Penjujukan transkrip keseluruhan - Illumina
ciri-ciri
● Pustaka dwi untuk menyusun transkrip yang lengkap: pengurangan rRNA diikuti dengan penyediaan perpustakaan PE150 dan pemilihan saiz diikuti dengan penyediaan perpustakaan SE50
● Analisis bioinformatik lengkap mRNA, lncRNA, circRNA dan miRNA dalam laporan bioinformatik yang berasingan
● Analisis bersama semua ekspresi RNA dalam laporan gabungan, termasuk analisis rangkaian ceRNA.
Kelebihan Perkhidmatan
●Analisis mendalam rangkaian pengawalseliaan: analisis rangkaian ceRNA didayakan oleh penjujukan bersama mRNA, lncRNA, circRNA dan miRNA dan oleh aliran kerja bioinformatik yang menyeluruh.
●Anotasi Komprehensif: kami menggunakan berbilang pangkalan data untuk menganotasi Gen Berbeza (DEG) secara fungsi dan melaksanakan analisis pengayaan yang sepadan, memberikan cerapan tentang proses selular dan molekul yang mendasari tindak balas transkrip.
●Kepakaran Luas: dengan rekod prestasi berjaya menutup lebih 2000 keseluruhan projek transkrip dalam pelbagai domain penyelidikan, pasukan kami membawa banyak pengalaman kepada setiap projek.
●Kawalan Kualiti yang Teguh: kami melaksanakan titik kawalan teras merentas semua peringkat, daripada penyediaan sampel dan perpustakaan kepada penjujukan dan bioinformatik.Pemantauan yang teliti ini memastikan penyampaian hasil yang berkualiti tinggi secara konsisten.
● Anotasi Komprehensif: kami menggunakan berbilang pangkalan data untuk menganotasi Gen Berbeza (DEG) secara fungsi dan melaksanakan analisis pengayaan yang sepadan, memberikan cerapan tentang proses selular dan molekul yang mendasari tindak balas transkrip.
●Sokongan Selepas Jualan: Komitmen kami melangkaui penyiapan projek dengan tempoh perkhidmatan selepas jualan selama 3 bulan.Pada masa ini, kami menawarkan susulan projek, bantuan penyelesaian masalah dan sesi Soal Jawab untuk menangani sebarang pertanyaan yang berkaitan dengan keputusan
Keperluan Sampel dan Penghantaran
| Perpustakaan | Strategi urutan | Data disyorkan | Kawalan kualiti |
| rRNA habis | Illumina PE150 | 16 Gb | S30≥85% |
| Saiz dipilih | Illumina SE50 | 10-20J bacaan |
Keperluan Sampel:
Nukleotida:
| Conc.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kesucian | Integriti |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pencemaran protein atau DNA terhad atau tiada ditunjukkan pada gel. | Tumbuhan: RIN≥6.5 Haiwan: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; terhad atau tiada ketinggian garis dasar |
Penghantaran Sampel yang Disyorkan
Bekas:
2 ml tiub empar (Kerajang timah tidak disyorkan)
Pelabelan sampel: Kumpulan+replikasi cth A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Penghantaran:
1.Ais kering: Sampel perlu dibungkus dalam beg dan dikebumikan dalam ais kering.
2.Tiub RNAstable: Sampel RNA boleh dikeringkan dalam tiub penstabilan RNA(cth RNAstable®) dan dihantar dalam suhu bilik.
Aliran Kerja Perkhidmatan
Reka bentuk eksperimen
Contoh penghantaran
Pengekstrakan RNA
Pembinaan perpustakaan
Urutan
Analisis data
Perkhidmatan selepas jualan
Bioinformatik
Gambaran keseluruhan ekspresi RNA
Gen yang diungkapkan secara Berbeza
analisis ceRNA
MiRNA yang dinyatakan secara berbeza dan RNA yang berkaitan
Terokai kemajuan penyelidikan yang difasilitasi oleh perkhidmatan penjujukan transkriptom keseluruhan BMKGene melalui koleksi penerbitan yang dipilih susun.
Dai, Y. et al.(2022) 'Profil ekspresi komprehensif mRNA, lncRNA dan miRNA dalam penyakit Kashin-Beck yang dikenal pasti oleh penjujukan RNA', Molecular Omics, 18(2), ms 154–166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al.(2022) 'Analisis transkriptom panjang penuh tentang rintangan sejuk Apis cerana di Gunung Changbai semasa tempoh musim sejuk.', Gene, 830, ms 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'Keutamaan Berasaskan Integrasi Multi-Omics bagi Rangkaian Peraturan RNA Endogen Bersaing dalam Kanser Paru Sel Kecil: Ciri Molekul dan Calon Dadah', Frontiers in Onkologi, 12, hlm.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'Analisis bersepadu profil ekspresi lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA mendedahkan pandangan baru tentang mekanisme berpotensi sebagai tindak balas kepada nematod simpul akar dalam kacang', BMC Genomics, 23(1), ms 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/RAJAH/7.
Yan, Z. et al.(2022) 'Penjujukan RNA transkrip keseluruhan menyerlahkan mekanisme molekul yang dikaitkan dengan pengekalan kualiti lepas tuai dalam brokoli dengan penyinaran LED merah', Biologi dan Teknologi Lepas Tuai, 188, hlm.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
