Heatmap
Datoteka matričnih podataka se koristi za crtanje toplotne karte, koja može filtrirati, normalizirati i grupirati matrične podatke.Uglavnom se koristi za klaster analizu nivoa ekspresije gena između različitih uzoraka.
Gene Annotation
Anotacija genske funkcije se vrši mapiranjem sekvenci u FASTA datoteci prema različitim bazama podataka.
Gene Annotation
Osnovni alat za pretraživanje lokalnog poravnanja
CDS_UTR_Prediction
Ovaj alat je dizajniran za predviđanje kodirajućih regiona (CDS) i nekodirajućih regiona (UTR) u datim sekvencama transkripta na osnovu eksplozije prema poznatoj bazi proteina i ORF predviđanju.
Manhattan Plot
Manhattan plot omogućava prikaz podataka sa velikim brojem tačaka podataka.Obično se koristi u studijama asocijacija na nivou genoma (GWAS).
Circos
CIRCOS dijagram omogućava direktnu prezentaciju SNP, InDeL, SV, CNV distribucija na genomu.
GO_Obogaćivanje
TopGO je alat dizajniran za funkcionalno obogaćivanje.TopGO-Bioconductor paket se sastoji od analize diferencijalne ekspresije, analize GO obogaćivanja i vizualizacije rezultata.On će generisati folder sa izlazom pod nazivom "Graf", koji sadrži rezultate za topGO_BP, topGO_CC i topGO_MF.
WGCNA
WGCNA je široko korištena metoda rudarenja podataka za otkrivanje modula koekspresije gena.Primjenjiv je na različite skupove podataka o ekspresiji, uključujući podatke o mikromrežama i podatke o ekspresiji gena koji potiču iz sekvenciranja sljedeće generacije.
InterProScan
InterPro analiza sekvenci proteina i klasifikacija
GO_KEGG_Obogaćivanje
Ovaj alat je dizajniran da generiše histogram obogaćivanja GO, histogram obogaćivanja KEGG i put obogaćivanja KEGG na osnovu datog skupa gena i odgovarajuće napomene.