-
BMKMANU S3000_Transkriptom Ruang
Transkriptomik ruang ialah teknik yang membolehkan kita menangkap dan menggambarkan ekspresi gen dalam tisu. Ini boleh menjadi penting untuk memahami bagaimana sel berinteraksi.
Terdapat pelbagai platform untuk pendekatan ini. Dalam hal ini, BMKGene telah membangunkan Cip transkriptom Spatial BMKManu 3000, platform yang meningkatkan prestasi teknik, mencapai resolusi subselular dan membolehkan tetapan resolusi berbilang peringkat.
Cip ini merangkumi 4.2 juta bintik menggunakan teknologi mikrowell berpaten yang berlapis manik yang dimuatkan dengan prob berkod ruang. Dengan kaedah ini, selepas penangkapan dan amplifikasi, kami memperoleh pustaka cDNA yang diperkaya dengan sampel berkod yang serasi dengan Illumina.
Pada data, gabungan kod bar ruang dan UMI memastikan ketepatan dan kekhususan data yang dijana. Menggabungkan semua perkara di atas, BMKManu menyediakan tetapan data yang sangat versatil.
-
Penjujukan RNA nukleus tunggal
Perkembangan teknik penangkapan sel tunggal dan pembinaan perpustakaan tersuai, digandingkan dengan penjujukan daya pemprosesan tinggi, telah merevolusikan kajian ekspresi gen pada peringkat sel. Penemuan ini membolehkan analisis populasi sel yang kompleks dan lebih mendalam, mengatasi batasan yang berkaitan dengan purata ekspresi gen ke atas semua sel dan memelihara heterogeniti sebenar dalam populasi ini. Walaupun penjujukan RNA sel tunggal (scRNA-seq) mempunyai kelebihan yang tidak dapat dinafikan, ia menghadapi cabaran dalam tisu tertentu di mana penciptaan penggantungan sel tunggal terbukti sukar dan memerlukan sampel baharu. Di BMKGene, kami menangani halangan ini dengan menawarkan penjujukan RNA nukleus tunggal (snRNA-seq) menggunakan teknologi 10X Genomics Chromium yang canggih. Pendekatan ini meluaskan spektrum sampel yang boleh digunakan untuk analisis transkriptom pada peringkat sel tunggal.
Pengasingan nukleus dicapai melalui cip 10X Genomics Chromium yang inovatif, yang menampilkan sistem mikrofluidik lapan saluran dengan lintasan berganda. Dalam sistem ini, manik gel yang menggabungkan kod bar, primer, enzim dan nukleus tunggal dienkapsulasi dalam titisan minyak bersaiz nanoliter, membentuk Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Berikutan pembentukan GEM, lisis sel dan pembebasan kod bar berlaku dalam setiap GEM. Seterusnya, molekul mRNA menjalani transkripsi terbalik ke dalam cDNA, menggabungkan 10X kod bar dan Pengecam Molekul Unik (UMI). cDNA ini kemudiannya tertakluk kepada pembinaan perpustakaan penjujukan standard, memudahkan penerokaan profil ekspresi gen yang mantap dan komprehensif pada peringkat sel tunggal.
Platform: 10× Genomics Chromium dan Platform Illumina NovaSeq
