-
Genome-wide Association Analysis
Genome-wide association study (GWAS) hat as doel om genetyske farianten (genotype) te identifisearjen dy't ferbûn binne mei spesifike eigenskippen (fenotype).GWAS-stúdzje ûndersiket genetyske markers troch it heule genom fan in grut oantal yndividuen en foarseit genotyp-fenotypeferienings troch statistyske analyze op populaasjenivo.It is breed tapast yn ûndersyk nei minsklike sykten en funksjonele genmynbou op komplekse eigenskippen fan bisten of planten.
-
Plant / Animal Whole Genome Sequencing
Folsleine genome-re-sekwinsje, ek wol WGS neamd, makket it iepenbierjen fan sawol mienskiplike as seldsume mutaasjes op it heule genom mooglik, ynklusyf Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV), en Copy Number Variation (CNV) ).SV's meitsje in grutter diel fan 'e fariaasjebasis út as SNP's en hawwe in gruttere ynfloed op it genoom, wat in signifikant effekt hat op libbene organismen.Langlêzen resequencing soarget foar krekter identifikaasje fan grutte fragminten en yngewikkelde fariaasjes, om't lange lêzings it folle makliker meitsje om chromosomale krusing oer yngewikkelde regio's lykas tandem-repetysjes, GC / AT-rike regio's, en hyper-fariabele regio's.
Platfoarm: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Evolúsjonêre genetika
Evolúsjonêre genetika is in ynpakt sekwinsjele tsjinst ûntworpen foar it jaan fan in wiidweidige ynterpretaasje oer evolúsjonêre ynformaasje fan opjûne materialen basearre op genetyske fariaasjes, ynklusyf SNP's, InDels, SV's en CNV's.It jout alle fûnemintele analyze nedich foar it beskriuwen fan evolúsjonêre feroarings en genetyske skaaimerken fan populaasjes, lykas populaasje struktuer, genetyske ferskaat, fylogeny relaasjes, ensfh It befettet ek stúdzjes op gen flow, dy't machtigje skatting fan effektive befolking grutte, divergence tiid.
-
Fergelykjende Genomics
Fergelykjende genomika betsjut letterlik it fergelykjen fan de folsleine genoomsekwinsjes en struktueren fan ferskate soarten.Dizze dissipline is fan doel it ûntdekken fan soarten evolúsje, genfunksje, genregulearjend meganisme op genoomnivo troch it identifisearjen fan de sekwinsjestruktueren en eleminten dy't bewarre of differinsjeare oer ferskate soarten.Typyske ferlykjende genomika-stúdzje omfettet analyzes yn genfamylje, evolúsjonêre ûntwikkeling, duplikaasje fan heule genom, selektive druk, ensfh.
-
Hi-C basearre Genome Assembly
Hi-C is in metoade ûntworpen om chromosoomkonfiguraasje te fangen troch it kombinearjen fan proximity-basearre ynteraksjes en sequencing mei hege trochput.De yntinsiteit fan dizze ynteraksjes wurdt leaud negatyf korrelearre te wêzen mei fysike ôfstân op chromosomen.Dêrom koene Hi-C-gegevens it klusterjen, oarderjen en oriïntearjen fan gearstalde sekwinsjes yn in konseptgenoom liede en dy ferankje op in bepaald oantal chromosomen.Dizze technology makket in genoom-assemblage op chromosoomnivo mooglik by it ûntbrekken fan populaasje-basearre genetyske kaart.Elk genoom hat in Hi-C nedich.
Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm / DNBSEQ
-
Plant / Animal De Novo Genome Sequencing
De Novosequencing ferwiist nei de konstruksje fan in soarte' hiele genome mei help fan sequencing technologyen, bgl PacBio, Nanopore, NGS, ensfh, by it ûntbrekken fan in referinsje genoom.De opmerklike ferbettering yn lêslingte fan technologyen foar sekwinsje fan tredde generaasje hat nije kânsen brocht by it gearstallen fan komplekse genomen, lykas dy mei hege heterozygositeit, hege ferhâlding fan repetitive regio's, polyploïden, ensfh. it oplossen fan repetitive eleminten, regio's mei abnormale GC-ynhâld en oare heul komplekse regio's.
Platfoarm: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq Platfoarm
-
Human Whole Exome Sequencing
Whole exome sequencing (WES) wurdt beskôge as in kosten-effektive sequencing strategy foar it identifisearjen fan sykte-feroarsaakje mutaasjes.Hoewol exons allinich sawat 1,7% fan it heule genom opnimme, fertsjintwurdiget it direkt it profyl fan totale proteïnefunksjes.Yn it minsklik genoom is it rapportearre dat mear dan 85% fan sykte-relatearre mutaasjes foarkomme yn proteïnekodearjende regio.
BMKGENE biedt wiidweidige en fleksibele tsjinsten foar folsleine eksoomsekwinsjes mei ferskate ekson-fangstrategyen beskikber om te foldwaan oan ferskate ûndersyksdoelen.
Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Hege-throughput genotyping, benammen op grutskalige befolking, is in fûnemintele stap yn genetyske assosjaasje stúdzjes, dy't jout genetyske basis foar funksjonele gen ûntdekking, evolúsjonêre analyze, ensfh Ynstee fan djippe hiele genome re-sequence, redusearre fertsjintwurdiging genome sequencing (RRGS) ) wurdt yntrodusearre om sequencingkosten per stekproef te minimalisearjen, wylst ridlike effisjinsje behâlde op ûntdekking fan genetyske markers.Dit wurdt ornaris berikt troch extracting beheining fragmint binnen opjûne grutte berik, dat wurdt neamd redusearre fertsjintwurdiging bibleteek (RRL).Specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-Seq) is in sels ûntwikkele strategy foar SNP genotyping mei of sûnder in referinsjegenoom.
Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm
