page_head_bg

produkty

Sekvenování eukaryotické mRNA-Illumina

Sekvenování mRNA umožňuje profilování všech mRNA transkriptovaných z buněk za specifických podmínek.Je to výkonná technologie pro odhalení profilu genové exprese, genových struktur a molekulárních mechanismů určitých biologických procesů.K dnešnímu dni bylo sekvenování mRNA široce využíváno v základním výzkumu, klinické diagnostice, vývoji léků atd.

Platforma: Illumina NovaSeq 6000


Podrobnosti o službě

Bioinformatika

Výsledky ukázky

Výhody

ØZkušení: V BMK bylo zpracováno více než 200 000 vzorků pokrývajících různé typy vzorků, včetně buněčné kultury, tkáně, tělesné tekutiny atd. a více než 7 000 projektů mRNA-Seq pokrývajících různé oblasti výzkumu bylo uzavřeno.

ØPřísný systém kontroly kvality: Základní body kontroly kvality ve všech krocích včetně přípravy vzorků, přípravy knihovny, sekvenování a bioinformatiky jsou pečlivě sledovány, aby bylo možné poskytovat vysoce kvalitní výsledky.

ØK dispozici je více databází pro anotaci funkcí a studie obohacování pro splnění různých výzkumných cílů.

ØPoprodejní služby: Poprodejní služby platné 3 měsíce po dokončení projektu, včetně sledování projektů, řešení problémů, dotazů a odpovědí na výsledky atd.

Vzorové požadavky a dodání

Knihovna Strategie sekvenování Doporučené údaje Kontrola kvality
Obohaceno o Poly A Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85 %

Vzorové požadavky:

Nukleotidy:

Čistota Integrita Množství
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Omezená nebo žádná kontaminace proteiny nebo DNA na gelu. Pro rostliny: RIN≥6,5;Pro zvířata: RIN≥7;28S/18S≥1,0;omezená nebo žádná základní elevace Konc.>30 ng/μl;Objem ≥ 10 μl;Celkem ≥ 1,5 μg

Tkáň: Hmotnost (suchá):≥1 g
*Pro tkáň menší než 5 mg doporučujeme zaslat vzorek tkáně bleskově zmrazený (v tekutém dusíku).

Buněčná suspenze:Počet buněk = 3×106- 1×107
*Doporučujeme zasílat zmrazený buněčný lyzát.V případě, že počet buněk je menší než 5×105, doporučuje se bleskově zmrazit v tekutém dusíku, což je vhodnější pro mikroextrakce.

Vzorky krve:Objem≥1 ml

Mikroorganismus:Hmotnost ≥ 1 g

Doporučené doručení vzorku

Nádoba: 2 ml centrifugační zkumavka (nedoporučuje se cínová fólie)

Označení vzorků: Skupina+replikace např. A1, A2, A3;B1, B2, B3......

Náklad:

  1. Suchý led: Vzorky je třeba zabalit do sáčků a zahrabat do suchého ledu.
  2. Zkumavky RNAstable: Vzorky RNA lze sušit ve zkumavce pro stabilizaci RNA (např. RNAstable®) a přepravovat při pokojové teplotě.

Tok servisní práce

logo_01

Návrh experimentu

logo_02

Vzorová dodávka

logo_03

Extrakce RNA

logo_04

Stavba knihovny

logo_05

Sekvenování

logo_06

Analýza dat

logo_07

Poprodejní služby


  • Předchozí:
  • Další:

  • Bioinformatika

    2(1)

    Eukaryotické Pracovní postup analýzy sekvenování mRNA

    Bioinformatika

    ØKontrola kvality nezpracovaných dat

    ØReferenční zarovnání genomu

    ØAnalýza struktury přepisu

    ØKvantifikace exprese

    ØAnalýza diferenciální exprese

    ØAnotace a obohacení funkce

    1.Křivka saturace dat mRNA

    3(1)

    2.Diferenciální expresní analýza-Vulcano plot

    4(1)

    3.Anotace KEGG na stupních

    5(1)

    4.GO klasifikace na stupních

    6(1)

    získat cenovou nabídku

    Zde napište svou zprávu a pošlete nám ji

    Pošlete nám svou zprávu: