Sekwenzar tal-Bisulfite b'Rappreżentanza Mnaqqsa (RRBS)
Speċifikazzjonijiet tas-Servizz
Pjattaforma: Pjattaforma NovaSeq, PE150
Tip ta 'librerija: 200-400bp daħħal librerija tad-DNA trattat bisulfite
Strateġija ta' sekwenzar: Paired-End 150 bp
Irrakkomanda l-output tad-data: 10 Gb data/kampjun mhux ipproċessat
Rekwiżiti tal-Kampjun
Kwantità tad-DNA: ≥ 2ug
Konċentrazzjoni tad-DNA: ≥ 20ng/μl.
Purità: OD260/280 = 1.8 sa 2.0 mingħajr degradazzjoni jew kontaminazzjoni RNA
Analiżi tal-bijoinformatika
Fluss tax-Xogħol tas-Servizz
Kunsinna tal-kampjun
Kostruzzjoni ta' librerija
Sekwenzar
Analiżi tad-dejta
Servizzi ta' wara l-bejgħ
a.Statistika ta' referenza dwar l-allinjament tal-ġenoma
Statistika tal-mapping jinqara
Statistika tal-fond tas-sekwenzjar u l-kopertura tas-sit C
Akopertura akkumulata
Deffiċjenza tal-ġestjoni ta' kull kampjun
b.Sejbien tas-sit tal-metilazzjoni
Lista ta' livelli ta' metilazzjoni fis-sit C
BS konverżjoni
Mċitosina etilata
Distribuzzjoni tal-livell tal-metilazzjoni
c.Mappa tal-metilazzjoni
Gmadwar l-enoma
Gelement enoma
d.Tqabbil tal-livelli ta 'metilazzjoni bejn il-kampjuni
Pairwise Korrelazzjoni ta 'metilazzjoni CG
PMethylation CA-CG
Ctleqqija tal-metilazzjoni CG
d.Analiżi tal-metilazzjoni b'mod differenti
Stattiċi tad-DMR
Distribuzzjoni tat-tul DMR
Hjieklu mappa
DDistribuzzjoni MR fir-reġjun immirat
