Single-nucleus RNA Sequencing

De Fortschrëtt bei der Erfaassung vun eenzel Zellen an individueller Bibliothéikskonstruktiounstechnik kombinéiert mat High-Throughput-Sequenzéierung erlaabt Genausdrockstudien op Zell-vun-Zell Basis.Et erméiglecht eng méi déif a komplett Systemanalyse op komplexe Zellpopulatiounen, an där et gréisstendeels d'Maskéierung vun hirer Heterogenitéit vermeit andeems en Duerchschnëtt vun all Zellen hëlt.

Wéi och ëmmer, e puer Zellen sinn net gëeegent fir an Eenzell-Suspension gemaach ze ginn, sou datt aner Probepräparatiounsmethoden - Nukleusextraktioun aus Tissue sinn néideg, dat heescht, de Kär gëtt direkt aus Stoffer oder Zelle extrahéiert an an Single-Nukleussuspension virbereet fir Single- Zell Sequenzéierung.

BMK stellt 10 × Genomics Chromium TM baséiert Single-Zell RNA Sequencing Service.Dëse Service gouf wäit an Studien iwwer Krankheet-relatéiert Studien benotzt, sou wéi Immunzelldifferenzéierung, Tumorheterogenitéit, Tissuentwécklung, etc.

Raimlech Transkriptom Chip: 10 × Genomics

Plattform: Illumina NovaSeq Plattform

Kontaktéiert eis

Service Detailer

Bioinformatik

Demo Resultater

Technesch Prinzip

D'Isolatioun vu Käre gëtt erreecht duerch 10 × Genomics Chromium TM, deen aacht-Kanal Mikrofluidiksystem mat Duebele Kräizungen besteet.An dësem System sinn e Gelpärelen mat Barcoden a Primer, Enzymen an engem eenzegen Kär an Nanoliter-Gréisst Uelegdrop verschlësselt, wat Gel Bead-in-Emulsion (GEM) generéiert.Eemol GEM geformt sinn, Zell Lysis a Verëffentlechung vun Barcodes ginn an all GEM duerchgefouert.mRNA ginn ëmgedréint an cDNA-Moleküle mat 10 × Barcoden an UMI transkribéiert, déi weider ënner Standard Sequenzéierungsbibliothéikskonstruktioun ënnerleien.

Tissue net gëeegent fir eenzel Zell Suspension Virbereedung

Zell / Tissue	Grond
Onfrësch gefruer Tissu	Kann net frësch oder laang gespäichert Organisatiounen kréien
Muskelzellen, Megakaryozyten, Fett ...	Zell Duerchmiesser ass ze grouss fir an d'Instrument anzeginn
Liewer…	Ze fragil fir ze briechen, net fäeg eenzel Zellen z'ënnerscheeden
Neuron Zell, Gehir…	Méi sensibel, einfach ze stressen, wäert d'Sequenzéierungsresultater änneren
Bauchspaicheldrüs, Schilddrüs ...	Räich un endogenen Enzymen, déi d'Produktioun vun enger eenzeger Zellsuspension beaflossen

Single-Nukleus vs Single-Zell

Eenzelkär	Eenzelzell
Onlimitéiert Zell Duerchmiesser	Zell Duerchmiesser: 10-40 μm
D'Material kann gefruer Tissue ginn	D'Material muss frësch Tissue sinn
Niddereg Stress vu gefruerenen Zellen	Enzymbehandlung kann Zellstressreaktioun verursaachen
Keng rout Bluttzellen mussen ewechgeholl ginn	Rout Bluttzellen musse geläscht ginn
Nuklear dréckt Bioinformatioun aus	Déi ganz Zell dréckt Bioinformatioun aus