mRNA-seq (NGS) mei referinsjegenoom
RNA-seq is in standert ark yn 'e libbens- en gewaakswittenskippen, en oerbrêget de kloof tusken genomen en proteomen. De krêft leit yn it ûntdekken fan nije transkripten en it kwantifisearjen fan har ekspresje yn ien assay. It wurdt breed brûkt foar ferlykjende transkriptomyske stúdzjes, wêrby't it ljocht skine kin op genen dy't relatearre binne oan ferskate eigenskippen of fenotypen, lykas it fergelykjen fan mutanten mei wylde typen of it iepenbierjen fan genekspresje ûnder spesifike omstannichheden. BMKCloud mRNA (Reference) APP yntegreart ekspresjekwantifikaasje, differinsjele ekspresje-analyze (DEG) en sekwinsjestruktueranalyses yn 'e mRNA-seq (NGS) bioinformatika-pipeline en kombinearret de sterke punten fan ferlykbere software, wêrtroch gemak en brûkerfreonlikens garandearre wurde. Brûkers kinne har RNA-seq-gegevens uploade nei de wolk, wêr't de app in wiidweidige, one-stop bioinformatyske analyse-oplossing biedt. Derneist jout it prioriteit oan 'e klantûnderfining, en biedt personaliseare operaasjes oanpast oan 'e spesifike behoeften fan brûkers. Brûkers kinne parameters ynstelle en de pipeline-missy sels yntsjinje, it ynteraktive rapport kontrolearje, gegevens/diagrammen besjen en datamining foltôgje, lykas: doelgenseleksje, funksjonele klustering, diagrammen, ensfh.
Perron:Illumina, MGI
Strategy:RNA-Seq
Opmaak: Parearre, skjinne gegevens.
Biblioteektype:fr-ûntstrenge, fr-earstestring of fr-twaddestring
Lêslingte:150 bp
Triemtype:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz of *.fq.gz. It systeem silautomatysk de .fastq-bestannen keppelje neffens har bestânsnammen,bygelyks *_1.fastq keppele mei *._2.fastq.
Oantal foarbylden:Der binne gjin beheiningen op it oantalfan samples, mar de analysetiid sil tanimme as it oantalmonsters groeie.
Oanrikkemandearre gegevenshoeveelheid:6G per stekproef