-
Kromatina Imunprecipita Sekvencado (ChIP-seq)
ChIP-Seq disponigas genar-kovrantan profiladon de DNA-celoj por histonmodifo, transkripcifaktoroj, kaj aliaj DNA-rilataj proteinoj.Ĝi kombinas la selektivecon de kromatina imun-precipitaĵo (ChIP) por reakiri specifajn protein-DNA-kompleksojn, kun la potenco de venontgeneracia sekvencado (NGS) por alt-trafia sekvencado de la reakirita DNA.Plie, ĉar la protein-DNA kompleksoj estas reakiritaj de vivantaj ĉeloj, liglokoj povas esti komparitaj en malsamaj ĉeltipoj kaj histoj, aŭ sub malsamaj kondiĉoj.Aplikoj intervalas de transskriba reguligo ĝis evoluaj padoj ĝis malsanmekanismoj kaj pretere.
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq
-
Metagenomic Sequencing -NGS
Metagenomo rilatas al kolekto de totala genetika materialo de miksita komunumo de organismoj, kiel media metagenomo, homa metagenomo, ktp. Ĝi enhavas genamojn de kaj kultiveblaj kaj nekultiveblaj mikroorganismoj.Metagenomic-sekvencado estas molekula ilo uzita por analizi la miksitajn genomicmaterialojn eltiritajn de mediaj provaĵoj, kiu disponigas detalajn informojn pri speciodiverseco kaj abundo, populaciostrukturo, filogenetika rilato, funkciaj genoj kaj korelacia reto kun medifaktoroj.
Platformo:Platformo Illumina NovaSeq
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics estas molekula ilo uzata por analizi la miksitajn genomajn materialojn ĉerpitajn el mediaj specimenoj, kiu provizas detalajn informojn pri specia diverseco kaj abundo, populaciostrukturo, filogenetika rilato, funkciaj genoj kaj korelacia reto kun mediaj faktoroj, ktp. Laste enkondukis platformojn de sekvencado Nanopore. al metagenomaj studoj.Ĝia elstara agado en legolongo plejparte plibonigis laŭfluan metagenomican analizon, precipe metagenomasembleon.Utiligante leg-longon, Nanopor-bazita metagenomic-studo kapablas atingi pli kontinuan kunigon kompare kun pafila metagenomics.Estis publikigita ke Nanopor-bazita metagenomics sukcese generis kompletajn kaj fermitajn bakteriajn genamojn de mikrobiomoj (Moss, EL, et. al,Nature Biotech, 2020)
Platformo:Nanopore PromethION P48
-
Tuta genaro bisulfito-sekvencado
DNA-metiligo ĉe la kvina pozicio en citozino (5-mC) havas fundamentan influon sur genekspresio kaj ĉela agado.Nenormalaj metiligpadronoj estis asociitaj kun pluraj kondiĉoj kaj malsanoj, kiel ekzemple kancero.WGBS fariĝis la ora normo por studi genar-kovrantan metiigon ĉe unubaza rezolucio.
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq
-
Analizo por Transposase-Alirebla Kromatino kun Alta Trafia Sekvencado (ATAC-seq)
ATAC-seq estas alt-produkta sekvencmetodo por analizo de genar-kovranta kromatinalirebleco, kio estas grava por tutmonda epigenetika kontrolo de genekspresio.Sekvencaj adaptiloj estas enigitaj en malfermajn kromatinregionojn per hiperaktiva Tn5-transposazo.Post PCR-plifortigo, sekvenca biblioteko estas konstruita.Ĉiuj malfermaj kromatinregionoj povas esti akiritaj sub specifa spactempa kondiĉo, ne nur limigitaj al la liglokoj de transkripcifaktoro, aŭ certa histona modifita regiono.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
La subunuo sur 16S kaj 18S rRNA enhavanta kaj tre konservitajn kaj hiper-variajn regionojn estas perfekta molekula fingrospuro por identigo de prokariotaj kaj eŭkariotaj organismoj.Profitante de sekvencado, tiuj amplikonoj povas esti celitaj surbaze de la konservitaj partoj kaj la hiper-variaj regionoj povas esti plene karakterizitaj por mikroba identigo kontribuante al studoj kovrantaj mikroba diversecanalizon, taksonomion, filogenion, ktp. Unumolekulaj realtempaj (SMRT). ) sekvencado de PacBio-platformo ebligas akiri tre precizajn longajn legadojn, kiuj povus kovri plenlongajn amplikonojn (ĉ. 1,5 Kb).La plilarĝiga vido de genetika kampo tre plifortigis la rezolucion en specia komentario en bakterioj aŭ fungaj komunumoj.
Platformo:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS-amplikonsekvencado celas malkaŝi filogenion, taksonomion, kaj specioabundon en mikroba komunumo esplorante PCR-produktojn de mastrumaj genetikaj signoj kiuj enhavas kaj tre konversaciajn kaj hipervariajn partojn.La enkonduko de ĉi tiuj perfektaj molekulaj fingrospuroj de Woeses et al, (1977) rajtigas izolitecan mikrobiomprofiladon.Sekvencado de 16S (bakterioj), 18S (fungoj) kaj Interna transskribita interspacigilo (ITS, fungoj) permesas identigon de kaj abundaj specioj same kiel raraj kaj neidentigitaj specioj.Tiu teknologio fariĝis vaste aplikata kaj grava ilo en identigado de diferenciga mikroba kunmetaĵo en diversaj medioj, kiel ekzemple homa buŝo, intestoj, feko, ktp.
Platformo:Platformo Illumina NovaSeq
-
Bakteria kaj Funga Tuta Genaro Re-sekvencado
Bakteria kaj funga tuta genaro re-sekvencado estas kritika ilo por kompletigi la genarojn de konataj bakterioj kaj fungoj, same kiel por kompari multoblajn genarojn aŭ mapi genarojn de novaj organismoj.Gravas sekvenci tutajn genarojn de bakterio kaj fungoj por generi precizajn referencgenarojn, fari mikroban identigon kaj aliajn komparajn genarstudojn.
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq
-
PacBio-Plelonga 16S/18S/ITS Amplikon-sekvencado
Amplicon (16S/18S/ITS) platformo estas evoluigita kun jaroj da sperto en mikroba diverseca projekta analizo, kiu enhavas normigitan bazan analizon kaj personigitan analizon: baza analizo kovras la ĉefan analizan enhavon de nuna mikroba esplorado, la analiza enhavo estas riĉa kaj ampleksa, kaj analizrezultoj estas prezentitaj en formo de projektraportoj;La enhavo de personigita analizo estas diversa.Specimenoj povas esti elektitaj kaj parametroj povas esti fiksitaj flekseble laŭ la baza analiza raporto kaj esplora celo, por realigi personecigitajn postulojn.Vindoza operaciumo, simpla kaj rapida.
-
PacBio-Plelonga Transcriptome (Ne-Referenco)
Prenante Pacific Biosciences (PacBio) Isoformajn sekvengajn datumojn kiel enigaĵon, ĉi tiu Apo kapablas identigi plenlongajn transskribajn sekvencojn (sen asembleo).Mapante plenlongajn sekvencojn kontraŭ referenca genaro, transskribaĵoj povas esti optimumigitaj per konataj genoj, transskribaĵoj, kodaj regionoj, ktp. En ĉi tiu kazo, pli preciza identigo de mRNA-strukturoj, kiel ekzemple alternativa splisado, ktp, povas esti atingita.Komuna analizo kun NGS-transkriptome-sekvencaj datumoj ebligas pli ampleksan komentadon kaj pli precizan kvantigon en esprimo sur transskriba nivelo, kiu plejparte profitas kontraŭfluan diferencigan esprimon kaj funkcian analizon.
-
Reduktita Reprezenta Bisulfita Sekvencado (RRBS)
Esplorado pri DNA-metiligo ĉiam estis varma temo en esploro pri malsano, kaj estas proksime rilatita al genesprimo kaj fenotipaj trajtoj.RRBS estas preciza, efika kaj ekonomia metodo por DNA-metiligesplorado.Riĉigo de iniciatinto kaj CpG-insulaj regionoj per enzimeca fendetaĵo (Msp I), kombinita kun Bisulfite-sekvencado, disponigas altan rezolucian DNA-metiligdetekton.
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq
-
Prokariota mRNA-sekvencado
mRNA-sekvencado povigas la ampleksan profiladon de ĉiuj mRNA-transskribaĵoj ene de ĉeloj sub specifaj kondiĉoj.Ĉi tiu avangarda teknologio funkcias kiel potenca ilo, malkaŝante malsimplajn genajn esprimojn profilojn, genajn strukturojn kaj molekulan mekanismojn asociitajn kun diversaj biologiaj procezoj.Vaste adoptita en fundamenta esplorado, klinika diagnozo kaj drog-evoluo, mRNA-sekvencado ofertas sciojn pri la komplikaĵoj de ĉela dinamiko kaj genetika reguligo.Nia prokariota mRNA-specimpla pretigo estas tajlorita por prokariotaj transkriptomoj, implikante rRNA-malplenigon kaj direktan bibliotekan preparon.
Platformo: Illumina NovaSeq X
