-
Metagenomic Sequencing -NGS
E Metagenom ass eng Sammlung vum Gesamtgenetesch Material vun enger gemëschter Gemeinschaft vun Organismen, sou wéi Ëmwelt- a mënschlech Metagenome. Et enthält Genome vu béid kultivéierbaren an onkultivéierbare Mikroorganismen. Shotgun metagenomesch Sequenzéierung mat NGS erméiglecht d'Studie vun dësen komplizéierte genomesche Landschaften, déi an Ëmweltproben agebonne sinn, andeems se méi wéi taxonomesch Profiléierung ubidden, och granulär Abléck an Arten Diversitéit, Iwwerfloss Dynamik, a komplex Bevëlkerungsstrukturen. Zousätzlech zu taxonomesche Studien, bitt Shotgun Metagenomics och eng funktionell Genomik Perspektiv, déi d'Exploratioun vu kodéierte Genen an hir putative Rollen an ökologesche Prozesser erméiglecht. Schlussendlech dréit d'Grënnung vu Korrelatiounsnetzwierker tëscht geneteschen Elementer an Ëmweltfaktoren zu engem holistesche Verständnis vun der komplizéierter Zesummespill tëscht mikrobiellen Gemeinschaften an hirem ökologeschen Hannergrond bäi. Als Schlussfolgerung steet metagenomesch Sequenzéierung als e pivotal Instrument fir d'genomesch Intricacies vun diversen mikrobiellen Gemeinschaften z'entdecken, déi villsäiteg Bezéiungen tëscht Genetik an Ökologie an dëse komplexe Ökosystemer beliichten.
Plattformen: Illumina NovaSeq an DNBSEQ-T7
-
Metagenomic Sequencing-TGS
E Metagenom ass eng Sammlung vum genetesche Material vun enger gemëschter Gemeinschaft vun Organismen, sou wéi Ëmwelt- a mënschlech Metagenome. Et enthält Genome vu béid kultivéierbaren an onkultivéierbare Mikroorganismen. Metagenomesch Sequenzéierung erméiglecht d'Studie vun dësen komplizéierte genomesche Landschaften, déi an ökologesche Proben agebonne sinn, andeems se méi wéi taxonomesch Profiler ubidden. Et bitt och eng funktionell Genomik Perspektiv andeems se déi kodéiert Genen an hir putativ Rollen an Ëmweltprozesser exploréieren. Wärend traditionell Gewier Approche mat Illumina Sequencing wäit an metagenomesche Studien benotzt goufen, hunn d'Entstoe vu Nanopore a PacBio laang gelies Sequencing d'Feld geännert. Nanopore a PacBio Technologie verbesseren downstream bioinformatesch Analysen, notamment Metagenome Assemblée, fir méi kontinuéierlech Versammlungen ze garantéieren. Berichter weisen datt Nanopore-baséiert a PacBio-baséiert Metagenomics erfollegräich komplett a zougemaach bakteriell Genome vu komplexe Mikrobiome generéiert hunn (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). D'Integratioun vun Nanopore Liesungen mat Illumina Reads bitt eng strategesch Approche fir Feelerkorrektur, wat dem Nanopore seng inherent niddereg Genauegkeet reduzéiert. Dës synergistesch Kombinatioun profitéiert d'Stäerkte vun all Sequenzéierungsplattform, bitt eng robust Léisung fir potenziell Aschränkungen ze iwwerwannen an d'Präzisioun an d'Zouverlässegkeet vu metagenomeschen Analysen ze förderen.
Plattform: Nanopore PromethION 48, Illumia a PacBio Revio
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
D'16S an 18S rRNA Genen, zesumme mat der Internal Transcribed Spacer (ITS) Regioun, déngen als pivotal molekulare Fangerofdrockmarker wéinst hirer Kombinatioun vun héich konservéierten an hypervariablen Regiounen, wat se wäertvoll Tools mécht fir prokaryotesch an eukaryotesch Organismen ze charakteriséieren. Amplifikatioun an Sequenzéierung vun dëse Regioune bidden eng Isolatiounsfräi Approche fir d'mikrobial Zesummesetzung an Diversitéit iwwer verschidden Ökosystemer z'ënnersichen. Wärend Illumina Sequencing typesch kuerz hypervariabel Regioune wéi V3-V4 vun 16S an ITS1 zielt, gouf bewisen datt eng super taxonomesch Annotatioun erreechbar ass andeems se déi ganz Längt vun 16S, 18S, an ITS Sequenzéieren. Dës ëmfaassend Approche féiert zu méi héije Prozentsaz vu präzis klasséierte Sequenzen, fir e Resolutiounsniveau z'erreechen deen sech op d'Aartidentifikatioun erstreckt. PacBio's Single-Molecule Real-Time (SMRT) Sequenzéierungsplattform steet eraus andeems se héich präzis laang Liesungen (HiFi) ubidden, déi d'Volllängt Ampliconen ofdecken, mat der Präzisioun vun der Illumina Sequencing rivaliséieren. Dës Fäegkeet erlaabt d'Fuerscher en onvergläichleche Virdeel ze erreechen - eng Panoramavue vun der genetescher Landschaft. Déi erweidert Ofdeckung erhéicht d'Resolutioun an der Speziesannotatioun wesentlech, besonnesch a bakteriellen oder Pilzgemeinschaften, wat e méi déif Verständnis vun de Schwieregkeete vu mikrobiellen Populatiounen erméiglecht.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Amplicon Sequenzéierung mat Illumina Technologie, speziell op d'16S, 18S, an ITS genetesch Marker gezielt, ass eng mächteg Method fir d'Phylogenie, d'Taxonomie, an d'Arten Heefegkeet bannent mikrobielle Gemeinschaften z'entdecken. Dës Approche implizéiert d'Sequenzéierung vun den hypervariablen Regiounen vun Haushaltsgeneteschen Marker. Ursprénglech agefouert als molekulare Fangerofdrock vunWoesen et alan 1977, dëser Technik huet microbiome profiling revolutionéiert vun Isolatioun-gratis Analysen. Duerch d'Sequenzéierung vun 16S (Bakterien), 18S (Pilze), an Internal Transcribed Spacer (ITS, Pilze), kënnen d'Fuerscher net nëmmen reichend Arten identifizéieren, awer och selten an onidentifizéierter. Breet ugeholl als pivotal Tool, Amplicon Sequenzéierung ass instrumental ginn fir differenziell mikrobielle Kompositioune iwwer verschidden Ëmfeld ze erkennen, dorënner de mënschleche Mond, Darm, Hocker, an doriwwer eraus.
-
Bakteriell a Pilz ganz Genom Re-Sequencing
Bakteriell a Pilz Ganzgenom Re-Sequenzéierungsprojete si pivotal fir mikrobiell Genomik ze förderen andeems se d'Réalisatioun an de Verglach vu mikrobiellen Genomen erméiglechen. Dëst erliichtert Fermentatiounstechnik, d'Optimiséierung vun industrielle Prozesser, an d'Exploratioun vu sekundäre Metabolismusweeër. Ausserdeem ass Pilz a bakteriell Re-Sequenzéierung entscheedend fir d'Ëmweltadaptatioun ze verstoen, Stämme optimiséieren an d'genetesch Evolutiounsdynamik z'entdecken, mat breet Implikatiounen an der Medizin, der Landwirtschaft an der Ëmweltwëssenschaft.
-
Prokaryotesch RNA Sequencing
RNA Sequencing erméiglecht déi ëmfaassend Profiléierung vun all RNA Transkriptiounen bannent Zellen ënner spezifesche Bedéngungen. Dës opzedeelen Technologie déngt als e mächtegt Tool, enthüllt komplizéiert Genausdrockprofiler, Genstrukturen a molekulare Mechanismen verbonne mat diverse biologesche Prozesser. Breet ugeholl an fundamental Fuerschung, klinescher Diagnostik, an Drogenentwécklung, RNA Sequencing bitt Abléck an d'Intricacies vun der cellulärer Dynamik an der genetescher Reguléierung. Eis prokaryotesch RNA Probe Veraarbechtung ass fir prokaryotesch Transkriptomen ugepasst, involvéiert rRNA Ausarmung a Richtungsbibliothéik Virbereedung.
Plattform: Illumina NovaSeq
-
Metatranskriptom Sequenzéierung
Mat Hëllef vun Illumina Sequencing Technologie, BMKGENE's Metatranscriptome Sequencing Service enthüllt den dynamesche Genausdrock vun enger diverser Palette vu Mikroben, spannen Eukaryoten op Prokaryoten a Viren, bannent natierlechen Ëmfeld wéi Buedem, Waasser, Mier, Hocker, an den Darm. Eise ëmfaassende Service erlaabt d'Fuerscher sech a komplexe mikrobielle Gemeinschaften komplett Genausdrockprofiler ze verdéiwen. Nieft der taxonomescher Analyse erliichtert eise Metatranskriptom Sequenzéierungsservice d'Erfuerschung a funktionell Beräicherung, léisst d'Liicht op differenziell ausgedréckte Genen an hir Rollen. Entdeckt e Räichtum vu biologeschen Abléck wéi Dir déi komplex Landschafte vum Genausdrock, taxonomescher Diversitéit, a funktioneller Dynamik an dësen verschiddenen Ëmweltnische navigéiert.
-
De novo Fungal Genome Assemblée
BMKGENE bitt villsäiteg Léisunge fir Pilzgenomen, këmmere sech op verschidde Fuerschungsbedierfnesser a gewënschte Genom Vollständegkeet. D'Benotzung vun kuerz-liesen Illumina Sequenzen eleng erlaabt d'Generatioun vun engem Entworf Genom. Kuerz Liesen a laang gelies Sequenzéierung mat Nanopore oder Pacbio gi kombinéiert fir e méi raffinéiert Pilzgenom mat méi laange Contigs. Ausserdeem verbessert d'Integratioun vun Hi-C Sequenzéierung d'Fäegkeeten weider, wat d'Erreeche vun engem komplette Chromosom-Niveau Genom erméiglecht.
-
De novo Bakteriell Genom Assemblée
Mir bidden e komplette bakterielle Genom Assemblée Service, garantéiert 0 Lücken. Dëst ass méiglech duerch d'Integratioun vu laang gelies Sequenzéierungstechnologien, wéi Nanopore a PacBio fir d'Versammlung a kuerz Liessequenzen mat Illumina fir d'Versammlungsvalidatioun a Feelerkorrektur vun ONT Liesungen. Eise Service bitt de komplette bioinformatesche Workflow vu Montage, funktioneller Annotatioun a fortgeschratt bioinformatescher Analyse, erfëllt spezifesch Fuerschungsziler. Dëse Service erméiglecht d'Entwécklung vu präzise Referenzgenome fir verschidde genetesch a genomesch Studien. Zousätzlech bildt et d'Basis fir Uwendungen wéi Belaaschtungsoptimiséierung, Gentechnik, a mikrobieller Technologieentwécklung, fir zouverlässeg a spaltfräi genomesch Donnéeën entscheedend fir wëssenschaftlech Abléck a biotechnologesch Innovatioun ze förderen.
