёлы: 0,5-2г
● Змесціва кішачніка-казуркі: 0,1-0,25г
● Паверхня расліны (узбагачаны асадак): 0,5-1г
● Брадзільны булён, узбагачаны асадкам): 0,2-0,5г
● Фекаліі (буйных жывёл): 0,5-2г
● Фекаліі (мышы): 3-5 гран
● Лёгачны альвеалярны лаважа: фільтравальнай папера
● Мазок з похвы: 5-6 тампонаў
● Мазок са скуры/палавых органаў/сліна/мяккія тканіны паражніны рота/мазок з глоткі/прамая кішка: 2-3 тампона
● Паверхневыя мікраарганізмы: 5-6 тампонаў
● Вадаём/паветра/біяплёнка: фільтравальная папера
● Эндафіты: 2-3г
● Зубны налёт: 0,5-1г

Працэдура абслугоўвання

дастаўка ўзораў

Дастаўка ўзору

Падрыхтоўка бібліятэкі

Будаўніцтва бібліятэкі

Секвеніраванне

Секвеніраванне

Аналіз дадзеных

Аналіз дадзеных

Паслугі пасля продажу

Пасляпродажнае абслугоўванне


  • Папярэдняя:
  • далей:

  • 流程图 贝贝第三版-01

    Уключае наступны аналіз:

    ● Кантроль якасці дадзеных паслядоўнасці

    ● Зборка метагеномаў і прагназаванне генаў

    ● Генная анатацыя

    ● Таксанамічны альфа-аналіз разнастайнасці

    ● Функцыянальны аналіз супольнасці: біялагічная функцыя, метабалічны, устойлівасць да антыбіётыкаў

    ● Аналіз функцыянальнай і таксанамічнай разнастайнасці:

    Бэта-аналіз разнастайнасці

    Міжгрупавы аналіз

    Карэляцыйны аналіз: паміж фактарамі навакольнага асяроддзя і складам і разнастайнасцю OUT

    Функцыянальны аналіз: рэзістэнтнасць да антыбіётыкаў CARD

    图片63

    Дыферэнцыяльны аналіз метабалічных шляхоў KEGG: цеплавая карта важных шляхоў

     

    图片64

     Альфа-разнастайнасць таксанамічнага размеркавання: індэкс ACE

    Лінія 65

     

    Бэта-разнастайнасць таксанамічнага размеркавання: PCoA

    图片66

    Даследуйце дасягненні, якія спрыяюць паслугі секвеніравання метагеномаў BMKGene з Illumina праз падабраную калекцыю публікацый.

    Хай, К. і інш. (2023) «Метагенамічны і метабаламічны аналіз змяненняў у змесціве кішачніка вясёлкавай стронгі (Oncorhynchus mykiss), заражанай вірусам інфекцыйнага гемапаэтычнага некрозу пры розных тэмпературах вады ў культуры»,Межы ў мікрабіялогіі, 14, с. 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.

    Mao, C. і інш. (2023) «Мікробныя супольнасці, гены рэзістэнтнасці і рызыкі рэзістомаў у гарадскіх азёрах розных трафічных станаў: унутраныя сувязі і знешнія ўздзеянні»,Часопіс дасягненняў небяспечных матэрыялаў, 9, с. 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.

    Су, М. і інш. (2022) «Метагенамічны аналіз выявіў адрозненні ў складзе і функцыях паміж асацыяванымі з вадкасцю і цвёрдымі рэчывамі мікраарганізмамі рубца авечак»,Межы ў мікрабіялогіі, 13, с. 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.

    Yin, J. і інш. (2023) «Мікрабіёта свіней Нінсян, якія пакутуюць атлусценнем, перабудоўвае метабалізм карніціну, каб спрыяць адкладу тоўстых кіслот у цягліцах у худых свіней DLY»,Інавацыі, 4(5), с. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.

    Чжао, X. і інш. (2023) «Метагенамічнае ўяўленне аб патэнцыйных рызыках рэпрэзентатыўнага бія/нераскладальнага пластыка і непластыкавага смецця ў верхнім і ніжнім цячэнні лімана Хайхэ, Кітай»,Навука аб агульным навакольным асяроддзі, 887, с. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.

    атрымаць цытату

    Напішыце тут сваё паведамленне і адпраўце яго нам

    Адпраўце нам паведамленне: