-
Analiżi tal-Assoċjazzjoni tal-ġenoma kollu
Studju ta 'assoċjazzjoni mal-ġenoma kollu (GWAS) għandu l-għan li jidentifika varjanti ġenetiċi (ġenotip) li assoċjati ma' karatteristiċi speċifiċi (fenotip).Studju GWAS jinvestiga markaturi ġenetiċi jaqsmu l-ġenoma kollu ta 'numru kbir ta' individwi u jbassar assoċjazzjonijiet ġenotip-fenotip permezz ta 'analiżi statistika fil-livell tal-popolazzjoni.Ġie applikat b'mod wiesa 'f'riċerka dwar mard tal-bniedem u tħaffir tal-ġeni funzjonali fuq karatteristiċi kumplessi ta' annimali jew pjanti.
-
Sekwenzar ta' RNA b'nukleu wieħed
L-avvanz fil-qbid ta’ ċellula waħda u t-teknika ta’ kostruzzjoni ta’ librerija individwali li tgħaqqad ma’ sekwenzar ta’ produttività għolja tippermetti studji dwar l-espressjoni tal-ġeni fuq bażi ta’ ċellula b’ċellula.Jippermetti analiżi tas-sistema aktar profonda u kompluta fuq popolazzjonijiet ta 'ċelluli kumplessi, li fiha fil-biċċa l-kbira tevita l-maskra tal-eteroġeneità tagħhom billi tieħu medja taċ-ċelloli kollha.
Madankollu, xi ċelluli mhumiex adattati biex isiru f'sospensjoni ta 'ċellula waħda, għalhekk metodi oħra ta' preparazzjoni ta 'kampjuni - hija meħtieġa estrazzjoni tan-nukleu mit-tessuti, jiġifieri, nukleu jiġi estratt direttament minn tessuti jew ċellula u ppreparat f'sospensjoni ta' nukleu wieħed għal nukleu wieħed. sekwenzar taċ-ċelluli.
BMK jipprovdi servizz ta' sekwenzar ta' RNA b'ċellula waħda bbażat fuq 10 × Genomics Chromium TM.Dan is-servizz intuża ħafna fi studji dwar studji relatati mal-mard, bħad-divrenzjar taċ-ċelluli immuni, l-eteroġeneità tat-tumur, l-iżvilupp tat-tessuti, eċċ.
Ċippa tat-traskriptome spazjali: 10 × Genomics
Pjattaforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekwenzar tal-Ġenoma Sħiħ tal-Pjanti/Annimali
Is-sekwenzjar mill-ġdid tal-ġenoma kollu, magħruf ukoll bħala WGS, jippermetti l-iżvelar ta’ mutazzjonijiet kemm komuni kif ukoll rari fuq il-ġenoma kollu inkluż Polimorfiżmu Nukleotidu Uniku (SNP), Tħassir tal-Inserzjoni (InDel), Varjazzjoni tal-Istruttura (SV), u Varjazzjoni tan-Numru Kopja (CNV). ).L-SVs jiffurmaw porzjon akbar tal-bażi tal-varjazzjoni mill-SNPs u għandhom impatt akbar fuq il-ġenoma, li għandu effett sinifikanti fuq organiżmi ħajjin.Is-sekwenzi mill-ġdid tal-qari fit-tul jippermetti identifikazzjoni aktar preċiża ta 'frammenti kbar u varjazzjonijiet ikkumplikati minħabba li qari fit-tul jagħmluha ħafna aktar faċli għall-qsim tal-kromożomi fuq reġjuni kkumplikati bħal ripetizzjonijiet tandem, reġjuni b'ħafna GC/AT, u reġjuni iper-varjabbli.
Pjattaforma: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spazjali Transcriptome
L-organizzazzjoni spazjali taċ-ċelloli għandha rwol vitali f'diversi proċessi bijoloġiċi, bħall-infiltrazzjoni immuni, l-iżvilupp tal-embrijuni, eċċ Is-sekwenzjar spazjali tat-traskriptome, li jindika profil tal-espressjoni tal-ġeni filwaqt li jżomm informazzjoni dwar il-pożizzjoni spazjali, ipprovda għarfien kbir dwar l-arkitettura tat-tessuti fil-livell tat-traskriptome.Bl-iżvilupp tat-teknoloġija, il-morfoloġija tat-tessut ultra-ċara u d-differenza strutturali reali ta 'espressjoni molekulari spazjali jeħtieġ li jiġu studjati b'riżoluzzjoni ogħla.BMKGENE jipprovdi servizz ta' sekwenzar tat-traskriptome spazjali komprensiv u one-stop minn kampjuni għal għarfien bijoloġiku.
It-teknoloġiji tat-traskriptomika spazjali taw is-setgħa perspettivi ġodda f'arena ta 'riċerka diversa billi solviet il-profil tal-espressjoni tal-ġeni b'kontenut spazjali f'kampjuni eteroġeni.
Ċippa tat-traskriptome spazjali: BMKMANU S1000
Pjattaforma: Illumina NovaSeq 6000
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
L-Espressjoni tal-Ġene Spazjali Visium hija teknoloġija ta' sekwenzar tat-transcriptome spazjali mainstream għall-klassifikazzjoni tat-tessuti bbażata fuq l-mRNA totali.Ippjana t-traskriptome kollu b'kuntest morfoloġiku biex tiskopri għarfien ġdid dwar l-iżvilupp normali, il-patoloġija tal-mard u r-riċerka translazzjonali klinika.BMKGENE jipprovdi servizz ta' sekwenzar tat-traskriptome spazjali komprensiv u one-stop minn kampjuni għal għarfien bijoloġiku.
It-teknoloġiji tat-traskriptomika spazjali taw is-setgħa perspettivi ġodda f’arena ta’ riċerka diversa billi solviet il-profil tal-espressjoni tal-ġeni b’kontenut spazjali f’kampjuni eteroġeni.
Ċippa tat-traskriptome spazjali: 10x Genomics Visium
Pjattaforma:Illumina NovaSeq 6000
-
Sekwenzar ta' mRNA ta' tul sħiħ-Nanopore
Is-sekwenzjar tal-RNA kien għodda imprezzabbli għal analiżi komprensiva tat-traskriptome.Bla dubju, is-sekwenzjar tradizzjonali tal-qari qasir kiseb ħafna żvilupp importanti hawn.Madankollu, ħafna drabi tiltaqa 'ma' limitazzjonijiet fl-identifikazzjonijiet tal-isoformi fit-tul sħiħ, il-kwantifikazzjoni, il-preġudizzju tal-PCR.
Is-sekwenzjar tan-Nanopore jiddistingwi ruħu minn pjattaformi oħra ta 'sekwenzjar, peress li n-nukleotidi jinqraw direttament mingħajr sintesi tad-DNA u jiġġenera qari fit-tul f'għexieren ta' kilobases.Dan jagħti s-setgħa lill-qari dirett li jaqsam traskrizzjonijiet fit-tul sħiħ u li jindirizza l-isfidi fi studji fil-livell tal-isoforma.
Pjattaforma：Nanopore PromethION
Librerija:cDNA-PCR
-
Sekwenzar ta 'mRNA ta' tul sħiħ -PacBio
De novosekwenzar tat-traskriptome full-length, magħruf ukoll bħalaDe novoIso-Seq jieħu l-vantaġġi tas-sekwenzjar PacBio fit-tul tal-qari, li jippermetti sekwenzar ta 'molekuli ta' cDNA full-length mingħajr ebda waqfien.Dan jevita kompletament kwalunkwe żball iġġenerat fil-passi tal-assemblaġġ tat-traskrizzjoni u jibni settijiet unigene b'riżoluzzjoni fil-livell tal-isoforma.Dan is-settijiet unigene jipprovdi informazzjoni ġenetika qawwija bħala "ġenoma ta 'referenza" fil-livell tat-traskriptome.Barra minn hekk, flimkien mad-dejta tas-sekwenzjar tal-ġenerazzjoni li jmiss, dan is-servizz jagħti s-setgħa kwantifikazzjoni preċiża tal-espressjoni fil-livell tal-isoforma.
Pjattaforma: PacBio Sequel IILibrerija: Librerija tal-qanpiena SMRT -
Sekwenzar tal-mRNA Ewkarjotiku-Illumina
Is-sekwenzjar tal-mRNA jippermetti profil tal-mRNAs kollha traskritti miċ-ċelloli taħt kundizzjonijiet speċifiċi.Hija teknoloġija qawwija biex tiżvela l-profil tal-espressjoni tal-ġeni, l-istrutturi tal-ġeni u l-mekkaniżmi molekulari ta 'ċerti proċessi bijoloġiċi.Sal-lum, is-sekwenzjar tal-mRNA ġie użat ħafna fir-riċerka fundamentali, id-dijanjostika klinika, l-iżvilupp tad-droga, eċċ.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekwenzar tal-mRNA-Illumina mhux ibbażat fuq Referenza
Is-sekwenzjar tal-mRNA jadotta teknika ta' sekwenzar tal-ġenerazzjoni li jmiss (NGS) biex jaqbad il-messaġġier RNA(mRNA) forma Eukaryote f'perjodu speċifiku li xi funzjonijiet speċjali qed jattivaw.L-itwal traskrizzjoni spliced kienet imsejħa 'Unigene' u użata bħala s-sekwenza ta 'referenza għal analiżi sussegwenti, li hija mezz effettiv biex jiġi studjat il-mekkaniżmu molekulari u n-netwerk regolatorju tal-ispeċi mingħajr referenza.
Wara l-assemblaġġ tad-dejta tat-traskriptome u l-annotazzjoni funzjonali unigene
(1)Analiżi SSR, tbassir CDS u struttura tal-ġeni se jiġu preformati.
(2) Se titwettaq kwantifikazzjoni ta 'espressjoni unigene f'kull kampjun.
(3) Unigenes espressi b'mod differenzjali bejn kampjuni (jew gruppi) se jiġu skoperti abbażi tal-espressjoni unigene
(4)Se jsiru r-raggruppament, annotazzjoni funzjonali u analiżi ta' arrikkiment ta' unigenes espressi b'mod differenzjali
-
Sekwenzar twil mhux ta 'kodifikazzjoni-Illumina
RNAs twal mhux kodifikanti (lncRNAs) huma tip ta 'molekuli RNA b'tul li jaqbeż il-200 nt, li huma kkaratterizzati minn potenzjal ta' kodifikazzjoni estremament baxx.LncRNA, bħala membru ewlieni fl-RNAs li ma jikkodifikawx, jinsab prinċipalment fin-nukleu u fil-plażma.L-iżvilupp fit-teknoloġija tas-sekwenzjar u l-bijoinformatika jippermetti l-identifikazzjoni ta 'bosta lncRNAs ġodda u jassoċja dawk ma' funzjonijiet bijoloġiċi.Evidenzi akkumulattivi jissuġġerixxu li lncRNA huwa involut b'mod wiesa 'f'regolazzjoni epiġenetika, regolazzjoni ta' traskrizzjoni u regolazzjoni ta 'wara t-traskrizzjoni.
-
Sekwenzar ta 'RNA żgħir-Illumina
RNA żgħir tirreferi għal klassi ta 'molekuli RNA li ma jikkodifikawx li huma ġeneralment inqas minn 200nt fit-tul, inkluż mikro RNA (miRNA), RNA ta' interferenza żgħira (siRNA), u RNA ta 'interazzjoni piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) hija klassi ta 'RNA żgħir endoġenu b'tul ta' madwar 20-24nt, li għandu varjetà ta 'rwoli regolatorji importanti fiċ-ċelloli.miRNA involut f'ħafna proċessi tal-ħajja li jiżvelaw tessut – speċifiku u stadju – espressjoni speċifika u kkonservat ħafna fi speċi differenti.
-
circRNA sekwenzar-Illumina
Is-sekwenzjar tat-traskriptome kollu huwa ddisinjat biex jipprofila t-tipi kollha ta 'molekuli RNA, inklużi RNAs kodifikanti (mRNA) u mhux kodifikanti (inklużi lncRNA, circRNA u miRNA) li huma traskritti minn ċelloli speċifiċi f'ċertu ħin.Is-sekwenzjar tat-transcriptome sħiħ, magħruf ukoll bħala "sekwenzjar tal-RNA totali" għandu l-għan li jiżvela netwerks regolatorji komprensivi fil-livell tat-traskriptome.Filwaqt li tieħu vantaġġ mit-teknoloġija NGS, sekwenzi ta 'prodotti tat-traskriptome sħaħ huma disponibbli għall-analiżi ceRNA u analiżi konġunta tal-RNA, li tipprovdi l-ewwel pass lejn karatterizzazzjoni funzjonali.Tiżvela netwerk regolatorju ta 'ceRNA ibbażat fuq circRNA-miRNA-mRNA.
