●Isolaasje en kultivaasje-fergese metoade foar profilearring fan mikrobiale mienskip: SEAKING SECENCING FAN GENETIC MATERIAL FAN UNKULLIKE ORGANISMEN.
●Hege resolúsje: Detektearje lege oerfloed soarte yn miljeu-samples.
●Wiidweidige bioinformatika-analyse:Konsintreguele net allinich op taksonomyske ferskaat, mar ek op 'e funksjoneel ferskaat oan' e mienskip.
●Wiidweidige ûnderfining:Mei in spoarrekord fan suksesfol te sluten fan meardere metagenomyk yn ferskate ûndersyksdomeinen en ferwurkjen fan mear as 200.000 samples bringt ús team in rykdom oan ûnderfining oan.
Sequencing Platform | SEQUCING STRATEGY | Gegevens oanrikkemandearre | Kwaliteitskontrôle |
Illumina Novaseq as Dnbsq-T7 | Pe150 | 6-20GB | Q30 ≥85% |
Konsintraasje (NG / μL) | Totaal bedrach (Ng) | Folume (μL) |
≥1 | ≥30 oere | ≥20 |
● Boaiem / slyk: 2-3g
● DISTESTINALE CONTEN-DIEREN: 0,5-2G
● DESTESTINALE BEHUSTEN-INSECT: 0.1-0,25g
● Plante oerflak (ferryke sedimint): 0,5-1g
● Fermentaasje Broth Enriched Sediment): 0.2-0.5g
● Faeces (grutte bisten): 0,5-2G
● Faeces (mûs): 3-5grains
● Pulmonary Alveolêre Lavage Floof: filterpapier
● Faginale swab: 5-6 swabs
● Skin / Genital Swab / Saliva / Oral Soft Tissue / FariNgeal Swab / Rektal Swab: 2-3 swabs
● Slimke Microorganisme: 5-6 swabs
● Waterbody / Air / BIOFILM: filterpapier
● Endopytes: 2-3g
● Dental Plaque: 0,5-1g
Omfettet de folgjende analyse:
● SEQUENCING BATTJOCHTWITALING CONTROL
● Metayse-assemblage en Gene foarsizzing
● gene annotaasje
● Takonomyske Alpha Diversity Analyse
● Funksjonele analyse fan 'e mienskip: Biologyske funksje, metabolike, antibiotyske wjerstân
● Analyse op sawol funksjoneel as taksonomyske ferskaat:
Beta Diversity Analyse
Analyse fan Inter Group
Korrelaasjeanalyse: Tusken miljeufaktoaren en út komposysje en ferskaat
Funksjonele analyze: kaart antibiotika ferset
Differinsjaal analyse fan Kegg Metabolyske Pathways: Heatmap fan wichtige paden
Alpha Diversity of Taxonomic Distribúsje: Ace Index
Beta-ferskaat fan taksonomyske distribúsje: PCOA
Ferkenne de AVEVENTS-fasiliteare troch de metagenome fan Bmkgenome's MetaGecing Services mei Illumina troch in skearders samling fan publikaasjes.
Hai, Q. et al. (2023) 'Metabolomyske analyse fan feroaringen yn darmbôge fan Rainbow Trout (Oncorhynchus Mykiss) ynfekteare mei ynfekteare hematopoietyske nekrose firus by ferskate kultuer-wettertemperatuer',Frontiers yn mikrobiology, 14, p. 1275649. DOI: 10.3389 / FMICB.2023.1275649.
Mao, C. et al. (2023) 'mikrobiale mienskippen, ferset genen, en wjerstân risiko's yn stedske marren fan ferskate trefyske steaten: ynterne links en eksterne ynfloeden',Journal of Gefurous Material Advances, 9, p. 100233. doi: 10.1016 / j.hazadv.2023.100233.
Su, M. et al. (2022) 'Metagenomyske analyse iepenbiere ferskillen yn komposysje en funksje tusken floeistof-assosjeare en solid-assosjeare mikroorganismen fan skiep rumen',Frontiers yn mikrobiology, 13, p. 851567. DOI: 10.3389 / FMICB.2022.851567.
Yin, J. et al. (2023) 'Obese Ningxiang Pig-ôflaat Microbiota Rewires Carritïne metabolisme om spieren fetzuur te befoarderjen yn' e lean Dly-pigs ',De ynnovaasje, 4 (5), p. 100486. DOI: 10.1016 / J.Xinn.2023.100486.
Zhao, X. et al. (2023) 'Metagenomyske ynsjoch yn' e potensjele risiko's fan represintative bio / net-degradearlike plestik en net-plestik ôffal yn 'e boppeste en legere berik fan Heihe Estuary, Sina',Wittenskip fan 'e totale omjouwing, 887, p. 164026. DOI: 10.1016 / J.sCITOTENV.2023.164026.