Genome-wide Association Analysis
1.Service Foardielen
● Abundant Project Cases: sûnt syn oprjochting yn 2009, BMKGENE hat foltôge hûnderten soarten projekten yn populaasje GWAS ûndersyk, bystien ûndersikers te publisearjen mear as 100 artikels, en de kumulative ynfloed faktor berikt 500.
● Profesjonele analysts.
● Koarte analyze syklus.
● Accurate data mining.
2. Service Spesifikaasjes
| Type | Befolkingskaal | Sequencing strategy en djipte |
| SLAF-GWAS | Sample nûmer ≥200 | Genoomgrutte <400M, mei ref-genoom, WGS wurdt oanrikkemandearre |
| Genome grutte ≤ 1G, 100K Tags en 10X | ||
| 1G ≤ Genome grutte ≤ 2G, 200K tags en 10X | ||
| Genome grutte> 2G, 300K Tags en 10X | ||
| WGS-GWAS | Sample nûmer ≥200 | 10X foar elke stekproef |
3. Materiaal Seleksje
Ferskillende fariëteiten, ûndersoarten, lânrassen / genbanken / mingde famyljes / wylde boarnen
Ferskillende soarten, ûndersoarten, lânrassen
Half-sib famylje / folsleine-sib famylje / wylde boarnen
4. Bioinformation Analysis
● Genome-wide assosjaasje analyze
● Analyse en screening fan signifikante SNP
● Funksjonele annotaasje fan kandidaatgen
5. Service Work Flow
Eksperimint ûntwerp
Sample levering
RNA-ekstraksje
Biblioteekbou
Sequencing
Data analyze
Nei-ferkeap tsjinsten
in.Fenotype QC
Frekwinsje distribúsje histogram
Fenotype statistiken
b.Assosiaasjeanalyse (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ plot
Manhattan Plot
| Jier | Sjoernaal | IF | Titel |
| 2022 | NC | 17.69 | Genomyske basis fan de giga-chromosomen en giga-genoom fan beampioen Paeonia ostii |
| 2015 | NP | 7.43 | Domestication footprints anker genomyske regio's fan agronomysk belang yn sojabonen |
| 2018 | MP | 9.32 | Folsleine-genoom-resequencing fan in wrâldwide kolleksje fan raapsied-oankomsten ûntbleatet de genetyske basis fan har ekotype-diverginsje |
| 2022 | HR | 7.29 | Genome-wide assosjaasjeanalyse jout molekulêre ynsjoch yn 'e natuerlike fariaasje fan watermeloen siedgrutte |
