条形banner-03

Produk

Penjujukan Metagenomik -NGS

图片62

Metagenom ialah koleksi jumlah bahan genetik komuniti campuran organisma, seperti metagenom alam sekitar dan manusia. Ia mengandungi genom mikroorganisma yang boleh ditanam dan tidak boleh ditanam. Penjujukan metagenomik senapang patah dengan NGS membolehkan kajian landskap genomik rumit ini tertanam dalam sampel persekitaran dengan menyediakan lebih daripada pemprofilan taksonomi, memberikan juga cerapan terperinci tentang kepelbagaian spesies, dinamik kelimpahan dan struktur populasi yang kompleks. Di luar kajian taksonomi, metagenomik senapang patah juga menawarkan perspektif genomik berfungsi, membolehkan penerokaan gen yang dikodkan dan peranannya dalam proses ekologi. Akhirnya, penubuhan rangkaian korelasi antara unsur genetik dan faktor persekitaran menyumbang kepada pemahaman holistik tentang interaksi rumit antara komuniti mikrob dan latar belakang ekologi mereka. Kesimpulannya, penjujukan metagenomik berdiri sebagai instrumen penting untuk membongkar selok-belok genomik komuniti mikrob yang pelbagai, menerangi hubungan pelbagai rupa antara genetik dan ekologi dalam ekosistem kompleks ini.

Platform: Illumina NovaSeq dan DNBSEQ-T7


Butiran Perkhidmatan

Bioinformatik

Keputusan Demo

Penerbitan pilihan

Kelebihan Perkhidmatan

Kaedah Pengasingan dan Tanpa Penanaman untuk Pemprofilan Komuniti Mikrob: Membolehkan penjujukan bahan genetik daripada organisma yang tidak boleh ditanam.

Resolusi Tinggi: Mengesan spesies kelimpahan rendah dalam sampel persekitaran.

Analisis Bioinformatik Komprehensif:Memberi tumpuan bukan sahaja kepada kepelbagaian taksonomi tetapi juga kepada kepelbagaian fungsi masyarakat.

Pengalaman yang luas:Dengan rekod prestasi berjaya menutup pelbagai projek metagenomik dalam pelbagai domain penyelidikan dan memproses lebih 200,000 sampel, pasukan kami membawa banyak pengalaman kepada setiap projek.

Spesifikasi Perkhidmatan

Platform penjujukan

Strategi Penjujukan

Data disyorkan

Kawalan kualiti

Illumina NovaSeq atau DNBSEQ-T7

PE150

6-20Gb

S30≥85%

Keperluan Perkhidmatan

Kepekatan (ng/µL)

Jumlah amaun (ng)

Isipadu (µL)

≥1

≥30

≥20

● Tanah/enapcemar: 2-3g
● Kandungan usus-haiwan: 0.5-2g
● Kandungan usus-serangga: 0.1-0.25g
● Permukaan tumbuhan (sedimen diperkaya): 0.5-1g
● Enapan diperkaya sup penapaian): 0.2-0.5g
● Najis (haiwan besar): 0.5-2g
● Najis (tikus): 3-5butir
● Cecair lavage alveolar pulmonari: kertas penapis
● Sapuan faraj: 5-6 sapuan
● Sapuan kulit/kemaluan/air liur/tisu lembut mulut/sapuan pharyngeal/sapu rektum: 2-3 sapuan
● Mikroorganisma permukaan: 5-6 sapuan
● Badan air/udara/biofilem: kertas penapis
● Endofit: 2-3g
● Plak Pergigian: 0.5-1g

Aliran Kerja Perkhidmatan

penghantaran sampel

Contoh penghantaran

Persediaan Perpustakaan

Pembinaan perpustakaan

Sequencing

Sequencing

Analisis data

Analisis data

Perkhidmatan Selepas jualan

Perkhidmatan selepas jualan


  • Sebelumnya:
  • Seterusnya:

  • 流程图 贝贝第三版-01

    Termasuk analisis berikut:

    ● Menjujukan kawalan kualiti data

    ● Perhimpunan metagenom dan ramalan gen

    ● Anotasi gen

    ● Analisis kepelbagaian alfa taksonomi

    ● Analisis fungsi komuniti: fungsi biologi, metabolik, rintangan antibiotik

    ● Analisis tentang kepelbagaian fungsian dan taksonomi:

    Analisis kepelbagaian beta

    Analisis antara kumpulan

    Analisis korelasi: antara faktor persekitaran dan komposisi dan kepelbagaian OUT

    Analisis fungsian: CARD rintangan antibiotik

    图片63

    Analisis pembezaan laluan metabolik KEGG: peta haba laluan penting

     

    图片64

     Kepelbagaian alfa taburan taksonomi: indeks ACE

    图片65

     

    Kepelbagaian beta taburan taksonomi: PCoA

    图片66

    Terokai kemajuan yang difasilitasi oleh perkhidmatan penjujukan metagenom BMKGene dengan Illumina melalui koleksi penerbitan yang dipilih susun.

    Hai, Q. et al. (2023) 'Analisis metagenomik dan metabolomik perubahan dalam kandungan usus trout pelangi (Oncorhynchus mykiss) yang dijangkiti virus nekrosis hematopoietik berjangkit pada suhu air kultur yang berbeza',Sempadan dalam Mikrobiologi, 14, hlm. 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.

    Mao, C. et al. (2023) 'Komuniti mikrob, gen rintangan, dan risiko rintangan di tasik bandar dengan keadaan trofik yang berbeza: Pautan dalaman dan pengaruh luaran',Jurnal Pendahuluan Bahan Berbahaya, 9, hlm. 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.

    Su, M. et al. (2022) 'Analisis Metagenomik Mendedahkan Perbezaan dalam Komposisi dan Fungsi Antara Mikroorganisma Berkaitan Cecair dan Pepejal Rumen Bebiri',Sempadan dalam Mikrobiologi, 13, hlm. 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.

    Yin, J. et al. (2023) 'Mikrobiota yang berasal dari babi Ningxiang yang obes mendawai semula metabolisme karnitin untuk menggalakkan pemendapan asid lemak otot dalam babi DLY tanpa lemak',Inovasi, 4(5), hlm. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.

    Zhao, X. et al. (2023) 'Pandangan metagenomik ke dalam potensi risiko serpihan bio/plastik tidak boleh terurai dan bukan plastik di bahagian atas dan bawah muara Haihe, China',Sains Persekitaran Menyeluruh, 887, hlm. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.

    dapatkan sebut harga

    Tulis mesej anda di sini dan hantar kepada kami

    Hantar mesej anda kepada kami: