Аналіз эўкарыятычнай мРНК (даступныя варыянты на аснове эталонных дадзеных і de novo)
Гэты канвеер выкарыстоўвае дадзеныя NGS RNA-Seq у якасці ўваходных дадзеных і стварае вынікі некалькіх наступных аналізаў, уключаючы, але не абмяжоўваючыся: ацэнку якасці дадзеных секвенавання,дэ-новаанатацыя сайтаў транскрыпцыі, аналіз сплайсінгу зменных, аналіз дыферэнцыяльнай экспрэсіі, анатацыя функцый і аналіз узбагачэння.
Аналіз доўгіх некадзіруючых РНК
Доўгія некадзіруючыя РНК (днРНК) — гэта некадзіруючыя транскрыпты даўжынёй больш за 200 нуклеатыдаў, якія, як вядома, гуляюць ролю ў арганізацыі і рэгуляцыі храматыну. Высокапрадукцыйныя тэхналогіі секвенавання і біяінфарматыка дазволілі нам лепш разумець паслядоўнасці днРНК і інфармацыю аб пазіцыянаванні, каб ідэнтыфікаваць днРНК з найважнейшымі рэгуляторнымі функцыямі. Гэты канвеер забяспечвае аналіз днРНК у дадатак да аналізаў, згаданых у канвееры аналізу эўкарыятычнай мРНК.
Секвенаванне ампліконаў 16S/18S/ITS
Канвеер аналізу мікробнай разнастайнасці Amplicon Sequencing быў распрацаваны на аснове шматгадовага вопыту ў аналізе праектаў мікробнай разнастайнасці. Канвеер утрымлівае стандартызаваны базавы аналіз, які ахоплівае асноўны змест аналізу сучасных мікробных даследаванняў і персаналізаваны аналіз. Справаздача аб аналізе з'яўляецца багатай і ўсёабдымнай, з магчымасцю правядзення разнастайнага персанальнага аналізу. Акрамя таго, узоры і групы можна змяняць на хаду для дадатковай налады і кантролю.
Аналіз метагеномікі стрэльбы
Канвеер метагеномнага аналізу Shotgun выкарыстоўвае дадзеныя NGS са змешаных геномных матэрыялаў, атрыманых з узораў навакольнага асяроддзя. Уключаныя аналізы даюць падрабязную інфармацыю аб відавой разнастайнасці і колькасці, структуры папуляцыі, філагенетычных сувязях, функцыянальных генах і карэляцыйных сетках з фактарамі навакольнага асяроддзя.
Аналіз варыянтаў NGS-WGS
Аналіз варыянтаў NGS-WGS — гэта інтэграваны канвеер выяўлення варыянтаў, які выконвае кантроль якасці дадзеных, выраўноўванне паслядоўнасцей, анатацыю і аналіз генных мутацый. Канвеер адпавядае перадавым практыкам GATK для выяўлення SNP і InDel і выкарыстоўвае Manta для выкліку структурных варыянтаў.
Даследаванне асацыяцый па ўсім геноме (GWAS)
Канвеер GWAS — гэта аналіз, які выкарыстоўвае раней створаныя VCF-файлы і адпаведныя фенатыпныя дадзеныя для кагорты асобін у якасці ўваходных дадзеных. Выкарыстоўваючы спецыяльныя статыстычныя метадалогіі, GWAS імкнецца выявіць варыяцыі нуклеатыдаў ва ўсім геноме, якія карэлююць з фенатыпічнымі адрозненнямі. Ён адыгрывае вырашальную ролю ў вывучэнні функцыянальных генаў, звязаных са складанымі захворваннямі чалавека і складанымі рысамі ў раслін і жывёл.
Аналіз масавай сегрэгацыі (BSA)
Аналіз BSA прадугледжвае аб'яднанне асобін з экстрэмальнымі фенатыпічнымі рысамі з сегрэгацыйнай папуляцыі. Параўноўваючы дыферэнцыяльныя локусы паміж аб'яднанымі ўзорамі, гэты падыход хутка ідэнтыфікуе цесна звязаныя малекулярныя маркеры, звязаныя з мэтавымі генамі. Шырока выкарыстоўваецца ў генетычным картаграфаванні раслін і жывёл, і з'яўляецца каштоўным інструментам для селекцыі з дапамогай маркераў.
Эвалюцыйна-генетычны аналіз
Працоўны працэс эвалюцыйна-генетычнага аналізу выкарыстоўвае шырокі вопыт BMKGENE ў праектах генетычнай эвалюцыі і ўключае пабудову філагенетычнага дрэва, аналіз парушэнняў раўнавагі зчэплення, ацэнку генетычнай разнастайнасці, ідэнтыфікацыю селектыўнага разгортвання, аналіз сваяцтва, аналіз галоўных кампанент і характарыстыку структуры папуляцыі.
