Метагеноміка (NGS)

Метагеноміка стрэльбы з Illumina з'яўляецца папулярным інструментам для вывучэння мікрабіёмаў шляхам непасрэднага секвенирования ДНК са складаных узораў, што дазваляе вывучаць таксанамічную і функцыянальную разнастайнасць. Метагеномны канвеер BMKCloud (NGS) пачынаецца з кантролю якасці і зборкі метагеномаў, з якіх гены прагназуюцца і кластэрызуюцца ў наборы даных без лішкаў, якія анатаваны для функцыі і таксанаміі з выкарыстаннем некалькіх баз даных. Гэтая інфармацыя выкарыстоўваецца для аналізу таксанамічнай разнастайнасці ўнутры выбаркі (альфа-разнастайнасць) і разнастайнасці паміж выбаркамі (бэта-разнастайнасць). Дыферэнцыяльны аналіз паміж групамі знаходзіць OTU і біялагічныя функцыі, якія адрозніваюцца паміж дзвюма групамі, выкарыстоўваючы параметрычныя і непараметрычныя тэсты, у той час як карэляцыйны аналіз звязвае гэтыя адрозненні з фактарамі навакольнага асяроддзя.