● Deplece rRNA následuje příprava knihovny směrové mRNA.
● Sekvenování na Illumina Novaseq.
●Studujte změny složitých mikrobiálních komunit:K tomu dochází na transkripční úrovni a prozkoumat potenciální nové geny.
●Vysvětlení interakcí s mikrobiální komunitou s hostitelem nebo prostředím.
●Komplexní bioinformatická analýza: To poskytuje poznatky o komunitních taxonomických a funkčních kompozicích, jakož i analýze diferenciální genové exprese.
●Rozsáhlá anotace genu:Použití aktuálních databází genových funkcí pro informační informace o expresi genu mikrobiálních komunit.
●Podpora po prodeji:Náš závazek přesahuje dokončení projektu s 3měsíční obdobím servisního období. Během této doby nabízíme sledování projektů, pomoc při řešení problémů a sezení otázek a odpovědí k řešení jakýchkoli dotazů souvisejících s výsledky.
Sekvenční platforma | Sekvenční strategie | Doporučená data | Kontrola kvality dat |
Illumina Novaseq | PE150 | 12 GB | Q30≥85% |
Koncentrace (ng/µl) | Celková částka (µg) | Svazek (µl) | OD260/280 | OD260/230 | Rin |
≥ 50 | ≥1,0 | ≥ 20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6,5 |
Zahrnuje následující analýzu:
● Řízení kvality dat sekvenování
● Sestava přepisu
● Taxonomická anotace a hojnost
● Funkční anotace a hojnost
● Kvantifikace exprese a diferenciální analýza
Taxonomické rozdělení každého vzorku:
Analýza rozmanitosti beta: UPGMA
Funkční anotace - Go hojnost
Hojnost diferenciální taxonomie - Lefse
Prozkoumejte pokroky usnadněné službami sekvenování meta transkriptomiky BMKGene prostřednictvím kurátorské sbírky publikací.
Lu, Z. a kol. (2023) „Tolerance kyseliny využívající bakterie řádových bakterií bakteroidales přispívá k prevenci ruminovy acidózy u koz přizpůsobených vysoce soustředěné stravě“, “,Výživa zvířat, 14, str. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) „Rozmotající jádro funkční mikrobiota v tradiční fermentaci pevného stavu pomocí vysoce výkonných amplikonů a metterranscriptomického sekvenování“,, “,Hranice v mikrobiologii, 8 (Jul). doi: 10,3389/fmicb.2017.01294/full.
Wang, W. a kol. (2022) „Nové mykoviry objevené z metranscriptomického průzkumu fytopatogenní houby alternaria“,Viry, 14 (11), str. 2552. DOI: 10,3390/V14112552/S1.
Wei, J. a kol. (2022) „Paralelní analýza meatranscriptomu odhaluje degradaci rostlinných sekundárních metabolitů brouky a jejich střevními symbionty“,Molekulární Ekologie, 31 (15), str. 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.