Resekvenování celého genomu bakterií a hub
Projekty resekvenování celého genomu bakterií a hub jsou klíčové pro pokrok v mikrobiální genomice, protože umožňují dokončení a porovnání mikrobiálních genomů. To usnadňuje fermentační inženýrství, optimalizaci průmyslových procesů a zkoumání sekundárních metabolických drah. Resekvenování hub a bakterií je navíc klíčové pro pochopení adaptace na prostředí, optimalizaci kmenů a odhalení dynamiky genetické evoluce s širokými důsledky v medicíně, zemědělství a environmentálních vědách.
Výhody služby
●Bioinformatická analýza zahrnuje volání variant:Poskytování funkčních poznatků o resekvenovaných genomech.
● Rozsáhlé odborné znalostiS tisíci projekty mikrobiálního resekvenování, které provádíme každoročně, nabízíme více než deset let zkušeností, vysoce kvalifikovaný analytický tým, komplexní obsah a vynikající poprodejní podporu.
●Poprodejní podpora:Náš závazek sahá i nad rámec dokončení projektu a zahrnuje 3měsíční poprodejní servis. Během této doby nabízíme následnou podporu projektu, pomoc s řešením problémů a diskuze s otázkami a odpověďmi, kde zodpovíme veškeré dotazy týkající se výsledků.
Specifikace služby
| Sekvenční platforma | Strategie sekvenování | Doporučená data | Kontrola kvality |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Hloubka 100x | Q30≥85% |
Požadavky na vzorek
| Koncentrace (ng/µL) | Celkové množství (ng) | Objem (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterie: ≥1x107 buňky
Jednobuněčné houby: ≥5x106-1x107 buňky
Makro houby: ≥4 g
Pracovní postup služby
Dodání vzorku
Výstavba knihovny
Sekvenování
Analýza dat
Poprodejní služby
Zahrnuje následující analýzu:
- Kontrola kvality sekvenčních dat
- Zarovnání s referenčním genomem
- Variantní volání: SNP a InDel
- Anotace varianty
Volání variant: typy SNP
Volání variant: Distribuce délek InDel
Prozkoumejte pokroky, které umožnily služby BMKGene v oblasti resekvenování mikrobiálního genomu, prostřednictvím kurátorsky uspořádané kolekce publikací.
Jia, Y. a kol. (2023) „Kombinace transkriptomu a resekvenování celého genomu pro screening genů rezistence vůči chorobám u trpasličího pšeničného strnadu“,Mezinárodní časopis molekulárních věd, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. a kol. (2023) „Ampicilinem řízený metabolismus glukózy manipuluje s přechodem od tolerance k rezistenci u bakterií“,Vědecké pokroky, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. a kol. (2022) „Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., haloalkalifilní bakterie izolovaná ze sodového jezera v autonomní oblasti Vnitřní Mongolsko v Číně“, Int. J. Syst. Evol.Mikrobiologie, 72, str. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. a Wang, G.-H. (2024) „Genomomatická sekvence Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, izolovaného z Nasonia vitripennis“,Oznámení o mikrobiologických zdrojích. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
