Proizvodi

Illumina i BGI

Illumina tehnologija sekvenciranja, zasnovana na Sequencing by Synthesis (SBS), je globalno prihvaćena NGS inovacija, odgovorna za generiranje preko 90% podataka o sekvenciranju u svijetu.Princip SBS-a uključuje snimanje fluorescentno označenih reverzibilnih terminatora kako se svaki dNTP dodaje, a zatim se cijepa kako bi se omogućila inkorporacija sljedeće baze.Sa sva četiri reverzibilna terminator-vezana dNTP-a prisutna u svakom ciklusu sekvenciranja, prirodna konkurencija minimizira pristrasnost inkorporacije.Ova svestrana tehnologija podržava biblioteke sa jednim čitanjem i biblioteke sa uparenim krajevima, zadovoljavajući niz genomskih aplikacija.Mogućnosti visoke propusnosti i preciznost Illumina sekvenciranja postavljaju ga kao kamen temeljac u istraživanju genomike, osnažujući naučnike da razotkriju zamršenosti genoma s neusporedivim detaljima i efikasnošću.

DNBSEQ, koju je razvio BGI, je još jedna inovativna NGS tehnologija koja je uspjela dodatno smanjiti troškove sekvenciranja i povećati propusnost.Priprema DNBSEQ biblioteka uključuje fragmentaciju DNK, pripremu ssDNK i amplifikaciju kotrljajućih krugova kako bi se dobile DNK nanoloptice (DNB).Oni se zatim stavljaju na čvrstu površinu i potom sekvenciraju kombinatornom sintezom sonde i sidra (cPAS).

Naša usluga sekvenciranja unapred napravljenih biblioteka olakšava klijentima da pripreme svoje biblioteke sekvenciranja iz različitih izvora (mRNA, celi genom, amplikon, između ostalog).Nakon toga, ove biblioteke mogu biti isporučene u naše centre za sekvenciranje radi kontrole kvaliteta i sekvenciranja na Illumina ili BGI platformama.

Kontaktiraj nas

Detalji usluge

Demo rezultat

Karakteristike

●platforme:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten i BGI-DNB-T7

●Načini sekvenciranja:PE50, PE100, PE150, PE250

●Kontrola kvaliteta biblioteka prije sekvenciranja

●Slijed isporuke podataka i QC:isporuka QC izvještaja i neobrađenih podataka u fastq formatu nakon demultipleksiranja i filtriranja Q30 čitanja.

Prednosti usluge

●Svestranost usluga sekvenciranja:kupac može izabrati sekvencu po traci, protočnoj ćeliji ili količini podataka.

●Svestranost platformi:DNB biblioteke se mogu prenijeti na Illumina platforme

●Veliko iskustvo na Illumina platformi za sekvenciranje:sa hiljadama zatvorenih projekata sa raznim vrstama.

●Isporuka sekvencioniranog QC izvještaja:sa metrikom kvaliteta, preciznošću podataka i ukupnim performansama projekta sekvenciranja.

●Proces zrelog sekvenciranja:sa kratkim vremenom obrta.

●Rigorozna kontrola kvaliteta: implementiramo stroge zahtjeve za kontrolu kvalitete kako bismo garantirali isporuku konzistentno visokokvalitetnih rezultata.

Zahtjevi za uzorke*

Djelomično sekvenciranje traka

Količina podataka (X)	Koncentracija (qPCR/nM)	Volume
X ≤ 50 Gb	≥ 2 nM	≥ 20 μl
50 Gb ≤ X < 100 Gb	≥ 3 nM	≥ 20 μl
X ≥ 100 Gb	≥ 4 nM	≥ 20 μl

Jedna traka (Illumina)

Platforma	Koncentracija (qPCR/nM)	Volume
HiSeq X Ten	≥ 2 nM	≥ 20 μl
NovaSeq 6000 SP	≥ 1 nM	≥ 25 μl
NovaSeq 6000 S4	≥ 1,5 nM	≥ 25 μl
NovaSeq X	≥ 1,5 nM	≥ 25 μl
BGI-DNBSEQ-T7	≥ 1,5 nM	≥ 25 μl

Pored koncentracije i ukupne količine, potreban je i odgovarajući uzorak pikova.

Obratite nam se ako vaši uzorci ne ispunjavaju zahtjeve za početni materijal.

Kontaktiraj nas

Service Workflow

Kontrola kvaliteta biblioteke

Sekvenciranje

Kontrola kvaliteta podataka

Isporuka projekta

Prethodno: DNK/RNA sekvenciranje -PacBio Sequencer

Sljedeći: DNK/RNA sekvenciranje – Nanopore sekvencer

Izvještaj o kontroli kvalitete biblioteke

Izvještaj o kvalitetu biblioteke daje se prije sekvenciranja, procjene količine biblioteke i fragmentacije.

Sekvenciranje QC izvještaja

Tabela 1. Statistike podataka o sekvenciranju.

ID uzorka	BMKID	Sirova čitanja	Sirovi podaci (bp)	Čista očitavanja (%)	Q20(%)	Q30(%)	GC(%)
C_01	BMK_01	22,870,120	6,861,036,000	96.48	99.14	94.85	36.67
C_02	BMK_02	14,717,867	4,415,360,100	96,00	98.95	93.89	37.08