Prostorový přepis BMKMANU S1000
Technické schéma prostorového transkriptomu BMKMANU S1000
Výhody BMKMANU S1000
1) Subcelulární rozlišení: Každá zachycená oblast obsahovala >2 miliony prostorových čárových kódů o průměru 2,5 µm a rozestupem 5 µm mezi středy skvrn, což umožňuje analýzu prostorového transkriptomu se subcelulárním rozlišením (5 µm).
2) Víceúrovňová analýza rozlišení: Flexibilní víceúrovňová analýza v rozsahu od 100 μm do 5 μm pro rozlišení různých vlastností tkáně při optimálním rozlišení.
3) Komplexní profilování transkriptomu: Lze analyzovat transkripty zachycené z celého tkáňového sklíčka bez omezení počtu cílových genů a cílové oblasti.
Specifikace služby
| Knihovna | Strategie sekvenování | Doporučený výstup dat |
| Knihovna cDNA S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb/vzorek |
Vzorové požadavky
| Vzorek | Číslo | Velikost | Kvalita RNA |
| OCT zapuštěný tkáňový blok | 2-3 bloky/vzorek | Cca.6,8x6,8x6,8 mm3 | RIN≥7 |
Chcete-li získat další podrobnosti o pokynech pro přípravu vzorků a pracovním postupu služeb, neváhejte se obrátit na aExpert BMKGENE
Tok servisní práce
Návrh experimentu
Vzorová dodávka
Předexperiment
Prostorové čárové kódování
Stavba knihovny
Sekvenování
Analýza dat
Poprodejní služby
Data generovaná BMKMANU S1000 jsou analyzována pomocí softwaru „BSTMatrix“, který je nezávisle navržen společností BMKGENE, včetně:
1) Generování matice genové exprese
2) HE zpracování obrazu
3) Kompatibilní s navazujícím softwarem třetích stran pro analýzu
4) Online „BSTViewer“ pomáhá získat výsledky vizualizace v různých rozlišeních.
1.Shlukování skvrn
2.Prostorová distribuce
Npoznámka: Rozlišeníúroveň=13 (100 um, vlevo, odjet); 7 (50 um, že jo)
3. Tepelná mapa shlukování výrazu markerů
4.Mezivzorková analýza dat
