การวิเคราะห์ลำดับ mRNA (NGS) โดยใช้จีโนมอ้างอิง
RNA-seq เป็นเครื่องมือมาตรฐานในวิทยาศาสตร์ชีวภาพและการเกษตร ช่วยเชื่อมช่องว่างระหว่างจีโนมและโปรตีโอม จุดเด่นอยู่ที่การค้นพบทรานสคริปต์ใหม่และการวัดปริมาณการแสดงออกของยีนในขั้นตอนเดียว มีการใช้กันอย่างแพร่หลายในการศึกษาทรานสคริปโตมิกส์เชิงเปรียบเทียบ ซึ่งช่วยให้เข้าใจยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะหรือฟีโนไทป์ต่างๆ เช่น การเปรียบเทียบกลายพันธุ์กับสายพันธุ์ปกติ หรือการเปิดเผยการแสดงออกของยีนภายใต้สภาวะเฉพาะ แอปพลิเคชัน BMKCloud mRNA(Reference) ผสานรวมการวัดปริมาณการแสดงออก การวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกัน (DEG) และการวิเคราะห์โครงสร้างลำดับเข้ากับกระบวนการทางชีวสารสนเทศของ mRNA-seq(NGS) และรวมจุดแข็งของซอฟต์แวร์ที่คล้ายคลึงกัน ทำให้สะดวกและใช้งานง่าย ผู้ใช้สามารถอัปโหลดข้อมูล RNA-seq ไปยังคลาวด์ ซึ่งแอปพลิเคชันจะนำเสนอโซลูชันการวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศแบบครบวงจร นอกจากนี้ยังให้ความสำคัญกับประสบการณ์ของลูกค้า โดยนำเสนอการดำเนินการส่วนบุคคลที่ปรับให้เหมาะกับความต้องการเฉพาะของผู้ใช้ ผู้ใช้สามารถตั้งค่าพารามิเตอร์และส่งภารกิจไปป์ไลน์ได้ด้วยตนเอง ตรวจสอบรายงานแบบโต้ตอบ ดูข้อมูล/แผนภาพ และดำเนินการวิเคราะห์ข้อมูล เช่น การเลือกยีนเป้าหมาย การจัดกลุ่มตามหน้าที่ การสร้างแผนภาพ เป็นต้น
แพลตฟอร์ม:อิลลูมินา, เอ็มจีไอ
กลยุทธ์:RNA-Seq
เค้าโครง: จับคู่แล้ว ข้อมูลสะอาด
ประเภทห้องสมุด:fr-unstranded, fr-firststrand หรือ fr-secondstrand
ความยาวของเนื้อหา:150 บีพี
ประเภทไฟล์:ระบบจะเลือกไฟล์ *.fastq, *.fq, *.fastq.gz หรือ *.fq.gzระบบจะจับคู่ไฟล์ .fastq โดยอัตโนมัติตามชื่อไฟล์เช่น *_1.fastq จับคู่กับ *._2.fastq
จำนวนตัวอย่าง:ไม่มีข้อจำกัดเรื่องจำนวนจำนวนตัวอย่าง แต่เวลาในการวิเคราะห์จะเพิ่มขึ้นตามจำนวนตัวอย่างตัวอย่างเจริญเติบโต
ปริมาณข้อมูลที่แนะนำ:6 กรัมต่อตัวอย่าง
