Προϊόντα

Αλληλουχία προκαρυωτικού RNA

Προκαρυωτική αλληλουχία RNA Επιλεγμένη εικόνα

Ο προσδιορισμός αλληλουχίας προκαρυωτικού RNA χρησιμοποιεί αλληλούχιση επόμενης γενιάς (NGS) για να αποκαλύψει την παρουσία και την ποσότητα του RNA σε μια δεδομένη στιγμή, αναλύοντας το μεταβαλλόμενο κυτταρικό μεταγράφημα.Ο προσδιορισμός αλληλουχίας προκαρυωτικού RNA της εταιρείας μας στοχεύει συγκεκριμένα σε προκαρυωτικά με γονιδιώματα αναφοράς, παρέχοντάς σας προφίλ μεταγραφής, ανάλυση γονιδιακής δομής κ.λπ. Έχει εφαρμοστεί ευρέως στη βασική επιστημονική έρευνα, στην έρευνα και ανάπτυξη φαρμάκων και πολλά άλλα.

Πλατφόρμα: Πλατφόρμα Illumina NovaSeq

Επικοινωνήστε μαζί μας

Στοιχεία υπηρεσίας

Προδιαγραφές Υπηρεσίας

Πλατφόρμα: Πλατφόρμα Illumina NovaSeq, PE150

Τύπος βιβλιοθήκης: 350bp ένθετη βιβλιοθήκη cDNA (εξαρτάται από τη μέγιστη κατανομή)

Στρατηγική αλληλουχίας: Paired-End 150 bp

Προτεινόμενη ποσότητα δεδομένων: 2 Gb ακατέργαστα δεδομένα/δείγμα

Βιοπληροφορική

(1) Έλεγχος ποιότητας δεδομένων αλληλούχισης: Κατανομή νουκλεοτιδίων, Βασική κατανομή ποιότητας, εκτίμηση αναλογίας rRNA.

(2) Ανάλυση στοίχισης αλληλουχίας: Στατιστικά αποτελέσματος ευθυγράμμισης, Κορεσμός αλληλουχίας, Κάλυψη αλληλουχίας.

(3) Σχολιασμός γονιδιώματος αναφοράς (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG).

(4) Ανάλυση έκφρασης: Κατανομή έκφρασης (με δύο ή περισσότερα δείγματα), Ανάλυση έκφρασης μεταξύ δειγμάτων (ανάλυση Venn, Ανάλυση συσχέτισης, ανάλυση PCA).

(5) Ανάλυση διαφορικής έκφρασης (Με δύο ή περισσότερα δείγματα).

(6) Ανάλυση συνόλου γονιδίων: Ανάλυση Venn, Ανάλυση συμπλέγματος, Ανάλυση σχολιασμού συναρτήσεων (COG, GO, KEGG), Ανάλυση εμπλουτισμού συναρτήσεων (GO, KEGG), Γράφημα χορδής εμπλουτισμού συναρτήσεων, ανάλυση Ipath.

(7) Ανάλυση sRNA: πρόβλεψη sRNA, σχολιασμός sRNA (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), πρόβλεψη δευτερογενούς δομής sRNA, πρόβλεψη γονιδίου στόχου sRNA.

(8) Ανάλυση δομής μεταγραφής: Ανάλυση οπερονίου, Πρόβλεψη τοποθεσιών έναρξης και λήξης μεταγραφής, σχολιασμός και ανάλυση UTR, Πρόβλεψη ακολουθίας υποκινητή, ανάλυση SNP/InDel (σχολιασμός SNP/InDel, περιφερειακή κατανομή SNP/InDel, στατιστικά SNP).