●Isolatioun a Kultivatioun-gratis Method fir Mikrobial Gemeinschaftsprofiléierung: Erlaabt d'Sequenzéierung vum genetesche Material vun onkultivéierbaren Organismen.
●Héich Opléisung: Entdeckt niddereg-Heefegkeet Arten an Ëmweltproben.
●Comprehensive Bioinformatics Analyse:Fokusséiert net nëmmen op taxonomesch Diversitéit, awer och op déi funktionell Diversitéit vun der Gemeinschaft.
●Extensiv Erfahrung:Mat engem Track Record vun erfollegräicher Zoumaache vu multiple metagenomics Projeten a verschiddene Fuerschungsberäicher a Veraarbechtung iwwer 200,000 Echantillon, bréngt eis Team e Räichtum un Erfahrung fir all Projet.
Sequenzéierungsplattform | Sequenzéierungsstrategie | Daten recommandéiert | Qualitéitskontroll |
Illumina NovaSeq oder DNBSEQ-T7 | PE150 | 6-20 Gb | Q30≥85% |
Konzentratioun (ng/µL) | Gesamtbetrag (ng) | Volumen (µL) |
≥1 | ≥30 | ≥20 |
● Buedem / Schlamm: 2-3g
● Intestinal Inhalt-Déier: 0,5-2g
● Intestinal Inhalt-Insekt: 0,1-0,25g
● Planzefläch (beräichert Sediment): 0,5-1g
● Fermentatioun Bouillon beräichert Sediment): 0,2-0,5g
● Faeces (grouss Déieren): 0,5-2g
● Faeces (Maus): 3-5grains
● Pulmonal alveolar Lavage Flëssegkeet: Filterpabeier
● Vaginale Schwämm: 5-6 Schwämm
● Haut / Genital Swab / Spaut / Oral Weichgewebe / Pharyngeal Swab / Rektal Swab: 2-3 Swabs
● Surface Mikroorganismus: 5-6 Swabs
● Waasserkierper / Loft / Biofilm: Filterpabeier
● Endophyten: 2-3g
● Dental Plaque: 0,5-1g
Ëmfaasst déi folgend Analyse:
● Sequenzéieren Daten Qualitéitskontroll
● Metagenome Assemblée an Gene Prediction
● Gene Annotatioun
● Taxonomesch Alpha Diversitéit Analyse
● Funktionell Analyse vun der Gemeinschaft: biologesch Funktioun, metabolesch, Antibiotikresistenz
● Analyse souwuel funktionell wéi taxonomesch Diversitéit:
Beta Diversitéit Analyse
Inter-Grupp Analyse
Korrelatiounsanalyse: tëscht Ëmweltfaktoren an OUT Zesummesetzung an Diversitéit
Funktionell Analyse: CARD Antibiotikresistenz
Differenziell Analyse vu KEGG metabolesche Weeër: Hëtztkaart vu bedeitende Weeër
Alpha Diversitéit vun taxonomic Verdeelung: ACE Index
Beta Diversitéit vun der taxonomescher Verdeelung: PCoA
Entdeckt d'Fortschrëtter erliichtert vum BMKGene seng metagenome Sequenzéierungsservicer mat Illumina duerch eng curéiert Sammlung vu Publikatiounen.
Hai, Q. et al. (2023) 'Metagenomesch a metabolomesch Analyse vun Ännerungen am Darmgehalt vu Regenbogenforellen (Oncorhynchus mykiss) infizéiert mat infektiivt hematopoieteschen Nekrosevirus bei verschiddene Kulturwassertemperaturen',Grenzen an der Mikrobiologie, 14, p. 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
Mao, C. et al. (2023) 'Mikrobialgemeinschaften, Resistenzgenen, a Resistomerisiken an urbane Séien vu verschiddenen trophesche Staaten: Intern Linken an extern Aflëss',Journal vun geféierlech Materialien Fortschrëtter, 9p. 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.
Sou, M. et al. (2022) 'Metagenomesch Analyse huet Differenzen an der Zesummesetzung a Funktioun tëscht flësseg-assoziéierten a fest-assoziéierten Mikroorganismen vu Schof Rumen opgedeckt',Grenzen an der Mikrobiologie, 13, p. 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.
Yin, J. et al. (2023) 'Obese Ningxiang Schwäin-ofgeleet Mikrobiota rewires de Carnitin Metabolismus fir d'Muskelfettsäureablagerung bei schlankem DLY Schwäin ze förderen',D'InnovatiounEng., 4(5), p. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.
Zhao, X. et al. (2023) 'Metagenomesch Abléck an d'potenziell Risiken vu representativen bio/net-degradéierbaren Plastik an net-plasteschen Debris an den ieweschten an ënneschten Erréchen vum Haihe Estuary, China',Science of The Total EnvironmentEng., 887, p. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.