●Pjattaformi:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten u BGI-DNB-T7
●Modi ta' sekwenzar:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kontroll tal-kwalità tal-libreriji qabel is-sekwenzjar
●Kunsinna tad-dejta tas-sekwenzjar u QC:kunsinna ta 'rapport QC u data mhux ipproċessata f'format fastq wara demultiplexing u filtrazzjoni Q30 qari.
●Versatilità tas-servizzi ta' Sekwenzar:il-klijent jista' jagħżel li jagħmel sekwenza skont il-korsija, iċ-ċellula tal-fluss jew l-ammont ta' dejta.
●Versatilità tal-pjattaformi:Il-libreriji DNB jistgħu jiġu trasferiti għal pjattaformi Illumina
●Esperjenza estensiva fuq il-pjattaforma ta' sekwenzar Illumina:b’eluf ta’ proġetti magħluqa b’diversi speċi.
●Kunsinna tar-rapport tal-QC tas-sekwenza:b'metriċi ta 'kwalità, preċiżjoni tad-dejta u prestazzjoni ġenerali tal-proġett ta' sekwenzar.
●Proċess ta' sekwenzar matur:b'ħin qasir ta' dawran.
●Kontroll Riguż tal-Kwalità: aħna nimplimentaw rekwiżiti stretti tal-QC biex niggarantixxu l-kunsinna ta 'riżultati ta' kwalità għolja b'mod konsistenti.
Ammont tad-Data (X) | Konċentrazzjoni (qPCR/nM) | Volum |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Pjattaforma | Konċentrazzjoni (qPCR/nM) | Volum |
HiSeq X Għaxar | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
Minbarra l-konċentrazzjoni u l-ammont totali, huwa meħtieġ ukoll mudell tal-quċċata adattat.
Rapport dwar il-kwalità tal-librerija huwa pprovdut qabel is-sekwenzjar, il-valutazzjoni tal-ammont tal-librerija, u l-frammentazzjoni.
Tabella 1. Statistika dwar id-dejta tas-sekwenzjar.
ID tal-kampjun | BMKID | Qari mhux ipproċessati | Dejta mhux ipproċessata (bp) | Qari nadif (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figura 1. Id-distribuzzjoni tal-kwalità tul il-qari f'kull kampjun
Figura 2. Distribuzzjoni tal-kontenut bażi
Figura 3. Distribuzzjoni tal-kontenut tal-qari fid-dejta tas-sekwenzjar