-
Sekans iminopresipitasyon chromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq bay pwofil nan tout genòm nan objektif ADN pou modifikasyon histon, faktè transkripsyon, ak lòt pwoteyin ki asosye ak ADN.Li konbine selektivite chromatin imuno-presipitasyon (ChIP) pou refè konplèks pwoteyin-ADN espesifik, ak pouvwa pwochen jenerasyon sekans (NGS) pou sekans wo-debi nan ADN refè a.Anplis de sa, paske konplèks pwoteyin-ADN yo refè nan selil k ap viv, sit obligatwa yo ka konpare nan diferan kalite selil ak tisi, oswa nan diferan kondisyon.Aplikasyon yo varye soti nan règleman transkripsyon an nan chemen devlopman nan mekanis maladi ak pi lwen.
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
Sekans metagenomik -NGS
Metagenome refere a yon koleksyon total de materyèl jenetik nan yon kominote melanje nan òganis, tankou metagenome anviwònman an, metagenome imen, elatriye.Sekans metagenomik se yon zouti molekilè ki itilize pou analize materyèl jenomik melanje ki soti nan echantiyon anviwònman an, ki bay enfòmasyon detaye sou divèsite espès ak abondans, estrikti popilasyon, relasyon filojenetik, jèn fonksyonèl ak rezo korelasyon ak faktè anviwònman an.
Platfòm:Platfòm Illumina NovaSeq
-
Sekans metagenomik-Nanopore
Metagenomics se yon zouti molekilè ki itilize pou analize materyèl jenomik melanje ki sòti nan echantiyon anviwònman an, ki bay enfòmasyon detaye sou divèsite espès ak abondans, estrikti popilasyon, relasyon filojenetik, jèn fonksyonèl ak rezo korelasyon ak faktè anviwònman, elatriye. Nanopore sekans platfòm dènyèman te prezante. nan etid metagenomic.Pèfòmans eksepsyonèl li yo nan longè lekti lajman amelyore analiz metagenomic kouran an, espesyalman asanble metagenom.Pran avantaj de lekti-longè, etid metagenomic ki baze sou Nanopore se kapab reyalize plis asanble kontinyèl konpare ak metagenomics piki-zam.Li te pibliye ke metagenomics ki baze sou Nanopore te jenere avèk siksè jenom bakteri konplè ak fèmen nan mikrobyom (Moss, EL, et. al,Nati Biotech, 2020)
Platfòm:Nanopore PromethION P48
-
Sekans bisulfit genomic antye
Methylation ADN nan senkyèm pozisyon nan sitozin (5-mC) gen yon enfliyans fondamantal sou ekspresyon jèn ak aktivite selilè.Modèl methylation nòmal yo te asosye ak plizyè kondisyon ak maladi, tankou kansè.WGBS te vin estanda an lò pou etidye methylation nan tout genòm nan rezolisyon yon sèl baz.
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
Esè pou Transposase-aksesib Chromatin ak Sekans Debi segondè (ATAC-seq)
ATAC-seq se yon metòd sekans wo-debi pou analiz aksè nan genomic-lajè chromatin, ki enpòtan pou kontwòl epigenetik mondyal ekspresyon jèn.Adaptè sekans yo mete nan rejyon kwomatin ouvè pa transposaz Tn5 ipèaktif.Apre anplifikasyon PCR, yo konstwi yon bibliyotèk sekans.Tout rejyon yo louvri chromatin ka jwenn nan yon kondisyon espesifik espas-tan, pa sèlman limite a sit sa yo obligatwa nan yon faktè transcription, oswa yon sèten histone modifye rejyon.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Sou-inite sou 16S ak 18S rRNA ki genyen tou de rejyon trè konsève ak rejyon hyper-varyab se yon anprent molekilè pafè pou idantifikasyon òganis prokaryotic ak ekaryotik.Lè w ap pran avantaj de sekans, anplikon sa yo ka vize baze sou pati yo konsève ak rejyon hyper-varyab yo ka konplètman karakterize pou idantifikasyon mikwòb kontribye nan etid ki kouvri analiz divèsite mikwòb, taksonomi, filojeni, elatriye. Single-molecule an tan reyèl (SMRT). ) sekans nan platfòm PacBio pèmèt jwenn lekti long trè egzat, ki ta ka kouvri anplikon plen longè (apeprè 1.5 Kb).Vizyon an elaji nan jaden jenetik anpil amelyore rezolisyon an nan anotasyon espès nan kominote bakteri oswa fongis.
Platfòm:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Sekans anplikon 16S/18S/ITS vize revele filojeni, taksonomi, ak abondans espès nan yon kominote mikwòb lè yo mennen ankèt sou pwodwi PCR nan makè jenetik antretyen ki genyen tou de pati ki trè konvès ak ipèvaryab.Woeses et al, (1977) entwodiksyon anprent molekilè pafè sa yo pèmèt izolasyon mikrobyom pwofil.Sekans 16S (bakteri), 18S (chanpiyon) ak espas transkripsyon entèn (ITS, fongis) pèmèt idantifikasyon tou de espès abondan ak espès ki ra ak espès ki pa idantifye.Teknoloji sa a te vin tounen yon zouti lajman aplike ak pi gwo nan idantifye konpozisyon mikwòb diferans nan divès anviwònman, tankou bouch moun, trip, poupou, elatriye.
Platfòm:Platfòm Illumina NovaSeq
-
Bakteri ak chanpiyon Whole Genome Re-sekans
Re-sekans tout bakteri ak chanpiyon se yon zouti enpòtan pou konplete genòm bakteri ak fongis li te ye, epitou pou konpare plizyè jenom oswa kat jenom nouvo òganis yo.Li gen anpil enpòtans pou sekans tout genomic bakteri ak fongis yo nan lòd yo jenere jenom referans egzat, fè idantifikasyon mikwòb ak lòt etid genomic konparatif.
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
PacBio-Full-length 16S/18S/ITS Amplicon Sekans
Platfòm Amplicon (16S/18S/ITS) devlope ak ane eksperyans nan analiz pwojè divèsite mikwòb, ki gen analiz debaz estanda ak analiz pèsonalize: analiz debaz kouvri kontni analiz endikap nan rechèch mikwòb aktyèl la, kontni analiz la rich ak konplè, ak rezilta analiz yo prezante sou fòm rapò pwojè;Kontni analiz pèsonalize divès.Echantiyon yo ka chwazi ak paramèt yo ka mete fleksib selon rapò analiz debaz la ak objektif rechèch, reyalize kondisyon pèsonalize.Windows sistèm operasyon, senp ak vit.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (ki pa referans)
Lè w ap pran done sekans Isoform Pacific Biosciences (PacBio) kòm opinyon, App sa a kapab idantifye sekans transkripsyon tout longè (san asanble).Lè yo fè kat sekans tout longè kont jenom referans, transkripsyon yo ka optimize pa jèn li te ye, transkripsyon, rejyon kodaj, elatriye. Nan ka sa a, ka idantifikasyon pi egzak nan estrikti mRNA, tankou splicing altènatif, elatriye.Analiz konjwen ak done sekans transcriptom NGS pèmèt plis annotasyon konplè ak quantifikasyon pi egzak nan ekspresyon nan nivo transkripsyon, ki lajman benefisye ekspresyon diferans en ak analiz fonksyonèl.
-
Sekans Bisulfit Redwi Reprezantasyon (RRBS)
Rechèch metilation ADN te toujou yon sijè ki cho nan rechèch maladi, epi li gen rapò ak ekspresyon jèn ak karakteristik fenotipik.RRBS se yon metòd egzat, efikas ak ekonomik pou rechèch metilation ADN.Anrichisman pwomotè ak rejyon zile CpG pa klivaj anzimatik (Msp I), konbine avèk sekans Bisulfite, bay deteksyon ADN methylation rezolisyon segondè.
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
Sekans mRNA prokaryotik
Sekans mRNA pèmèt pwofil konplè tout transkripsyon mRNA nan selil yo nan kondisyon espesifik.Teknoloji dènye kri sa a sèvi kòm yon zouti ki pisan, revele pwofil ekspresyon jèn konplike, estrikti jèn, ak mekanis molekilè ki asosye ak divès pwosesis byolojik.Lajman adopte nan rechèch fondamantal, dyagnostik klinik, ak devlopman dwòg, sekans mRNA ofri apèsi sou konplisite nan dinamik selilè ak règleman jenetik.Pwosesis echantiyon mRNA prokaryotik nou an adapte pou transkriptòm prokaryotik, ki enplike rediksyon rRNA ak preparasyon bibliyotèk direksyon.
Platfòm: Illumina NovaSeq X
