DNA / RNA Sequencing - Nanopore Sequencer

ONT sequencing is in ien molekule real-time elektryske sinjaal sequencing technology basearre op nanopores, it sequencing prinsipe fan elk platfoarm is itselde.Dûbelstrengige DNA / RNA sil bine oan nanoporeus proteïne ynbêde yn 'e biofilm en ûntspannen ûnder de lieding fan motorprotein, ûnder de aksje fan spanningsferskil fan beide kanten fan' e biofilm, geane DNA / RNA-strengen troch it nanoporekanaalprotein op in bepaalde taryf.Troch de ferskillen fan 'e gemyske eigenskippen fan' e ferskate basen op 'e DNA / RNA-string, as in inkele basis of DNA-molekule troch it nanoporekanaal giet, sil it de feroaring fan ferskate elektryske sinjalen feroarsaakje.Troch dizze sinjalen te detektearjen en te korrespondearjen, kinne de korrespondearjende basistypen wurde berekkene, en de real-time deteksje fan 'e folchoarder kin foltôge wurde.

Kontakt mei ús opnimme

Service Details

Demo Resultaat

Service Details Features

Perron	Biblioteek Grutte	Teoretyske gegevensopbringst (per sel)	Single-base Accuracy	Oanfraach
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralang, cDNA-PCR	70-90Gb / sel	85-92%	SV-oprop, De novo, Folsleine sequencing, Iso-Seq, Geneannotaasje, Deteksje fan DNA-methylaasje

Service Foardielen

● Mear dan 5 jier ûnderfining op PacBio sequencing platfoarm mei tûzenen sletten projekten mei ferskate soarten.
● BMKGENE is in offisjele partner fan Oxford Nanopore, mei dûbele platfoarm RNA / DNA-sertifikaasje.
● Der binne mainstream modellen fan sequencers mei folsleine apparatuer en genôch sequencing trochfier.
● Op grûn fan it Nanopore-platfoarm binne mear as 10 ûndersiken fan Denovo foar bisten en planten publisearre yn ynternasjonaal ferneamde tydskriften.

Sample Requirements

Sample Type

Tal

Konsintraasje (Qubit ®)

Folume

Purity

Oaren

Genomysk DNA

Ofhinklik fan Data Requirement

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1.5;

Dúdlike pyk by 260 nm, gjin kontaminaasjes

Konsintraasje moat wurde mjitten troch Qubit en Qubit/Nanopore ≤ 2

Totaal RNA

≥1.2μg

≥100 μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0.5-2.5; gjin kontaminaasjes

RIN wearde ≥7,5

Service Workflow

Sample tarieding

Biblioteekbou

Sequencing

Data analyze

Projekt levering

Foarige: DNA / RNA Sequencing - Illumina Sequencer

Folgjende: Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

Data Quality Assessment fan DNA Sample

Tabel 1. Statistiken oer skjinne gegevens.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	skjinN50Len	skjinN90Len	cleanMeanLen	skjinMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25,90	28.014	15.764	23.090	143.181	9