lncrna

Laang net-kodéierend RNAen (lncRNA) sinn RNAen, déi méi laang wéi 200 Nukleotiden sinn, mat engem niddrege Kodéierungspotenzial, awer mat kritesche Reguléierungsfunktiounen. D'BMKCloud lncRNA Pipeline ass entwéckelt fir rRNA-ofgebaute Bibliothéiken mat engem héichqualitativen, gutt annotéierte Referenzgenom z'analyséieren, andeems d'lncRNA- an d'mRNA-Expressioun zesummen analyséiert ginn. Nom Liestrimmen an der Qualitéitskontroll ginn d'Liesungen mam Referenzgenom ausgeriicht fir Transkripten zesummenzestellen, an déi spéider Genstrukturanalyse weist alternativ Splicing an nei Genen op. Transkripte ginn als mRNAen oder lncRNAen identifizéiert, an d'Differenzialexpressiounsanalyse identifizéiert differentiell expriméiert lncRNAen, hir Ziler an differentiell expriméiert Genen (DEGS). Souwuel DEGen wéi och differentiell expriméiert lncRNA-Ziler ginn funktionell annotéiert fir beräichert funktionell Kategorien ze fannen.