-
Jednojaderné sekvenování RNA
Pokrok v zachycování jedné buňky a technika konstrukce individuální knihovny v kombinaci s vysoce výkonným sekvenováním umožňuje studie genové exprese na bázi buňky po buňce.Umožňuje hlubší a kompletní systémovou analýzu komplexních buněčných populací, ve které se do značné míry vyhne maskování jejich heterogenity tím, že se vezme průměr ze všech buněk.
Některé buňky však nejsou vhodné pro výrobu jednobuněčné suspenze, takže jsou nutné jiné způsoby přípravy vzorků – extrakce jádra z tkání, to znamená, že jádro je přímo extrahováno z tkání nebo buňky a připraveno na jednojadernou suspenzi pro jedno- sekvenování buněk.
BMK poskytuje službu sekvenování jednobuněčné RNA na bázi 10× Genomics ChromiumTM.Tato služba byla široce používána ve studiích studií souvisejících s nemocemi, jako je diferenciace imunitních buněk, heterogenita nádorů, vývoj tkání atd.
Prostorový transkriptomový čip: 10× Genomics
Platforma: Illumina NovaSeq Platform
-
Prostorový přepis BMKMANU S1000
Prostorová transkriptomika stojí v popředí vědeckých inovací a umožňuje výzkumníkům ponořit se do složitých vzorců genové exprese v tkáních při zachování jejich prostorového kontextu.Mezi různými platformami vyvinul BMKGene prostorový transkriptomový čip BMKManu S1000, který se může pochlubitvylepšené rozlišení5 uM, dosahující subcelulárního rozsahu a umožňujícívíceúrovňové nastavení rozlišení.Čip S1000, obsahující přibližně 2 miliony bodů, využívá mikrojamky povrstvené kuličkami naplněnými prostorově čárovými snímacími sondami.Z čipu S1000 je připravena knihovna cDNA obohacená o prostorové čárové kódy a následně sekvenována na platformě Illumina NovaSeq.Kombinace prostorově kódovaných vzorků a UMI zajišťuje přesnost a specifičnost generovaných dat.Jedinečná vlastnost čipu BMKManu S1000 spočívá v jeho všestrannosti, která nabízí víceúrovňové nastavení rozlišení, které lze jemně vyladit pro různé tkáně a úrovně detailů.Tato přizpůsobivost řadí čip jako vynikající volbu pro různé studie prostorové transkriptomiky, což zajišťuje přesné prostorové shlukování s minimálním šumem.
Pomocí čipu BMKManu S1000 a dalších technologií prostorové transkriptomiky mohou výzkumníci lépe porozumět prostorové organizaci buněk a komplexním molekulárním interakcím, které se vyskytují v tkáních, a poskytnout neocenitelný pohled na mechanismy, které jsou základem biologických procesů v široké škále oborů, včetně onkologie, neurovědy, vývojová biologie, imunologie a botanická studia.
Platforma: čip BMKManu S1000 a Illumina NovaSeq
-
10x prostorový transkriptom Genomics Visium
Prostorová transkriptomika je špičková technologie, která umožňuje výzkumníkům zkoumat vzorce genové exprese v tkáních při zachování jejich prostorového kontextu.Jednou z výkonných platforem v této doméně je 10x Genomics Visium spojené se sekvenováním Illumina.Princip 10X Visium spočívá na specializovaném čipu s určenou záchytnou oblastí, kam jsou umístěny tkáňové řezy.Tato záchytná oblast obsahuje body s čárovým kódem, z nichž každý odpovídá jedinečnému prostorovému umístění v tkáni.Zachycené molekuly RNA z tkáně jsou pak během procesu reverzní transkripce označeny jedinečnými molekulárními identifikátory (UMI).Tyto čárové kódy a UMI umožňují přesné prostorové mapování a kvantifikaci genové exprese v rozlišení jedné buňky.Kombinace prostorově kódovaných vzorků a UMI zajišťuje přesnost a specifičnost generovaných dat.Pomocí této technologie prostorové transkriptomiky mohou výzkumníci získat hlubší pochopení prostorové organizace buněk a komplexních molekulárních interakcí vyskytujících se v tkáních, což nabízí neocenitelný pohled na mechanismy, které jsou základem biologických procesů v mnoha oblastech, včetně onkologie, neurověd, vývojové biologie, imunologie. a botanické studie.
Platforma: 10X Genomics Visium a Illumina NovaSeq
