page_head_bg

Produiten

Metagenomic Sequencing -NGS

Metagenome bezitt sech op eng Sammlung vum ganzen genetesche Material vun enger gemëschter Gemeinschaft vun Organismen, wéi zum Beispill Ëmwelt-Metagenom, mënschlecht Metagenom, etc..Metagenomesch Sequenzéierung ass e molekulare Tool dat benotzt gëtt fir déi gemëschte genomesch Materialien aus Ëmweltproben extrahéiert ze analyséieren, déi detailléiert Informatioun iwwer Speziesdiversitéit an Heefegkeet, Bevëlkerungsstruktur, phylogenetesch Bezéiung, funktionell Genen a Korrelatiounsnetz mat Ëmweltfaktoren ubitt.

Plattform:Illumina NovaSeq6000


Service Detailer

Demo Resultater

Fall Studie

Service Virdeeler

● Isolatioun a Kultivatioun-gratis fir microbial Communautéit Profiling

● Héich Opléisung bei der Entdeckung vun niddereg-Heefegkeet Arten an Ëmweltproben

● D'Iddi vun "meta-" integréiert all biologesch Fonctiounen op funktionell Niveau, Arten Niveau an Gen Niveau, déi eng dynamesch Vue reflektéiert déi méi no un der Realitéit ass.

● BMK sammelt massiv Erfarung a verschiddenen Probetypen mat iwwer 10.000 Proben veraarbecht.

Service Spezifikatioune

 Plattform

Sequenzéieren

Recommandéiert Donnéeën

Ëmlafzäit

Illumina NovaSeq 6000

PE150

6 G/10 G/20 G

45 Aarbechtsdeeg

Bioinformatik Analysen

● Raw Daten Qualitéitskontroll

● Metagenome Assemblée

● Net-redundante Genset an Annotatioun

● Spezies Diversitéit Analyse

● Genetesch Funktioun Diversitéit Analyse

● Inter-Grupp Analyse

● Associatiounsanalyse géint experimentell Faktoren

liuchengtu11

Prouf Ufuerderunge a Liwwerung

Sample Ufuerderunge:

FirDNA Extrakten:

Prouf Typ

Betrag

Konzentratioun

Rengheet

DNA Extrakten

> 100 ng

> 1 ng/μl

OD260/280= 1,6-2,5

Fir Ëmweltproblemer:

Prouf Typ

Recommandéiert Proufprozedur

Buedem

Sample Betrag: ca.5 g ;.Rescht verwinnte Substanz muss vun der Uewerfläch geläscht ginn;Grind grouss Stécker a passéiert duerch 2 mm Filter;Aliquot Proben a sterilem EP-Tube oder Cyrotube fir Reservatioun.

Feeën

Sample Betrag: ca.5 g ;.Sammelt an aliquot Proben an steril EP-Tube oder cryotube fir Reservatioun.

Intestinal Inhalt

Echantillon mussen ënner asepteschen Zoustand veraarbecht ginn.Wäscht gesammelt Tissue mat PBS;Zentrifuge de PBS a sammelt de Nidderschlag an EP-Réier.

Schlamm

Sample Betrag: ca.5 g ;.Sammelt an aliquot Schlammprobe an engem sterile EP-Tube oder Cryotube fir Reservatioun

Waasserkierper

Fir Probe mat enger limitéierter Quantitéit vu Mikrobiellen, sou wéi Krunnewaasser, Brunnwasser, asw., Sammelt op d'mannst 1 L Waasser a passéiert duerch 0,22 μm Filter fir Mikrobial op der Membran ze beräicheren.Späichert d'Membran an engem sterile Rouer.

Haut

Virsiichteg d'Hautoberfläche mat engem sterile Kotteng oder enger chirurgescher Blade schrauwen a se an engem sterile Rouer setzen.

Recommandéiert Sample Liwwerung

Afréiere d'Proben a flëssege Stickstoff fir 3-4 Stonnen a späicheren a flëssege Stickstoff oder -80 Grad bis laangfristeg Reservatioun.Probe Versand mat Trockenis ass erfuerderlech.

Service Work Flow

logo_02

Echantillon Liwwerung

logo_04

Bibliothéik Bau

logo_05

Sequenzéieren

logo_06

Donnéeën Analyse

logo_07

No-Verkaf Servicer


  • virdrun:
  • Nächste:

  • 1.Histogramm: Speziesverdeelung

    3

    2.Funktionell Genen annotéiert op KEGG metabolesche Weeër

    4

    3.Heat Map: Differentialfunktiounen baséiert op relativer Geniwwerfloss54.Circos vun CARD Antibiotike Resistenz Genen

    6

    BMK Fall

    Prävalenz vun Antibiotikresistenzgenen a bakterielle Pathogenen laanscht de Buedem-Mangrove Root Kontinuum

    Verëffentlecht:Journal of Hazardous Materials, 2021

    Sequenzéierungsstrategie:

    Materialien: DNA Extrakter vu véier Fragmenter vu Mangrovenwurzel-assoziéierte Proben: onplantéierte Buedem, Rhizosphär, Episphär an Endosphärkompartimenter
    Plattform: Illumina HiSeq 2500
    Ziler: Metagenome
    16S rRNA Gen V3-V4 Regioun

    Schlëssel Resultater

    Metagenomesch Sequenzéierung a Metabarcodéierungsprofiléierung op Buedem-Wuerzel Kontinuum vu Mangrovesäckel goufe veraarbecht fir d'Verbreedung vun Antibiotikresistenzgenen (ARGs) vu Buedem a Planzen ze studéieren.Metagenomesch Donnéeën hunn opgedeckt datt 91,4% vun Antibiotikresistenzgenen allgemeng an alle véier Buedemkompartimenter uewe genannt goufen identifizéiert, wat eng kontinuéierlech Moud gewisen huet.16S rRNA Amplicon Sequencing generéiert 29.285 Sequenzen, representéiert 346 Arten.Kombinéiert mat Artenprofiléierung duerch Amplicon Sequenzéierung, gouf dës Verbreedung onofhängeg vu root-assoziéierten Mikrobiota fonnt, awer et konnt duerch mobil vun geneteschen Elementer erliichtert ginn.Dës Etude identifizéiert de Flux vun ARGs a pathogens aus Buedem an de Planzen duerch interconnected Buedem-Wuerzel Kontinuum.

    Referenz

    Wang, C., Hu, R., Strong, PJ, Zhuang, W., & Shu, L.(2020).Prävalenz vun Antibiotikresistenzgenen a bakterielle Pathogenen laanscht de Buedem-Mangrove Root Kontinuum.Journal of Hazardous Materials, 408, 124985.

    kréien en Devis

    Schreift Äre Message hei a schéckt en un eis

    Schéckt eis Äre Message: