-
Genome-wide Association Analysis
Genome-wide association study (GWAS) hat as doel om genetyske farianten (genotype) te identifisearjen dy't ferbûn binne mei spesifike eigenskippen (fenotype).GWAS-stúdzje ûndersiket genetyske markers troch it heule genom fan in grut oantal yndividuen en foarseit genotyp-fenotypeferienings troch statistyske analyze op populaasjenivo.It is breed tapast yn ûndersyk nei minsklike sykten en funksjonele genmynbou op komplekse eigenskippen fan bisten of planten.
-
Single-nucleus RNA Sequencing
De foarútgong yn it fêstlizzen fan ien sel en technyk foar yndividuele bibleteekbou, kombineare mei sequencing mei hege trochput, makket geneekspresjestúdzjes mooglik op sel-foar-sel basis.It makket in djippere en folsleine systeemanalyse mooglik op komplekse selpopulaasjes, wêryn it foar in grut part maskering fan har heterogeniteit foarkomt troch it gemiddelde fan alle sellen te nimmen.
Guon sellen binne lykwols net geskikt om te wurde makke yn ien-sel-suspensie, dus oare metoaden foar tarieding fan monsters - kearnekstraksje út weefsels binne nedich, dat is, kearn wurdt direkt ekstrahearre út weefsels as sel en taret yn ienkearnsuspensje foar single- sel sequencing.
BMK jout 10 × Genomics Chromium TM basearre single-cell RNA sequencing tsjinst.Dizze tsjinst is in protte brûkt yn stúdzjes oer sykte-relatearre stúdzjes, lykas differinsjaasje fan ymmúnsellen, tumorheterogeniteit, weefselûntwikkeling, ensfh.
Romtlike transkriptoomchip: 10 × Genomics
Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm
-
Plant / Animal Whole Genome Sequencing
Folsleine genome-re-sekwinsje, ek wol WGS neamd, makket it iepenbierjen fan sawol mienskiplike as seldsume mutaasjes op it heule genom mooglik, ynklusyf Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV), en Copy Number Variation (CNV) ).SV's meitsje in grutter diel fan 'e fariaasjebasis út as SNP's en hawwe in gruttere ynfloed op it genoom, wat in signifikant effekt hat op libbene organismen.Langlêzen resequencing soarget foar krekter identifikaasje fan grutte fragminten en yngewikkelde fariaasjes, om't lange lêzings it folle makliker meitsje om chromosomale krusing oer yngewikkelde regio's lykas tandem-repetysjes, GC / AT-rike regio's, en hyper-fariabele regio's.
Platfoarm: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Romtlike transkriptoom
Romtlike organisaasje fan sellen spilet in fitale rol yn ferskate biologyske prosessen, lykas ymmúnsteurnissen ynfiltraasje, embryo ûntwikkeling, ensfh Romtlike transcriptome sequencing, dy't oanjout gene ekspresje profilearring wylst behâld fan ynformaasje fan romtlike posysje, hat levere grutte ynsjoch yn transkriptoom-nivo weefsel arsjitektuer.Mei de ûntwikkeling fan technology moatte de ultradúdlike weefselmorfology en it echte strukturele ferskil fan romtlike molekulêre ekspresje studearre wurde mei hegere resolúsje.BMKGENE biedt wiidweidige, ien-stop romtlike transkriptome-sekwinsjetsjinst fan samples oant biologyske ynsjoggen.
Romtlike transkriptomika-technologyen machtigen nije perspektiven yn ferskate ûndersyksarena's troch it oplossen fan gene-ekspresjeprofyl mei romtlike ynhâld yn heterogene samples.
Romtlike transkriptomchip: BMKMANU S1000
Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm
-
10x Genomics Visium Romtlike transkriptoom
Visium Spatial Gene Expression is in mainstream romtlike transkriptoom-sekwinsjetechnology foar it klassifisearjen fan weefsel basearre op totaal mRNA.Map it heule transkriptoom mei morfologyske kontekst om nije ynsjoch te ûntdekken yn normale ûntwikkeling, syktepatology en klinysk oersettend ûndersyk.BMKGENE biedt wiidweidige, ien-stop romtlike transkriptome-sekwinsjetsjinst fan samples oant biologyske ynsjoggen.
Romtlike transkriptomika-technologyen machtigen nije perspektiven yn ferskate ûndersyksarena's troch it oplossen fan gene-ekspresjeprofyl mei romtlike ynhâld yn heterogene samples.
Romtlike transkriptoomchip: 10x Genomics Visium
Perron:Illumina NovaSeq Platfoarm
-
Full-Length mRNA Sequencing-Nanopore
RNA-sekwinsje is in ûnskatbere wearde ark foar wiidweidige transkriptoomanalyse.Sûnder twifel hat tradisjonele koarte-lêzen sequencing hjir in protte wichtige ûntwikkeling berikt.Dochs komt it faaks beheiningen yn 'e folsleine lingte fan isofoarmidentifikaasjes, kwantifikaasje, PCR-bias.
Nanopore sequencing ûnderskiedt him fan oare sequencing platfoarms, yn dat de nucleotides wurde lêzen direkt sûnder DNA synteze en generearret lange lêzen op tsientallen kilobases.Dit machtigt direkte útlêzen oerstekken fan transkripsjes fan folsleine lingte en it oanpakken fan de útdagings yn stúdzjes op isoformnivo.
Perron:Nanopore PromethION
Biblioteek:cDNA-PCR
-
Folsleine lingte mRNA sequencing -PacBio
De novofolsleine-lingte transkriptoom sequencing, ek bekend asDe novoIso-Seq nimt de foardielen fan PacBio sequencer yn lêslingte, dy't sequencing fan cDNA-molekulen mei folsleine lingte mooglik makket sûnder pauzes.Dit foarkomt folslein alle flaters generearre yn transkripsje-assemblagestappen en konstruearret unige sets mei resolúsje op isoformnivo.Dizze unigeensets leveret krêftige genetyske ynformaasje as "referinsjegenoom" op transkriptoomnivo.Dêrneist, kombinearjen mei folgjende generaasje sequencing gegevens, dizze tsjinst machtigt in krekte kwantifikaasje fan isoform-nivo ekspresje.
Platfoarm: PacBio Sequel IIBibleteek: SMRT bell bibleteek -
Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina
mRNA-sequencing makket profilearring mooglik fan alle mRNA's dy't transkripsje út sellen ûnder spesifike omstannichheden.It is in krêftige technology foar it iepenbierjen fan gene-ekspresjeprofyl, genstruktueren en molekulêre meganismen fan bepaalde biologyske prosessen.Oant no ta is mRNA-sekwinsje in soad brûkt yn fûneminteel ûndersyk, klinyske diagnoaze, medisynûntwikkeling, ensfh.
Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm
-
Non-Reference based mRNA Sequencing-Illumina
mRNA sequencing oannimt folgjende-generaasje sequencing technyk (NGS) om it boadskipper RNA (mRNA) fan Eukaryote te fangen yn in spesifike perioade dat guon spesjale funksjes aktivearje.De langste transkripsje dy't splitst waard 'Unigene' neamd en brûkt as referinsjesekwinsje foar folgjende analyze, wat in effektyf middel is om it molekulêre meganisme en regeljouwingnetwurk fan 'e soarte te studearjen sûnder referinsje.
Nei gearstalling fan transkriptoomgegevens en unige funksjonele annotaasje
(1) SSR-analyze, CDS-foarsizzing en genstruktuer sille foarfoarme wurde.
(2) Kwantifikaasje fan unige ekspresje yn elke stekproef sil wurde útfierd.
(3) Differinsjaal útdrukte unigenen tusken samples (as groepen) sille wurde ûntdutsen basearre op unigene ekspresje
(4) Clustering, funksjonele annotaasje en ferrikingsanalyze fan differinsjaal útdrukte unigenen sille wurde útfierd
-
Lange net-kodearjen sequencing-Illumina
Lange net-kodearjende RNA's (lncRNA's) binne in soarte fan RNA-molekulen mei in lingte fan mear as 200 nt, dy't karakterisearre wurde troch ekstreem leech kodearringspotensiaal.LncRNA, as in wichtich lid yn net-kodearjende RNA's, wurdt benammen fûn yn kearn en plasma.De ûntwikkeling yn sekwinsjetechnology en bioinformtika makket identifikaasje mooglik fan tal fan nije lncRNA's en assosjearje dy mei biologyske funksjes.Akkumulative bewiis suggerearret dat lncRNA breed belutsen is by epigenetyske regeling, transkripsjeregeling en post-transkripsjeregeling.
-
Lytse RNA-sequencing-Illumina
Lyts RNA ferwiist nei in klasse fan net-kodearjende RNA-molekulen dy't normaal minder dan 200nt yn 'e lingte binne, ynklusyf mikro-RNA (miRNA), lytse ynterferinsje-RNA (siRNA), en piwi-ynteraktivearjende RNA (piRNA).
MicroRNA (miRNA) is in klasse fan endogene lyts RNA mei in lingte fan sawat 20-24nt, dy't in ferskaat oan wichtige regeljende rollen yn sellen spilet.miRNA belutsen by in protte libbensprosessen dy't weefsel - spesifyk en poadium - spesifike ekspresje iepenbierje en tige bewarre bleaun yn ferskate soarten.
-
circRNA sequencing-Illumina
CircRNA's (sirkulêre RNA's) binne ien klasse fan net-kodearjende RNA-molekulen dy't koart binne fan 5' einkap en 3' ein poly(A) sturt.CircRNAs útfiere sirkulêre struktuer troch de kovalente bân dy't status is tsjin RNA exonuclease spiisfertarring.circRNA spilet in wichtige rol yn de groei en ûntwikkeling fan organismen en harren ferset tsjin de eksterne omjouwing.
CircRNA hat in protte funksjes, dy't miRNA konkurrearjend bine kinne, de regulearjende funksje fan ceRNA útoefenje, om geneekspresje te regulearjen.De lêste jierren is ek fûn dat it nau besibbe is oan it foarkommen en ûntstean fan sykten, en hat grutte tapassingsperspektiven yn 'e rjochting fan syktediagnoazemarkers ensfh.
