BMKCloud Log in
条形banner-03

Products

Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)

DNA-methylaasjeûndersyk hat altyd in hyt ûnderwerp west yn sykteûndersyk, en is nau besibbe oan geneekspresje en fenotypyske eigenskippen.RRBS is in krekte, effisjinte en ekonomyske metoade foar DNA-methylaasjeûndersyk.Ferriking fan promotor- en CpG-eilânregio's troch enzymatyske splitsing (Msp I), kombineare mei Bisulfite-sekwinsje, leveret DNA-methylaasjedeteksje mei hege resolúsje.

Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm


Service Details

Demo Resultaat

Service Spesifikaasjes

Platfoarm: NovaSeq platfoarm, PE150

Bibleteek type: 200-400bp ynfoegje bisulfite behannele DNA bibleteek

Sequencing strategy: Paired-End 150 bp

Oanrikkemandearje gegevensútfier: 10 Gb rau gegevens / sample

Sample Requirements

DNA kwantiteit: ≥ 2ug

DNA-konsintraasje: ≥ 20ng/μl.

Suverens: OD260/280 = 1.8 oant 2.0 sûnder degradaasje of RNA-kontaminaasje

Bioinformatika analyze

流程图 羽4-03

Service Work Flow

sample levering

Sample levering

Biblioteek Tarieding

Biblioteekbou

Sequencing

Sequencing

Data analyze

Data analyze

Nei ferkeap Tsjinsten

Nei-ferkeap tsjinsten


  • Foarige:
  • Folgjende:

  • a.Referinsje statistyk foar genome ôfstimming

    Statistiken fan mapping lêzen
    byld 3

    Statistics fan sequencing djipte en dekking fan C-side

    byld 4

    Aakkumulearre dekking

    byld5

    Dfersmoarging effisjinsje fan elke stekproef

    ôfbylding6

    b.Deteksje fan methylaasjeplakken

    List fan methylaasjenivo's op C-side

    byld7

    BS konverzje

    ôfbylding8 ôfbylding9

    Methylated cytosine
    ôfbylding10

    Methylaasje nivo ferdieling
    ôfbylding11

    c.Methylaasje kaart

    Genome-wide
    ôfbylding12

    Genome elemint

    ôfbylding13

    d.Fergeliking fan methylaasjenivo's tusken samples
    ôfbylding14

    Pairwise Korrelaasje fan CG-methylaasje
    ôfbylding15

    PCA-CG methylaasje
    ôfbylding16

    Cglâns fan CG-methylaasje
    ôfbylding17

    d.Differinsjaal methylaasje analyze

    Sstatistiken fan DMR

    ôfbylding18

    DMR lingte ferdieling
    ôfbylding19

    Hite kaart
    ôfbylding20

    DMR-distribúsje yn rjochte regio
    ôfbylding21

    krije in offerte

    Skriuw jo berjocht hjir en stjoer it nei ús

    Stjoer jo berjocht nei ús: