Προϊόντα

Αλληλουχία RNA ενός πυρήνα

Επιλεγμένη εικόνα αλληλουχίας RNA μονού πυρήνα

Η πρόοδος στη σύλληψη μεμονωμένων κυττάρων και την τεχνική κατασκευής μεμονωμένων βιβλιοθηκών σε συνδυασμό με την αλληλουχία υψηλής απόδοσης επιτρέπει μελέτες γονιδιακής έκφρασης σε βάση κύτταρο προς κύτταρο.Επιτρέπει μια βαθύτερη και πλήρη ανάλυση συστήματος σε σύνθετους κυτταρικούς πληθυσμούς, στους οποίους αποφεύγει σε μεγάλο βαθμό την απόκρυψη της ετερογένειάς τους λαμβάνοντας τον μέσο όρο όλων των κυττάρων.

Ωστόσο, ορισμένα κύτταρα δεν είναι κατάλληλα για να μετατραπούν σε εναιώρημα μονοκυττάρου, επομένως χρειάζονται άλλες μέθοδοι προετοιμασίας δειγμάτων - η εξαγωγή πυρήνα από ιστούς, δηλαδή ο πυρήνας εξάγεται απευθείας από ιστούς ή κύτταρο και παρασκευάζεται σε εναιώρημα ενός πυρήνα για μονοπύρηνο αλληλουχία κυττάρων.

Η BMK παρέχει 10× Genomics ChromiumTM υπηρεσία προσδιορισμού αλληλουχίας μονοκυττάρου RNA.Αυτή η υπηρεσία έχει χρησιμοποιηθεί ευρέως σε μελέτες για μελέτες σχετικές με ασθένειες, όπως η διαφοροποίηση των ανοσοκυττάρων, η ετερογένεια του όγκου, η ανάπτυξη ιστών κ.λπ.

Τσιπ χωρικής μεταγραφής: 10× Genomics

Πλατφόρμα: Πλατφόρμα Illumina NovaSeq

Επικοινωνήστε μαζί μας

Στοιχεία υπηρεσίας

Βιοπληροφορική

Αποτελέσματα επίδειξης

Τεχνική αρχή

Η απομόνωση των πυρήνων επιτυγχάνεται με το 10× Genomics ChromiumTM, το οποίο αποτελείται από σύστημα μικρορευστοποίησης οκτώ καναλιών με διπλές διασταυρώσεις.Σε αυτό το σύστημα, σφαιρίδια γέλης με γραμμωτούς κώδικες και εκκινητή, ένζυμα και έναν μόνο πυρήνα ενθυλακώνονται σε σταγόνα λαδιού μεγέθους νανολίτρου, δημιουργώντας το Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Μόλις σχηματιστεί το GEM, η λύση των κυττάρων και η απελευθέρωση γραμμωτών κωδίκων εκτελούνται σε κάθε GEM.Το mRNA μεταγράφεται αντίστροφα σε μόρια cDNA με γραμμωτούς κώδικες 10× και UMI, τα οποία υπόκεινται περαιτέρω σε τυπική κατασκευή βιβλιοθήκης αλληλουχίας.

Ιστός ακατάλληλος για παρασκευή μονοκυτταρικού εναιωρήματος

Κύτταρο / ιστός	Λόγος
Μη φρέσκο κατεψυγμένο χαρτομάντιλο	Δεν είναι δυνατή η απόκτηση νέων ή από καιρό αποθηκευμένων οργανισμών
Μυϊκά κύτταρα, Μεγακαρυοκύτταρα, Λίπος…	Η διάμετρος του στοιχείου είναι πολύ μεγάλη για να εισέλθει στο όργανο
Συκώτι…	Πολύ εύθραυστο για να σπάσει, ανίκανο να διακρίνει μεμονωμένα κύτταρα
Κύτταρο νευρώνων, εγκέφαλος…	Πιο ευαίσθητο, εύκολο στο άγχος, θα αλλάξει τα αποτελέσματα της αλληλουχίας
Πάγκρεας, Θυρεοειδής…	Πλούσιο σε ενδογενή ένζυμα, που επηρεάζουν την παραγωγή μονοκυτταρικού εναιωρήματος

Μεμονωμένος πυρήνας vs μονοκύτταρο

Μονοπύρηνος	Μονοκύτταρο
Απεριόριστη διάμετρος κυψέλης	Διάμετρος κυψέλης: 10-40 μm
Το υλικό μπορεί να είναι παγωμένος ιστός	Το υλικό πρέπει να είναι φρέσκος ιστός
Χαμηλό στρες κατεψυγμένων κυττάρων	Η θεραπεία με ένζυμα μπορεί να προκαλέσει αντίδραση στρες των κυττάρων
Δεν χρειάζεται να αφαιρεθούν τα ερυθρά αιμοσφαίρια	Τα ερυθρά αιμοσφαίρια πρέπει να αφαιρεθούν
Το πυρηνικό εκφράζει βιοπληροφορίες	Ολόκληρο το κύτταρο εκφράζει βιοπληροφορίες

Προδιαγραφές Υπηρεσίας

Βιβλιοθήκη

Στρατηγική αλληλουχίας

Όγκος δεδομένων

Απαιτήσεις δειγμάτων

Ιστός

10× Genomics single-nuclei Library

10x Genomics -Illumina PE150

100.000 αναγνώσεις/κελί περίπου.100-200 Gb

Αριθμός κελιού: >2× 10⁵

Κύτταρο συκ.στα 700-1.200 κύτταρα/μL

≥ 200 mg

Για περισσότερες λεπτομέρειες σχετικά με την καθοδήγηση προετοιμασίας δειγμάτων και τη ροή εργασιών σέρβις, μη διστάσετε να μιλήσετε με τον αΕιδικός BMKGENE