Heatmap
Matrixgegevensbestân wurdt brûkt foar tekenjen fan waarmtekaarten, dy't matrixgegevens kinne filterje, normalisearje en klusterje.It wurdt meast brûkt foar klusteranalyze fan gen-ekspresjenivo tusken ferskate samples.
Gene Annotation
Gene funksje annotaasje wurdt útfierd troch mapping sekwinsjes yn FASTA triem tsjin ferskate database.
Gene Annotation
Basis Lokale Alignment Search Tool
CDS_UTR_Foarsizzing
Dit ark is ûntworpen om kodearjende regio's (CDS) en net-kodearjende regio's (UTR) te foarsizzen yn opjûne transkripsjesekwinsjes basearre op blazen tsjin bekende proteindatabase en ORF-foarsizzing.
Manhattan Plot
Manhattan plot makket it werjaan fan gegevens mei in grut oantal gegevenspunten mooglik.It wurdt faak brûkt yn genome-wide association studies (GWAS).
Circos
CIRCOS-diagram makket direkte presintaasje fan SNP, InDeL, SV, CNV-distribúsjes op genome mooglik.
GO_Enrichment
TopGO is in ark ûntworpen foar funksjonele ferriking.TopGO-Bioconductor pakket bestiet út differinsjaaloperator ekspresje analyze, GO ferriking analyze en fisualisaasje fan de resultaten.It sil in map generearje mei útfier mei de namme "Graph", dy't resultaten befettet foar topGO_BP, topGO_CC en topGO_MF.
WGCNA
WGCNA is in breed brûkte metoade foar data mining foar it ûntdekken fan gen-ko-ekspresjemodules.It is fan tapassing op ferskate ekspresjedataset, ynklusyf mikroarraygegevens en genekspresjegegevens dy't ûntstien binne út folgjende generaasje sequencing.
InterProScan
InterPro protein sequence analyze en klassifikaasje
GO_KEGG_Enrichment
Dit ark is ûntworpen om GO-ferrikingshistogram, KEGG-ferrikingshistogram en KEGG-ferrikingspaad te generearjen basearre op levere geneset en oerienkommende annotaasje.