ผู้ผลิตและผู้จำหน่ายผลิตภัณฑ์

การประกอบจีโนม T2T | การจัดลำดับดีเอ็นเอแบบยาวพิเศษ

T2T (Telomere-to-Telomere) Genome คือมาตรฐานสูงสุดสำหรับการประกอบจีโนมคุณภาพสูง ซึ่งหมายถึงการสร้างจีโนมระดับโครโมโซมแบบไร้ช่องว่าง ครอบคลุมตั้งแต่เทโลเมียร์หนึ่งไปยังอีกเทโลเมียร์หนึ่ง และทำลายข้อจำกัดของการแตกตัวของจีโนมในการประกอบจีโนมแบบดั้งเดิม

ด้วยเทคโนโลยีการจัดลำดับดีเอ็นเอแบบอ่านยาวพิเศษ ONT และการผสานรวมกับการจัดลำดับดีเอ็นเอเชิงลึกแบบหลายแพลตฟอร์ม พร้อมด้วยไปป์ไลน์ชีวสารสนเทศที่ได้รับการปรับให้เหมาะสม โซลูชันจีโนม T2T ของ BMKGENE มุ่งเป้าไปที่ “บริเวณมืด” ในจีโนมที่ยากต่อการเข้าถึงมากที่สุด ได้แก่ เทโลเมียร์ (สารประกอบนิวคลีโอโปรตีนเฉพาะที่ปลายโครโมโซมของยูคาริโอต) เซนโทรเมียร์ของสิ่งมีชีวิตชั้นสูง (อาร์เรย์การทำซ้ำแบบเรียงต่อกันขนาดใหญ่) และบริเวณการทำซ้ำที่ซับซ้อนและแฮพลอไทป์เฮเทอโรไซกัสอื่นๆ ซึ่งไม่สามารถแก้ไขได้ด้วยการจัดลำดับแบบอ่านยาวมาตรฐานมานานแล้ว แตกต่างจากการอ่านยาวแบบเดิมที่ไม่สามารถข้ามบริเวณเหล่านี้ได้และทำให้เกิดการยุบตัวของลำดับหรือคอนติ๊กแบบไคเมอริก การอ่านยาวพิเศษของ ONT สามารถครอบคลุมช่องว่างที่ไม่สามารถประกอบได้และบริเวณที่ซับซ้อน BMKGene มุ่งมั่นที่จะส่งมอบจีโนม T2T คุณภาพสูงที่ปราศจากช่องว่างสำหรับสิ่งมีชีวิตหลากหลายชนิด

การสร้างจีโนมแบบ T2T ช่วยปลดล็อกพื้นที่จีโนมที่ซับซ้อนซึ่งก่อนหน้านี้ไม่สามารถเข้าถึงได้ เติมเต็มช่องว่างการวิจัยที่สำคัญ และให้ข้อมูลพื้นฐานที่แข็งแกร่งและมีความแม่นยำสูงสำหรับการศึกษาเชิงลึก รวมถึงวิวัฒนาการของสิ่งมีชีวิต การค้นหาหน้าที่ของยีน การผสมพันธุ์ระดับโมเลกุล การแพทย์แม่นยำ และการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ล้ำสมัยอื่นๆ

สอบถาม รายละเอียด
โปรตีโอมิกส์

โปรตีโอมิกส์มุ่งเน้นไปที่โปรตีน ซึ่งเป็นผู้ดำเนินการกิจกรรมทางชีวภาพและมีบทบาทสำคัญในการควบคุมการถอดรหัสทางพันธุกรรมของสิ่งมีชีวิต โดยจะวิเคราะห์องค์ประกอบ ระดับการแสดงออก และสถานะการเปลี่ยนแปลงของโปรตีนทั้งหมดที่เปลี่ยนแปลงไปในเนื้อเยื่อหรือเซลล์ เพื่อศึกษาผลกระทบที่สำคัญของการเปลี่ยนแปลงปริมาณโปรตีโอมต่อกระบวนการทางชีวภาพต่างๆ มีการประยุกต์ใช้อย่างกว้างขวางในด้านการแพทย์ การเกษตร และการเลี้ยงสัตว์ โปรตีโอมิกส์เชิงคุณภาพใช้เทคโนโลยีการระบุโปรตีน HPLC-MS/MS ในการระบุตัวอย่างต่างๆ เช่น แถบเจล IP และตัวอย่าง CO-IP/Pull down โปรตีโอมิกส์เชิงปริมาณบรรลุการวัดปริมาณและการระบุโปรตีนทั้งหมดที่แสดงออกโดยจีโนมหรือในระบบผสมที่ซับซ้อนได้อย่างแม่นยำ เทคโนโลยีโปรตีโอมิกส์เชิงปริมาณในปัจจุบันส่วนใหญ่แบ่งออกเป็นวิธีการติดฉลาก (TMT) และวิธีการไม่ติดฉลาก (Label Free, DIA, PRM) BMKGENE ให้บริการโซลูชันโปรตีโอมิกส์แบบหลายแพลตฟอร์มและหลายเทคโนโลยี

สอบถาม รายละเอียด
เมตาโบโลมิกส์

เมตาโบโลมิกส์ ซึ่งเป็นสาขาต่อยอดจากจีโนมิกส์ มุ่งเป้าไปที่สารโมเลกุลขนาดเล็กที่มีน้ำหนักโมเลกุลน้อยกว่า 1500 ดาลตัน ทำให้เมตาโบไลต์สามารถสะท้อนการตอบสนองของสิ่งมีชีวิตต่อสิ่งเร้าภายนอกและการเปลี่ยนแปลงทางสรีรวิทยา/พยาธิวิทยาได้อย่างละเอียดอ่อนยิ่งขึ้น การเปลี่ยนแปลงระดับเมตาโบไลต์ที่เกิดจากความแปรผันทางพันธุกรรมก็อยู่ในขอบเขตการวิจัยของสาขานี้เช่นกัน ซึ่งเป็นการเปิดมุมมองการวิจัยใหม่ๆ

BMKGENE ให้บริการด้านเมตาโบลิกส์อย่างครบวงจร รวมถึงเมตาโบลิกส์แบบไม่เจาะจงเป้าหมาย เมตาโบลิกส์แบบเจาะจงเป้าหมาย และเมตาโบลิกส์แบบเจาะจงเป้าหมาย โดยใช้เทคนิคโครมาโทกราฟีของเหลว-แมสสเปกโทรเมตรี (LC-MS) หรือโครมาโทกราฟีแก๊ส-แมสสเปกโทรเมตรี (GC-MS) เพื่อตรวจจับการเปลี่ยนแปลงแบบไดนามิกของสารเมตาโบไลต์โมเลกุลเล็กส่วนใหญ่ในสิ่งมีชีวิตก่อนและหลังการกระตุ้นจากภายนอก หัวใจสำคัญของบริการเหล่านี้คือการระบุสารเมตาโบไลต์ที่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญระหว่างกลุ่มทดลองและกลุ่มควบคุม และสำรวจความสัมพันธ์ของสารเหล่านั้นกับการเปลี่ยนแปลงทางสรีรวิทยา/พยาธิวิทยาและกลไกพื้นฐานที่เกี่ยวข้องต่อไป

สอบถาม รายละเอียด
การจัดลำดับ mRNA/LncRNA/CircRNA ของเอ็กโซโซม - อิลลูมินา

เอ็กโซโซมเป็นถุงขนาดเล็กที่เซลล์หลั่งออกมา โดยทั่วไปมีเส้นผ่านศูนย์กลางตั้งแต่ 30 ถึง 100 นาโนเมตร ถุงเหล่านี้บรรจุ RNA หลายชนิด เชื่อกันว่าเอ็กโซโซมมีบทบาทสำคัญในการสื่อสารระหว่างเซลล์ การตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน และการพัฒนาของโรค และสามารถแพร่กระจายไปยังส่วนอื่นๆ ของร่างกายผ่านของเหลวในร่างกาย เช่น พลาสมา น้ำลาย และปัสสาวะ พวกมันนำพาสารชีวภาพจำเพาะเพื่อควบคุมการทำงานของเซลล์ผู้รับ ส่งผลต่อสภาวะทางสรีรวิทยาของเซลล์ เอ็กโซโซมยังถือว่ามีบทบาทสำคัญในการพัฒนาของโรคต่างๆ รวมถึงมะเร็ง โรคทางระบบประสาทเสื่อม และภาวะอักเสบ การวิจัยเกี่ยวกับเอ็กโซโซมนำเสนอข้อมูลเชิงลึกและวิธีการใหม่ๆ สำหรับการวินิจฉัย การรักษา และการป้องกันโรค

สอบถาม รายละเอียด
การจัดลำดับ RNA ขนาดเล็กในเอ็กโซโซม - อิลลูมินา

เอ็กโซโซมเป็นถุงขนาดเล็กที่เซลล์หลั่งออกมา โดยทั่วไปมีเส้นผ่านศูนย์กลางตั้งแต่ 30 ถึง 100 นาโนเมตร ถุงเหล่านี้บรรจุ RNA หลายชนิด ในบรรดาชนิดของ RNA ในเอ็กโซโซมนั้น ไมโครอาร์เอ็นเอ (miRNA) เป็นชนิดที่พบได้บ่อยที่สุดและได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวาง miRNA เป็นอาร์เอ็นเอขนาดเล็กที่ไม่เข้ารหัส มีความยาวประมาณ 18-25 นิวคลีโอไทด์ พวกมันทำหน้าที่ควบคุมการแสดงออกของยีนหลังการถอดรหัสโดยการจับกับบริเวณที่ไม่ถูกถอดรหัส 3′ (3′ UTR) ของ mRNA เป้าหมาย ซึ่งเป็นการควบคุมการแสดงออกของยีน ตัวอย่างเช่น เอ็กโซโซมที่หลั่งออกมาจากเซลล์มะเร็งบางชนิดมี miRNA เฉพาะ เช่น miR-126 และ miR-92a miRNA เหล่านี้สามารถส่งผลต่อการแสดงออกของยีนในเซลล์ผู้รับและส่งเสริมการสร้างหลอดเลือดใหม่ในเนื้องอก (Tomohiro Umezu และคณะ, Oncogene, 2012)

สอบถาม รายละเอียด
BMKMANU S3000_ทรานสคริปโตมเชิงพื้นที่

ทรานสคริปโตมิกส์เชิงพื้นที่เป็นเทคนิคที่ช่วยให้เราสามารถบันทึกและแสดงภาพการแสดงออกของยีนภายในเนื้อเยื่อ ซึ่งมีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการทำความเข้าใจปฏิสัมพันธ์ระหว่างเซลล์

มีแพลตฟอร์มที่หลากหลายสำหรับวิธีการนี้ ในเรื่องนี้ BMKGene ได้พัฒนา BMKManu 3000 Spatial Transcriptome Chip ซึ่งเป็นแพลตฟอร์มที่ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของเทคนิคนี้ โดยสามารถเข้าถึงความละเอียดระดับเซลล์ย่อยและตั้งค่าความละเอียดได้หลายระดับ

ชิปนี้บรรจุจุดข้อมูล 4.2 ล้านจุด โดยใช้เทคโนโลยีที่จดสิทธิบัตรแล้ว ซึ่งประกอบด้วยไมโครเวลล์ที่เรียงตัวเป็นชั้นๆ และบรรจุลูกปัดที่มีโพรบที่มีบาร์โค้ดเฉพาะที่ ด้วยวิธีนี้ หลังจากจับและขยายสัญญาณแล้ว เราจะได้ไลบรารี cDNA ที่อุดมไปด้วยตัวอย่างที่มีบาร์โค้ด ซึ่งเข้ากันได้กับระบบ Illumina

ในส่วนของข้อมูล การผสมผสานระหว่างบาร์โค้ดเชิงพื้นที่และ UMI ช่วยให้มั่นใจได้ถึงความถูกต้องและเฉพาะเจาะจงของข้อมูลที่สร้างขึ้น เมื่อรวมทุกอย่างข้างต้นแล้ว BMKManu จึงมอบการตั้งค่าข้อมูลที่มีความยืดหยุ่นสูงมาก

สอบถาม รายละเอียด
ไลบรารีสำเร็จรูปของ DNBSEQ

DNBSEQ ซึ่งพัฒนาโดย MGI เป็นเทคโนโลยี NGS ที่ล้ำสมัยซึ่งสามารถลดต้นทุนการลำดับดีเอ็นเอและเพิ่มประสิทธิภาพการทำงานได้มากยิ่งขึ้น การเตรียมไลบรารี DNBSEQ ประกอบด้วยการแตกตัวของดีเอ็นเอ การเตรียม ssDNA และการขยายแบบวงกลม (rolling circle amplification) เพื่อให้ได้นาโนบอลดีเอ็นเอ (DNB) จากนั้นจะนำนาโนบอลเหล่านี้ไปวางบนพื้นผิวแข็งและทำการลำดับดีเอ็นเอโดยใช้การสังเคราะห์โพรบ-แองเคอร์แบบผสมผสาน (cPAS) เทคโนโลยี DNBSEQ ผสานข้อดีของการมีอัตราความผิดพลาดในการขยายต่ำเข้ากับการใช้รูปแบบความผิดพลาดที่มีความหนาแน่นสูงกับนาโนบอล ส่งผลให้การลำดับดีเอ็นเอมีประสิทธิภาพและความแม่นยำสูงขึ้น

บริการจัดลำดับไลบรารีสำเร็จรูปของเราช่วยให้ลูกค้าสามารถเตรียมไลบรารีการจัดลำดับ Illumina จากแหล่งข้อมูลที่หลากหลาย (mRNA, จีโนมทั้งหมด, แอมพลิคอน, ไลบรารี 10x และอื่นๆ) ซึ่งจะถูกแปลงเป็นไลบรารี MGI ในห้องปฏิบัติการของเราเพื่อนำไปจัดลำดับด้วย DNBSEQ-T7 ทำให้ได้ข้อมูลปริมาณมากในต้นทุนที่ต่ำลง

สอบถาม รายละเอียด
ปฏิสัมพันธ์ของโครมาตินตาม Hi-C

Hi-C เป็นวิธีการที่ออกแบบมาเพื่อจับภาพโครงสร้างทางพันธุกรรมโดยการผสมผสานปฏิสัมพันธ์แบบอาศัยความใกล้เคียงและการลำดับดีเอ็นเอความเร็วสูง วิธีการนี้ใช้หลักการเชื่อมโยงโครมาตินด้วยฟอร์มาลดีไฮด์ ตามด้วยการย่อยและการเชื่อมต่อใหม่ในลักษณะที่ว่าเฉพาะชิ้นส่วนที่เชื่อมต่อกันด้วยพันธะโควาเลนต์เท่านั้นที่จะสร้างผลิตภัณฑ์การเชื่อมต่อได้ โดยการลำดับผลิตภัณฑ์การเชื่อมต่อเหล่านี้ ทำให้สามารถศึกษาโครงสร้างสามมิติของจีโนมได้ Hi-C ช่วยให้สามารถศึกษาการกระจายตัวของส่วนต่างๆ ของจีโนมที่มีความหนาแน่นต่ำ (ส่วน A, ยูโครมาติน) และมีแนวโน้มที่จะมีการถอดรหัสทางพันธุกรรมสูง และบริเวณที่มีความหนาแน่นสูงกว่า (ส่วน B, เฮเทอโรโครมาติน) นอกจากนี้ Hi-C ยังสามารถใช้เพื่อระบุโดเมนที่เชื่อมโยงกันทางโครงสร้าง (TADs) ซึ่งเป็นบริเวณของจีโนมที่มีโครงสร้างพับและมีแนวโน้มที่จะมีรูปแบบการแสดงออกที่คล้ายคลึงกัน และเพื่อระบุลูปโครมาติน ซึ่งเป็นบริเวณดีเอ็นเอที่ยึดติดกันด้วยโปรตีนและมักอุดมไปด้วยองค์ประกอบควบคุม บริการจัดลำดับดีเอ็นเอ Hi-C ของ BMKGene ช่วยให้นักวิจัยสามารถสำรวจมิติเชิงพื้นที่ของจีโนมิกส์ เปิดโอกาสใหม่ ๆ ในการทำความเข้าใจการควบคุมจีโนมและผลกระทบต่อสุขภาพและโรคภัยไข้เจ็บ

สอบถาม รายละเอียด
PacBio 2+3 สารละลาย mRNA ความยาวเต็ม

แม้ว่าการจัดลำดับ mRNA ด้วยเทคโนโลยี NGS จะเป็นเครื่องมืออเนกประสงค์สำหรับการวัดปริมาณการแสดงออกของยีน แต่การพึ่งพาข้อมูลการอ่านแบบสั้นจำกัดประสิทธิภาพในการวิเคราะห์ทรานสคริปโตมิกที่ซับซ้อน ในทางกลับกัน การจัดลำดับ PacBio (Iso-Seq) ใช้เทคโนโลยีการอ่านแบบยาว ทำให้สามารถจัดลำดับทรานสคริปต์ mRNA แบบเต็มความยาวได้ วิธีนี้ช่วยให้สามารถสำรวจการตัดต่อทางเลือก การรวมยีน และการเติมหมู่โพลีอะดีนีนได้อย่างครอบคลุม แม้ว่าจะไม่ใช่ตัวเลือกหลักสำหรับการวัดปริมาณการแสดงออกของยีนก็ตาม การผสมผสานแบบ 2+3 ช่วยเชื่อมช่องว่างระหว่าง Illumina และ PacBio โดยอาศัยข้อมูลการอ่าน PacBio HiFi เพื่อระบุชุดไอโซฟอร์มทรานสคริปต์ทั้งหมด และการจัดลำดับ NGS เพื่อวัดปริมาณไอโซฟอร์มที่เหมือนกัน

แพลตฟอร์ม: PacBio Revio และ Illumina NovaSeq

สอบถาม รายละเอียด
การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม

เป้าหมายของการศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม (Genome-Wide Association Studies หรือ GWAS) คือการระบุความแปรผันทางพันธุกรรม (จีโนไทป์) ที่เชื่อมโยงกับลักษณะเฉพาะ (ฟีโนไทป์) โดยการตรวจสอบเครื่องหมายทางพันธุกรรมทั่วทั้งจีโนมในกลุ่มตัวอย่างจำนวนมาก GWAS จะคาดการณ์ความสัมพันธ์ระหว่างจีโนไทป์และฟีโนไทป์ผ่านการวิเคราะห์ทางสถิติในระดับประชากร วิธีการนี้มีการประยุกต์ใช้อย่างกว้างขวางในการวิจัยโรคในมนุษย์และการสำรวจยีนที่ทำหน้าที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่ซับซ้อนในสัตว์หรือพืช

ที่ BMKGENE เรามีสองแนวทางสำหรับการทำ GWAS ในประชากรขนาดใหญ่ ได้แก่ การใช้การจัดลำดับจีโนมทั้งหมด (Whole-Genome Sequencing หรือ WGS) หรือเลือกใช้การจัดลำดับจีโนมแบบลดขนาด (Reduced Representation Genome Sequencing หรือ SLAF) ซึ่งพัฒนาขึ้นภายในองค์กร WGS เหมาะสำหรับจีโนมขนาดเล็ก ในขณะที่ SLAF เป็นทางเลือกที่คุ้มค่าสำหรับการศึกษาประชากรขนาดใหญ่ที่มีจีโนมยาวกว่า ช่วยลดต้นทุนการจัดลำดับได้อย่างมีประสิทธิภาพ พร้อมทั้งรับประกันประสิทธิภาพในการค้นหาเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่สูง

สอบถาม รายละเอียด
การจัดลำดับอาร์เอ็นเอแบบนิวเคลียสเดี่ยว

การพัฒนาเทคนิคการจับเซลล์เดี่ยวและการสร้างไลบรารีแบบกำหนดเอง ควบคู่กับการลำดับดีเอ็นเอความเร็วสูง ได้ปฏิวัติการศึกษาการแสดงออกของยีนในระดับเซลล์ ความก้าวหน้านี้ช่วยให้สามารถวิเคราะห์ประชากรเซลล์ที่ซับซ้อนได้อย่างลึกซึ้งและครอบคลุมมากขึ้น เอาชนะข้อจำกัดที่เกี่ยวข้องกับการหาค่าเฉลี่ยการแสดงออกของยีนในทุกเซลล์ และรักษาความหลากหลายที่แท้จริงภายในประชากรเหล่านี้ไว้ได้ แม้ว่าการลำดับ RNA ระดับเซลล์เดี่ยว (scRNA-seq) จะมีข้อดีที่ปฏิเสธไม่ได้ แต่ก็พบกับความท้าทายในเนื้อเยื่อบางชนิดที่การสร้างสารละลายเซลล์เดี่ยวทำได้ยากและต้องใช้ตัวอย่างสด ที่ BMKGene เราแก้ไขอุปสรรคนี้โดยนำเสนอการลำดับ RNA จากนิวเคลียสเดี่ยว (snRNA-seq) โดยใช้เทคโนโลยี 10X Genomics Chromium ที่ทันสมัย วิธีการนี้ขยายขอบเขตของตัวอย่างที่เหมาะสมสำหรับการวิเคราะห์ทรานสคริปโตมในระดับเซลล์เดี่ยว

การแยกนิวเคลียสทำได้โดยใช้ชิป 10X Genomics Chromium ที่ล้ำสมัย ซึ่งมีระบบไมโครฟลูอิดิกส์แปดช่องพร้อมจุดตัดสองจุด ภายในระบบนี้ เม็ดเจลที่ประกอบด้วยบาร์โค้ด ไพรเมอร์ เอนไซม์ และนิวเคลียสเดี่ยวจะถูกห่อหุ้มด้วยหยดน้ำมันขนาดนาโนลิตร ก่อตัวเป็นเจลบีดในอิมัลชัน (Gel Bead-in-Emulsion หรือ GEM) หลังจากการก่อตัวของ GEM เซลล์จะสลายตัวและบาร์โค้ดจะถูกปล่อยออกมาภายใน GEM แต่ละอัน จากนั้นโมเลกุล mRNA จะถูกถอดรหัสย้อนกลับเป็น cDNA ซึ่งประกอบด้วยบาร์โค้ด 10X และตัวระบุโมเลกุลเฉพาะ (Unique Molecular Identifiers หรือ UMI) จากนั้น cDNA เหล่านี้จะถูกนำไปสร้างไลบรารีสำหรับการจัดลำดับตามมาตรฐาน ซึ่งช่วยให้สามารถสำรวจโปรไฟล์การแสดงออกของยีนในระดับเซลล์เดี่ยวได้อย่างครอบคลุมและมีประสิทธิภาพ

แพลตฟอร์ม: 10× Genomics Chromium และแพลตฟอร์ม Illumina NovaSeq

สอบถาม รายละเอียด
การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดของพืช/สัตว์
การจัดลำดับจีโนมทั้งหมด (Whole Genome Sequencing หรือ WGS) เป็นเทคนิคที่ใช้ในการกำหนดลำดับดีเอ็นเอทั้งหมดของจีโนมของสิ่งมีชีวิตในครั้งเดียว

โดยปกติแล้ว บริการนี้จะแบ่งออกเป็นสองกลุ่มที่แตกต่างกัน ขึ้นอยู่กับการมีอยู่ของจีโนมอ้างอิง:

เดอ โนโวการจัดลำดับจีโนมทั้งหมดในสถานการณ์นี้ จีโนมที่จะทำการจัดลำดับไม่มีจีโนมอ้างอิงให้ใช้ ดังนั้นวัตถุประสงค์ของการจัดลำดับนี้จึงเป็นการสร้างจีโนมอ้างอิงขึ้นมาใหม่ (หรือปรับปรุงจีโนมอ้างอิงที่มีอยู่แล้ว) เทคนิคนี้จำเป็นต้องใช้ทั้งข้อมูลจาก Illumina และการจัดลำดับแบบอ่านยาว (long-read sequencing) เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการประกอบจีโนมโดยการสร้างส่วนที่ทับซ้อนกันระหว่างลำดับการอ่าน

การจัดลำดับใหม่หมายถึงการจัดลำดับจีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตต่าง ๆ ในสายพันธุ์เดียวกัน โดยใช้จีโนมอ้างอิงที่ทราบแล้วเป็นพื้นฐาน จากนั้นจึงสามารถระบุความแตกต่างทางพันธุกรรมของแต่ละบุคคลหรือประชากรได้
สอบถาม รายละเอียด
การจัดลำดับ mRNA แบบเต็มความยาว - นาโนพอเร

แม้ว่าการจัดลำดับ mRNA ด้วยเทคโนโลยี NGS จะเป็นเครื่องมืออเนกประสงค์สำหรับการวัดปริมาณการแสดงออกของยีน แต่การพึ่งพาข้อมูลการอ่านสั้นๆ ทำให้ประสิทธิภาพในการวิเคราะห์ทรานสคริปโตมิกส์ที่ซับซ้อนลดลง ในทางกลับกัน การจัดลำดับด้วยนาโนพอเรใช้เทคโนโลยีการอ่านแบบยาว ทำให้สามารถจัดลำดับ mRNA แบบเต็มความยาวได้ วิธีการนี้ช่วยให้สามารถสำรวจการตัดต่อทางเลือก การรวมตัวของยีน การเติมหมู่โพลีอะดีนีน และการวัดปริมาณไอโซฟอร์มของ mRNA ได้อย่างครอบคลุม

การจัดลำดับดีเอ็นเอด้วยนาโนพอเร (Nanopore sequencing) เป็นวิธีการที่อาศัยสัญญาณไฟฟ้าแบบเรียลไทม์ระดับโมเลกุลเดี่ยวของนาโนพอเร ซึ่งให้ผลลัพธ์แบบเรียลไทม์ โดยโปรตีนมอเตอร์จะนำทางให้ดีเอ็นเอสายคู่จับกับโปรตีนนาโนพอเรที่ฝังอยู่ในไบโอฟิล์ม และคลายตัวเมื่อผ่านช่องนาโนพอเรภายใต้ความแตกต่างของแรงดันไฟฟ้า สัญญาณไฟฟ้าที่แตกต่างกันซึ่งเกิดจากเบสต่างๆ บนสายดีเอ็นเอจะถูกตรวจจับและจำแนกแบบเรียลไทม์ ทำให้สามารถจัดลำดับนิวคลีโอไทด์ได้อย่างแม่นยำและต่อเนื่อง แนวทางใหม่นี้เอาชนะข้อจำกัดของการอ่านแบบสั้น และเป็นแพลตฟอร์มแบบไดนามิกสำหรับการวิเคราะห์จีโนมที่ซับซ้อน รวมถึงการศึกษาทรานสคริปโตมิกส์ที่ซับซ้อน โดยให้ผลลัพธ์ทันที

แพลตฟอร์ม: Nanopore PromethION 48

สอบถาม รายละเอียด