lncrna

Longaj ne-kodantaj RNA-oj (lncRNA) estas RNA-oj pli longaj ol 200 nukleotidoj kun malalta koda potencialo sed kun kritikaj reguligaj funkcioj. La BMKCloud lncRNA-dukto estas desegnita por analizi bibliotekojn sen rRNA kun altkvalita, bone prinotita referenca genaro, analizante kune lncRNA kaj mRNA-esprimon. Post legado-pritondado kaj kvalito-kontrolo, legaĵoj estas vicigitaj al la referenca genaro por kunmeti transskribaĵojn, kaj posta genstruktura analizo rivelas alternativan splisadon kaj novajn genojn. Transskribaĵoj estas identigitaj kiel mRNA-oj aŭ lncRNA-oj, kaj diferenciga esprima analizo identigas diferencige esprimitajn lncRNA-ojn, iliajn celojn kaj diferencige esprimitajn genojn (DEGS). Kaj DEG-oj kaj diferencige esprimitaj lncRNA-celoj estas funkcie prinotitaj por trovi riĉigitajn funkciajn kategoriojn.