条形 banner-03

Produkty

Sekvenování celého lidského exomu

Sekvenování celého lidského exomu (hWES) je široce uznáváno jako cenově efektivní a účinný sekvenční přístup k přesnému určení mutací způsobujících onemocnění. Přestože exony tvoří pouze asi 1,7 % celého genomu, hrají klíčovou roli tím, že přímo odrážejí profil celkových funkcí proteinů. Je pozoruhodné, že v lidském genomu se více než 85 % mutací souvisejících s onemocněními projevuje v oblastech kódujících proteiny. BMKGENE nabízí komplexní a flexibilní službu sekvenování celého lidského exomu se dvěma různými strategiemi zachycení exonů, které jsou k dispozici pro splnění různých výzkumných cílů.


Podrobnosti o službě

Výsledky dema

Funkce služby

● K dispozici jsou dva exomové panely založené na obohacení cíle sondami: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) a xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sekvenování na přístroji Illumina NovaSeq.

● Bioinformatický kanál zaměřený na analýzu onemocnění nebo nádorů.

Výhody služby

Cílí na oblast kódující proteinyZachycením a sekvenováním oblastí kódujících proteiny se hWES využívá k odhalení variant souvisejících se strukturou proteinů.

Cenově výhodné:hWES poskytuje přibližně 85 % mutací spojených s lidským onemocněním z 1 % lidského genomu.

Vysoká přesnostDíky vysoké hloubce sekvenování usnadňuje hWES detekci jak běžných, tak i vzácných variant s četností nižší než 1 %.

Přísná kontrola kvalityVe všech fázích, od přípravy vzorků a knihoven až po sekvenování a bioinformatiku, implementujeme pět základních kontrolních bodů. Toto pečlivé monitorování zajišťuje konzistentně vysoce kvalitní výsledky.

Komplexní bioinformatická analýzaNáš výzkumný program jde nad rámec pouhé identifikace variací referenčního genomu, protože zahrnuje pokročilou analýzu navrženou tak, aby konkrétně řešila výzkumné otázky týkající se genetických aspektů onemocnění nebo analýzy nádorů.

Poprodejní podpora:Náš závazek sahá i nad rámec dokončení projektu a zahrnuje 3měsíční poprodejní servis. Během této doby nabízíme následnou péči o projekt, pomoc s řešením problémů a diskuze s otázkami a odpověďmi, kde zodpovíme veškeré dotazy týkající se výsledků.

Ukázkové specifikace

Strategie zachycení exonů

Strategie sekvenování

Doporučený výstup dat

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

nebo xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5–10 GB

Pro Mendelovy poruchy/vzácná onemocnění: > 50x

Pro vzorky nádorů: ≥ 100x

Požadavky na vzorek

Typ vzorku

 

 Množství(Qubit®)

 

Koncentrace 

Objem

 

 

 Čistota (NanoDrop™)

 

Genomová DNA

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μl
≥ 15 μl
 
OD260/280=1,8-2,0
 
žádná degradace, žádná kontaminace

 

Bioinformatika

Pracovní postup WES_BI_Nemoc-01

Bioinformatická analýza vzorků s hWES-onemocněním zahrnuje:

● Kontrola kvality sekvenčních dat

● Zarovnání referenčního genomu

● Identifikace SNP a InDels

● Funkční anotace SNP a InDels

Pracovní postup WES_BI_Tumor-01

Bioinformatická analýza vzorků nádorů zahrnuje:

● Kontrola kvality sekvenčních dat

● Zarovnání referenčního genomu

● Identifikace SNP, InDels a somatických variací

● Identifikace variant zárodečné linie

● Analýza mutačních signatur

● Identifikace genů pro správu genů na základě mutací se ziskem funkce

● Anotace mutací na úrovni citlivosti na léky

● Analýza heterogenity – výpočet čistoty a ploidie

Pracovní postup služby

dodání vzorku

Dodání vzorku

Pilotní experiment

Extrakce DNA

Příprava knihovny

Výstavba knihovny

Sekvenování

Sekvenování

Analýza dat

Analýza dat

数据上传-01

Doručování dat

Poprodejní služby

Poprodejní služby


  • Předchozí:
  • Další:

  • Kontrola kvality dat – Statistika zachycení exomu

     

    wps_doc_22

     

    Identifikace variant – InDels

    Číslo 36

    Pokročilá analýza: identifikace a distribuce škodlivých SNP/InDels – Circos plot

     

    Číslo 37

    Analýza nádorů: identifikace a distribuce somatických mutací – Circos plot

     

    Číslo 38

     

    Analýza nádorů: klonální linie

     

    Číslo 39

     

    získat cenovou nabídku

    Napište sem svou zprávu a odešlete nám ji

    Pošlete nám svou zprávu: