Метагеноміка (NGS)

Метагеноміка «дробавіка» з дапамогай Illumina — папулярны інструмент для вывучэння мікрабіёмаў шляхам непасрэднага секвенавання ДНК са складаных узораў, што дазваляе вывучаць як таксанамічную, так і функцыянальную разнастайнасць. Канвеер метагеномікі (NGS) BMKCloud пачынаецца з кантролю якасці і зборкі метагенома, на падставе якіх прадказваюцца гены і кластэрызуюцца ў нерэзервныя наборы даных, якія анатаваны па функцыянальнасці і таксанаміі з выкарыстаннем некалькіх баз даных. Гэтая інфармацыя выкарыстоўваецца для аналізу таксанамічнай разнастайнасці ўнутры выбаркі (альфа-разнастайнасці) і разнастайнасці паміж выбаркамі (бэта-разнастайнасць). Дыферэнцыяльны аналіз паміж групамі выяўляе OTU і біялагічныя функцыі, якія адрозніваюцца паміж дзвюма групамі, з выкарыстаннем як параметрных, так і непараметрычных тэстаў, у той час як карэляцыйны аналіз звязвае гэтыя адрозненні з фактарамі навакольнага асяроддзя.