Heatmap
Matrixdatendatei gëtt fir Hëtztkaart Zeechnen benotzt, déi Matrixdaten filteren, normaliséieren a clusteren.Et gëtt meeschtens fir Clusteranalyse vum Genausdrockniveau tëscht verschiddene Proben benotzt.
Gene Annotatioun
Genfunktioun Annotatioun gëtt duerch Kartéierungssequenzen an der FASTA Datei géint verschidde Datebank gemaach.
Gene Annotatioun
Basis Local Alignment Search Tool
CDS_UTR_Prediction
Dëst Tool ass entwéckelt fir Kodéierungsregiounen (CDS) an Net-kodéierende Regiounen (UTR) a gegebene Transkriptsequenzen virauszesoen baséiert op Sprengung géint bekannte Protein Datebank an ORF Viraussoen.
Manhattan Komplott
Manhattan Komplott erlaabt Affichage vun Daten mat enger grousser Zuel vun Datepunkte.Et gëtt allgemeng a Genom-breet Associatiounsstudien (GWAS) benotzt.
Circos
CIRCOS Diagramm erméiglecht direkt Presentatioun vu SNP, InDeL, SV, CNV Verdeelungen op Genom.
GO_Beräicherung
TopGO ass en Tool fir funktionell Beräicherung entwéckelt.TopGO-Bioconductor Package besteet aus differentiell Ausdrock Analyse, GO Beräicherung Analyse a Visualiséierung vun de Resultater.Et generéiert en Dossier mam Ausgang mam Numm "Graph", deen Resultater fir topGO_BP, topGO_CC an topGO_MF enthält.
WGCNA
WGCNA ass eng wäit benotzt Dateminingmethod fir Gen Co-Expression Moduler z'entdecken.Et ass uwendbar fir verschidden Ausdrocksdates abegraff Mikroarraydaten a Genausdrockdaten entstanen aus der nächster Generatioun Sequenzéierung.
InterProScan
InterPro Protein Sequenz Analyse a Klassifikatioun
GO_KEGG_Enrichment
Dëst Tool ass entworf fir GO Beräicherungshistogramm, KEGG Beräicherungshistogramm a KEGG Beräicherungswee ze generéieren baséiert op geliwwert Genset an entspriechend Annotatioun.