-
Sekwenzar Metagenomic -NGS
Metagenoma hija ġabra tal-materjal ġenetiku totali ta 'komunità mħallta ta' organiżmi, bħal metaġenomi ambjentali u umani. Fiha ġenomi kemm ta 'mikro-organiżmi kultivabbli kif ukoll mhux kultivabbli. Is-sekwenzjar metagenomic Shotgun b'NGS jippermetti l-istudju ta 'dawn il-pajsaġġi ġenomiċi kkomplikati inkorporati f'kampjuni ambjentali billi jipprovdu aktar minn profili tassonomiċi, li jagħtu wkoll għarfien granulari dwar id-diversità tal-ispeċi, id-dinamika tal-abbundanza u l-istrutturi kumplessi tal-popolazzjoni. Lil hinn mill-istudji tassonomiċi, il-metagenomics shotgun toffri wkoll perspettiva ta 'ġenomika funzjonali, li tippermetti l-esplorazzjoni ta' ġeni kodifikati u r-rwoli putattivi tagħhom fi proċessi ekoloġiċi. Fl-aħħarnett, l-istabbiliment ta 'netwerks ta' korrelazzjoni bejn elementi ġenetiċi u fatturi ambjentali jikkontribwixxi għal fehim olistiku tal-interazzjoni kkomplikata bejn il-komunitajiet mikrobjali u l-isfond ekoloġiku tagħhom. Bħala konklużjoni, is-sekwenzjar metagenomic stands bħala strument ċentrali biex jinkixfu l-intricacies ġenomiċi ta 'komunitajiet mikrobjali diversi, u jdawwal ir-relazzjonijiet multidimensjonali bejn il-ġenetika u l-ekoloġija fi ħdan dawn l-ekosistemi kumplessi.
Pjattaformi: Illumina NovaSeq u DNBSEQ-T7
-
Sekwenzar Metagenomic-TGS
Metagenoma hija ġabra ta' materjal ġenetiku ta' komunità mħallta ta' organiżmi, bħal metaġenomi ambjentali u umani. Fiha ġenomi kemm ta 'mikro-organiżmi kultivabbli kif ukoll mhux kultivabbli. Is-sekwenzjar metaġenomic jippermetti l-istudju ta 'dawn il-pajsaġġi ġenomiċi kkomplikati inkorporati f'kampjuni ekoloġiċi billi jipprovdi aktar minn profili tassonomiċi. Joffri wkoll perspettiva ġenomika funzjonali billi jesplora l-ġeni kodifikati u r-rwoli putattivi tagħhom fil-proċessi ambjentali. Filwaqt li l-approċċi tradizzjonali ta 'shotgun b'sekwenzjar ta' Illumina intużaw ħafna fi studji metaġenomika, il-miġja ta 'sekwenzjar ta' qari fit-tul Nanopore u PacBio bidlu l-qasam. It-teknoloġija Nanopore u PacBio isaħħu l-analiżi bijoinformatiċi downstream, notevolment l-assemblaġġ tal-metaġenoma, u jiżguraw assemblaġġi aktar kontinwi. Ir-rapporti jindikaw li l-metagenomics ibbażati fuq Nanopore u PacBio ġġeneraw b'suċċess ġenomi batteriċi kompluti u magħluqa minn mikrobijomi kumplessi (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). L-integrazzjoni tal-qari ta 'Nanopore mal-qari ta' Illumina jipprovdi approċċ strateġiku għall-korrezzjoni tal-iżbalji, li ttaffi l-eżattezza baxxa inerenti ta 'Nanopore. Din il-kombinazzjoni sinerġistika tisfrutta s-saħħiet ta 'kull pjattaforma ta' sekwenzar, li toffri soluzzjoni robusta biex tegħleb il-limitazzjonijiet potenzjali u tavvanza l-preċiżjoni u l-affidabbiltà tal-analiżi metaġenomika.
Pjattaforma: Nanopore PromethION 48, Illumia u PacBio Revio
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Il-ġeni rRNA 16S u 18S, flimkien mar-reġjun Internal Transcrited Spacer (ITS), iservu bħala markaturi tal-marki tas-swaba' molekulari pivotali minħabba l-kombinazzjoni tagħhom ta 'reġjuni kkonservati ħafna u iper-varjabbli, li jagħmluhom għodod imprezzabbli għall-karatterizzazzjoni ta' organiżmi prokarjotiċi u ewkarjotiċi. L-amplifikazzjoni u s-sekwenzjar ta 'dawn ir-reġjuni joffru approċċ mingħajr iżolament għall-investigazzjoni tal-kompożizzjoni u d-diversità tal-mikrobi f'diversi ekosistemi. Filwaqt li s-sekwenzjar ta 'Illumina tipikament jimmira reġjuni ipervarjabbli qosra bħal V3-V4 ta' 16S u ITS1, intwera li l-annotazzjoni tassonomika superjuri tista 'tinkiseb billi tissekwenza t-tul sħiħ ta' 16S, 18S, u ITS. Dan l-approċċ komprensiv jirriżulta f'perċentwali ogħla ta 'sekwenzi klassifikati b'mod preċiż, li jikseb livell ta' riżoluzzjoni li jestendi għall-identifikazzjoni tal-ispeċi. Il-pjattaforma tas-sekwenzjar Single-Molecule Real-Time (SMRT) ta 'PacBio tispikka billi tipprovdi qari fit-tul preċiżi ħafna (HiFi) li jkopru l-amplicons full-length, rivaling mal-preċiżjoni tas-sekwenzjar Illumina. Din il-kapaċità tippermetti lir-riċerkaturi jiksbu vantaġġ mhux imqabbel - ħarsa panoramika tal-pajsaġġ ġenetiku. Il-kopertura estiża tgħolli b'mod sinifikanti r-riżoluzzjoni fl-annotazzjoni tal-ispeċi, partikolarment fi ħdan komunitajiet batterjali jew fungali, li tippermetti fehim aktar profond tal-kumplessità tal-popolazzjonijiet tal-mikrobi.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Is-sekwenzjar tal-Amplicon bit-teknoloġija Illumina, li jimmira speċifikament lejn il-markaturi ġenetiċi 16S, 18S, u ITS, huwa metodu b'saħħtu biex tiżvela l-filoġenija, it-tassonomija u l-abbundanza tal-ispeċi fi ħdan il-komunitajiet mikrobjali. Dan l-approċċ jinvolvi s-sekwenzjar tar-reġjuni ipervarjabbli tal-markaturi ġenetiċi tad-dar. Oriġinarjament introdott bħala marki tas-swaba' molekulari minnWoeses et alfl-1977, din it-teknika revoluzzjonat il-profil tal-mikrobijoma billi ppermettiet analiżi mingħajr iżolament. Permezz tas-sekwenzjar ta '16S (batterji), 18S (fungi), u Internal Transcrited Spacer (ITS, fungi), ir-riċerkaturi jistgħu jidentifikaw mhux biss speċi abbundanti iżda wkoll dawk rari u mhux identifikati. Addottat b'mod wiesa 'bħala għodda ċentrali, is-sekwenzjar tal-amplicon sar strumentali biex jintgħaraf kompożizzjonijiet mikrobjali differenzjali f'ambjenti diversi, inklużi l-ħalq tal-bniedem, l-imsaren, l-ippurgar, u lil hinn.
-
Sekwenzar mill-ġdid tal-Ġenoma Sħiħ Batterjali u Fungali
Il-proġetti ta' sekwenzar mill-ġdid tal-ġenomu kollu batterjali u fungali huma kruċjali għall-avvanz tal-ġenomika mikrobjali billi jippermettu t-tlestija u t-tqabbil tal-ġenomi mikrobjali. Dan jiffaċilita l-inġinerija tal-fermentazzjoni, l-ottimizzazzjoni tal-proċessi industrijali, u l-esplorazzjoni tal-mogħdijiet sekondarji tal-metaboliżmu. Barra minn hekk, is-sekwenzjar mill-ġdid fungali u batterjali huwa kruċjali għall-fehim tal-adattament ambjentali, l-ottimizzazzjoni tar-razez, u l-iżvelar tad-dinamika tal-evoluzzjoni ġenetika, b'implikazzjonijiet wesgħin fil-mediċina, l-agrikoltura u x-xjenza ambjentali.
-
Sekwenzar ta' RNA prokarjotiku
Is-sekwenzjar tal-RNA jagħti s-setgħa lill-profil komprensiv tat-traskrizzjonijiet tal-RNA kollha fi ħdan iċ-ċelloli taħt kundizzjonijiet speċifiċi. Din it-teknoloġija avvanzata sservi bħala għodda qawwija, li tikxef profili kkomplikati ta 'espressjoni tal-ġeni, strutturi tal-ġeni, u mekkaniżmi molekulari assoċjati ma' proċessi bijoloġiċi diversi. Adottat ħafna fir-riċerka fundamentali, id-dijanjostika klinika, u l-iżvilupp tad-droga, is-sekwenzjar tal-RNA joffri għarfien dwar l-intricacies tad-dinamika ċellulari u r-regolamentazzjoni ġenetika. L-ipproċessar tal-kampjun tal-RNA prokarjotiku tagħna huwa mfassal għal traskriptomi prokarjotiċi, li jinvolvi t-tnaqqis tal-rRNA u l-preparazzjoni tal-librerija direzzjonali.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq
-
Is-Sekwenzar tal-Metatranscriptome
Billi juża t-teknoloġija ta' sekwenzar Illumina, is-servizz ta' sekwenzar tal-metatranscriptome ta 'BMKGENE jiżvela l-espressjoni tal-ġeni dinamika ta' firxa diversa ta 'mikrobi, li jkopru ewkarjoti sa prokarjoti u viruses, f'ambjenti naturali bħall-ħamrija, l-ilma, il-baħar, l-ippurgar u l-imsaren. Is-servizz komprensiv tagħna jagħti s-setgħa lir-riċerkaturi biex jidħlu fil-profili kompluti tal-espressjoni tal-ġeni tal-komunitajiet mikrobjali kumplessi. Lil hinn mill-analiżi tassonomika, is-servizz tagħna ta 'sekwenzjar tal-metatraskriptomi jiffaċilita l-esplorazzjoni fl-arrikkiment funzjonali, u jitfa' dawl fuq il-ġeni espressi b'mod differenzjali u r-rwoli tagħhom. Skopri minjiera ta 'għarfien bijoloġiku hekk kif tinnaviga l-pajsaġġi kumplessi ta' espressjoni tal-ġeni, diversità tassonomika, u dinamika funzjonali fi ħdan dawn in-niċeċ ambjentali diversi.
-
Assemblea De novo tal-Ġenoma Fungali
BMKGENE joffri soluzzjonijiet versatili għall-ġenomi fungali, li jaħseb għall-ħtiġijiet diversi ta 'riċerka u l-kompletezza mixtieqa tal-ġenoma. L-użu ta' sekwenzar tal-Illumina b'qari qasir waħdu jippermetti l-ġenerazzjoni ta' abbozz tal-ġenoma. Qari qosra u sekwenzar qari fit-tul bl-użu ta 'Nanopore jew Pacbio huma kkombinati għal ġenoma fungali aktar raffinat b'kontigs itwal. Barra minn hekk, l-integrazzjoni tas-sekwenzjar Hi-C tkompli ttejjeb il-kapaċitajiet, li tippermetti l-kisba ta 'ġenoma komplet fil-livell tal-kromożomi.
-
Assemblaġġ tal-Ġenoma Batterjali De novo
Aħna nipprovdu servizz komplut ta 'assemblaġġ tal-ġenoma batterjali, li jiggarantixxu 0 lakuni. Dan huwa possibbli billi jiġu integrati teknoloġiji ta 'sekwenzjar ta' qari fit-tul, bħal Nanopore u PacBio għall-assemblaġġ u sekwenzar ta 'qari qasir ma' Illumina għall-validazzjoni tal-assemblaġġ u l-korrezzjoni tal-iżbalji tal-qari ONT. Is-servizz tagħna jipprovdi l-fluss tax-xogħol bijoinformatiku sħiħ mill-assemblaġġ, annotazzjoni funzjonali, u analiżi bijoinformatika avvanzata, li jissodisfaw miri speċifiċi ta 'riċerka. Dan is-servizz jippermetti l-iżvilupp ta’ ġenomi ta’ referenza preċiżi għal diversi studji ġenetiċi u ġenomiċi. Barra minn hekk, tifforma l-bażi għal applikazzjonijiet bħall-ottimizzazzjoni tar-razza, l-inġinerija ġenetika u l-iżvilupp tat-teknoloġija mikrobjali, li tiżgura dejta ġenomika affidabbli u mingħajr vojt kruċjali għall-avvanz tal-għarfien xjentifiku u l-innovazzjoni bijoteknoloġika.