Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)
Service Spezifikatioune
Plattform: NovaSeq Plattform, PE150
Bibliothéik Typ: 200-400bp Insert bisulfite behandelt DNA Bibliothéik
Sequencing Strategie: Paired-End 150 bp
Recommandéiert Datenausgang: 10 Gb réi Daten / Probe
Prouf Ufuerderunge
DNA Quantitéit: ≥ 2g
DNA Konzentratioun: ≥ 20ng/μl.
Puritéit: OD260/280 = 1,8 bis 2,0 ouni Degradatioun oder RNA Kontaminatioun
Bioinformatik Analyse
Service Work Flow
Echantillon Liwwerung
Bibliothéik Bau
Sequenzéieren
Donnéeën Analyse
No-Verkaf Servicer
a.Referenz Genom Ausrichtung Statistiken
Statistike vun der Kaart liesen
STatistike vun der Sequenzéierungsdéift an der Ofdeckung vum C Site
Acumuléierten Ofdeckung
DVerdauungseffizienz vun all Prouf
b.Methylatiounsplaz Detektioun
Lëscht vun Methylatiounsniveauen op C Site
BS Konversioun
Methyléiert Zytosin
Methylatiounsniveau Verdeelung
c.Methylatiounskaart
Genome-breet
Genome Element
d.Verglach vu Methylatiounsniveauen tëscht Proben
PAirwise Korrelatioun vun CG Methylatioun
PCA-CG Methylatioun
CGlanz vun CG Methylatioun
d.Differenziell Methylatiounsanalyse
SStatistiken vun DMR
DMR Längt Verdeelung
Hiessen Kaart
DMR Verdeelung an geziilte Regioun
