Penjujukan RNA Kecil-Illumina
Ciri-ciri
● Penyediaan pustaka pemilihan saiz.
● Analisis bioinformatik tertumpu pada ramalan dan sasaran miRNA.
Kelebihan Perkhidmatan
●Kepakaran LuasKami telah memproses lebih 300 sampel, merangkumi pelbagai jenis sampel. Kami membawakan kepakaran yang luas kepada setiap projek.
●Kawalan Kualiti yang KetatKami melaksanakan titik kawalan teras merentasi semua peringkat, daripada penyediaan sampel hinggalah penyediaan perpustakaan, penjujukan dan bioinformatik. Pemantauan teliti kami memastikan penyampaian hasil yang berkualiti tinggi secara konsisten.
●Analisis bioinformatik yang komprehensif:Ia membolehkan pengenalpastian miRNA yang diketahui dan baharu, pengenalpastian sasaran miRNA, dan anotasi dan pengayaan fungsi yang sepadan dengan berbilang pangkalan data (KEGG, GO).
●Sokongan Pasca JualanKami faham betapa pentingnya untuk hadir, sebab itu komitmen kami melangkaui penyiapan projek dengan tempoh perkhidmatan selepas jualan selama 3 bulan. Dalam tempoh ini, kami menawarkan susulan projek, bantuan penyelesaian masalah dan sesi Soal Jawab untuk menjawab sebarang pertanyaan berkaitan keputusan.
Keperluan Sampel dan Penghantaran
| Perpustakaan | Platform | Data yang disyorkan | Kualiti Data |
| Saiz dipilih | Illumina SE50 | Bacaan 10M-20M | Q30≥85% |
Keperluan Sampel:
Nukleotida:
| Konk.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Ketulenan | Integriti |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pencemaran protein atau DNA yang terhad atau tiada langsung ditunjukkan pada gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ketinggian asas yang terhad atau tiada |
● Tumbuhan:
Akar, Batang atau Kelopak: 450 mg
Daun atau Biji: 300 mg
Buah: 1.2 g
● Haiwan:
Jantung atau Usus: 450 mg
Viscera atau Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1.5g
● Artropod:
Serangga: 9g
Krustasea: 450 mg
● Darah penuh: 2 tiub
● Sel: 106 sel-sel
● Serum dan Plasma:6 ml
Penghantaran Sampel yang Disyorkan
Bekas: Tiub emparan 2 ml (Kerajang timah tidak digalakkan)
Pelabelan sampel: Kumpulkan+replikasi contohnya A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Penghantaran:
1. Ais kering: Sampel perlu dibungkus dalam beg dan ditanam di dalam ais kering.
2. Tiub RNAstabil: Sampel RNA boleh dikeringkan dalam tiub penstabilan RNA (cth. RNAstabil®) dan dihantar dalam suhu bilik.
Aliran Kerja Perkhidmatan
Reka bentuk eksperimen
Penghantaran sampel
Pengekstrakan RNA
Pembinaan perpustakaan
Penjujukan
Analisis data
Perkhidmatan selepas jualan
Bioinformatik
● Kawalan kualiti data mentah
● Pengelasan RNA kecil
● ekspresi miRNA dan analisis ekspresi pembezaan
● gen sasaran miRNA dan anotasi gen sasaran miRNA yang diekspresikan secara berbeza
● Anotasi gen sasaran dan pengayaan fungsi gen miRNA yang diekspresikan secara berbeza
Pengenalpastian miRNA: struktur dan kedalaman
Ekspresi miRNA yang berbeza – pengelompokan hierarki
Anotasi fungsi sasaran miRNA yang dinyatakan secara berbeza
Terokai kemajuan penyelidikan yang difasilitasi oleh perkhidmatan penjujukan sRNA BMKGene melalui koleksi penerbitan yang disusun rapi.
Chen, H. et al. (2023) 'Jangkitan virus menghalang biosintesis saponin dan fotosintesis dalam Panax notoginseng',Fisiologi dan Biokimia Tumbuhan, 203, hlm. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Protein FREE1 yang mengandungi domain FYVE tumbuhan berkait rapat dengan komponen mikropemproses untuk menindas biogenesis miRNA',Laporan EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p Mengawal Perkembangan Pupa Larva dengan Menyasarkan Gen Domain 8 Seperti Faktor Pertumbuhan Epidermis Berbilang (megf8) dalam Lebah Madu, Apis mellifera',Jurnal Antarabangsa Sains Molekul, 24(6), hlm. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Analisis Bersepadu MiRNA dan Gen yang Berkaitan dengan Kualiti Daging Mendedahkan bahawa Gga-MiR-140-5p Mempengaruhi Pemendapan Lemak Intramuskular dalam Ayam',Fisiologi Selular dan Biokimia, 46(6), ms 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
