Αλληλουχία διθειώδους μειωμένης αναπαράστασης (RRBS)
Προδιαγραφές Υπηρεσίας
Πλατφόρμα: Πλατφόρμα NovaSeq, PE150
Τύπος βιβλιοθήκης: Βιβλιοθήκη DNA επεξεργασμένης με διθειώδες ένθετο 200-400bp
Στρατηγική αλληλουχίας: Paired-End 150 bp
Προτείνετε έξοδο δεδομένων: 10 Gb ακατέργαστα δεδομένα/δείγμα
Απαιτήσεις δειγμάτων
Ποσότητα DNA: ≥ 2ug
Συγκέντρωση DNA:≥ 20ng/μl.
Καθαρότητα: OD260/280 = 1,8 έως 2,0 χωρίς αποικοδόμηση ή μόλυνση RNA
Βιοπληροφορική ανάλυση
Ροή εργασιών εξυπηρέτησης
Παράδοση δειγμάτων
Κατασκευή βιβλιοθήκης
Αλληλουχία
Ανάλυση δεδομένων
Υπηρεσίες μετά την πώληση
a.Αναφορά στατιστικών ευθυγράμμισης γονιδιώματος
Στατιστικά στοιχεία χαρτογράφησης διαβάζει
Sστατιστικές βάθους αλληλουχίας και κάλυψης της θέσης C
Aσυσσωρευμένη κάλυψη
Dαποτελεσματικότητα πέψης κάθε δείγματος
b.Ανίχνευση θέσης μεθυλίωσης
Κατάλογος επιπέδων μεθυλίωσης στη θέση C
BΜετατροπή S
Mαιθυλιωμένη κυτοσίνη
Κατανομή επιπέδου μεθυλίωσης
c.Χάρτης μεθυλίωσης
Gσε πλάτος ονόμα
Gστοιχείο enome
d.Σύγκριση επιπέδων μεθυλίωσης μεταξύ δειγμάτων
PΑεροπορικά Συσχέτιση μεθυλίωσης CG
PΜεθυλίωση CA-CG
Cστίλβωση μεθυλίωσης CG
d.Ανάλυση διαφορικής μεθυλίωσης
Sστατιστικές του DMR
Κατανομή μήκους DMR
Hφάτε χάρτη
DΚατανομή μαγνητικής τομογραφίας στη στοχευμένη περιοχή
