lncrna

Доўгія некадавальныя РНК (lncRNA)-РНК больш за 200 нуклеатыдаў з нізкім патэнцыялам кадавання, але з крытычнымі рэгулятыўнымі функцыямі. Трубаправод BMKCloud lncRNA прызначаны для аналізу бібліятэк, знясіленых рРНК з высокай якасцю, добра анатаваным эталонным геномам, аналізуючы экспрэсію lNCRNA і мРНК разам. Пасля прачытання абрэзкі і кантролю якасці, чытанні выраўнаваны да эталоннага генома для зборкі стэнаграмаў, а наступны аналіз структуры генаў паказвае альтэрнатыўнае сплайсинг і новыя гены. Стэнаграмы ідэнтыфікуюцца як мРНК або lncRNA, а дыферэнцыяльны аналіз экспрэсіі вызначае розна экспрэсіраваныя lncRNA, іх мэты і дыферэнцыяльна экспрэсіраваныя гены (DEG). Абодва DEG, і дыферэнцыравана экспрэсіраваныя мэты lNCRNA функцыянальна анатаваны, каб знайсці ўзбагачаныя функцыянальныя катэгорыі.