-
ลำดับ RNA นิวเคลียสเดี่ยว
ความก้าวหน้าในการจับเซลล์เดี่ยวและเทคนิคการสร้างห้องสมุดแต่ละแห่งผสมผสานกับการจัดลำดับที่มีปริมาณงานสูงทำให้สามารถศึกษาการแสดงออกของยีนแบบเซลล์ต่อเซลล์ได้ช่วยให้สามารถวิเคราะห์ระบบได้ลึกและสมบูรณ์ยิ่งขึ้นเกี่ยวกับประชากรเซลล์ที่ซับซ้อน ซึ่งโดยส่วนใหญ่แล้วจะช่วยหลีกเลี่ยงการปกปิดความแตกต่างด้วยการหาค่าเฉลี่ยของเซลล์ทั้งหมด
อย่างไรก็ตาม บางเซลล์ไม่เหมาะที่จะทำเป็นสารแขวนลอยเซลล์เดียว ดังนั้น วิธีการเตรียมตัวอย่างอื่นๆ – จำเป็นต้องมีการสกัดนิวเคลียสจากเนื้อเยื่อ กล่าวคือ นิวเคลียสถูกสกัดโดยตรงจากเนื้อเยื่อหรือเซลล์ และเตรียมเป็นสารแขวนลอยนิวเคลียสเดี่ยวสำหรับเซลล์เดี่ยว การจัดลำดับเซลล์
BMK ให้บริการจัดลำดับ RNA เซลล์เดียวที่ใช้ Genomics ChromiumTM 10 เท่าบริการนี้มีการใช้กันอย่างแพร่หลายในการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับโรค เช่น การแยกเซลล์ภูมิคุ้มกัน ความหลากหลายของเนื้องอก การพัฒนาเนื้อเยื่อ เป็นต้น
ชิปถอดเสียงเชิงพื้นที่: 10 × จีโนมิกส์
แพลตฟอร์ม: แพลตฟอร์ม Illumina NovaSeq
-
BMKMANU S1000 เครื่องถอดเสียงเชิงพื้นที่
การถอดเสียงเชิงพื้นที่ยืนอยู่แถวหน้าของนวัตกรรมทางวิทยาศาสตร์ ช่วยให้นักวิจัยสามารถเจาะลึกรูปแบบการแสดงออกของยีนที่ซับซ้อนภายในเนื้อเยื่อ ขณะเดียวกันก็รักษาบริบทเชิงพื้นที่ไว้ท่ามกลางแพลตฟอร์มที่หลากหลาย BMKGene ได้พัฒนาชิป BMKManu S1000 Spatial Transcriptome ซึ่งมีความละเอียดที่เพิ่มขึ้น5µM ไปถึงช่วงเซลล์ย่อย และเปิดใช้งานการตั้งค่าความละเอียดหลายระดับ.ชิป S1000 ซึ่งมีจุดประมาณ 2 ล้านจุด ใช้ไมโครเวลส์ที่เรียงเป็นชั้นด้วยเม็ดบีดที่บรรจุด้วยหัววัดจับบาร์โค้ดเชิงพื้นที่ห้องสมุด cDNA ที่เสริมด้วยบาร์โค้ดเชิงพื้นที่ ถูกเตรียมจากชิป S1000 และจัดลำดับบนแพลตฟอร์ม Illumina NovaSeq ในเวลาต่อมาการผสมผสานระหว่างตัวอย่างบาร์โค้ดเชิงพื้นที่และ UMI ช่วยให้มั่นใจในความถูกต้องและความเฉพาะเจาะจงของข้อมูลที่สร้างขึ้นคุณลักษณะเฉพาะของชิป BMKManu S1000 อยู่ที่ความสามารถรอบด้าน โดยนำเสนอการตั้งค่าความละเอียดหลายระดับที่สามารถปรับให้เข้ากับเนื้อเยื่อและระดับรายละเอียดต่างๆ ได้อย่างละเอียดความสามารถในการปรับตัวนี้ทำให้ชิปเป็นตัวเลือกที่โดดเด่นสำหรับการศึกษาการถอดเสียงเชิงพื้นที่ที่หลากหลาย ช่วยให้มั่นใจได้ถึงการจัดกลุ่มเชิงพื้นที่ที่แม่นยำและมีสัญญาณรบกวนน้อยที่สุด
การใช้ชิป BMKManu S1000 และเทคโนโลยีการถอดรหัสเชิงพื้นที่อื่นๆ ช่วยให้นักวิจัยมีความเข้าใจที่ดีขึ้นเกี่ยวกับการจัดระเบียบเชิงพื้นที่ของเซลล์และปฏิสัมพันธ์ของโมเลกุลที่ซับซ้อนที่เกิดขึ้นภายในเนื้อเยื่อ โดยให้ข้อมูลเชิงลึกอันล้ำค่าเกี่ยวกับกลไกที่เป็นรากฐานของกระบวนการทางชีวภาพในสาขาต่างๆ มากมาย ซึ่งรวมถึง เนื้องอกวิทยา ประสาทวิทยาศาสตร์ ชีววิทยาพัฒนาการ ภูมิคุ้มกันวิทยา และการศึกษาทางพฤกษศาสตร์
แพลตฟอร์ม: ชิป BMKManu S1000 และ Illumina NovaSeq
-
10x การถอดเสียงเชิงพื้นที่ของ Genomics Visium
การถอดเสียงเชิงพื้นที่เป็นเทคโนโลยีล้ำสมัยที่ช่วยให้นักวิจัยสามารถตรวจสอบรูปแบบการแสดงออกของยีนภายในเนื้อเยื่อ ขณะเดียวกันก็รักษาบริบทเชิงพื้นที่ไว้ได้แพลตฟอร์มอันทรงพลังแห่งหนึ่งในโดเมนนี้คือ 10x Genomics Visium ควบคู่กับการจัดลำดับอิลลูมินาหลักการของ 10X Visium นั้นอยู่บนชิปพิเศษที่มีพื้นที่จับที่กำหนดซึ่งวางส่วนของเนื้อเยื่อไว้พื้นที่จับภาพนี้มีจุดบาร์โค้ด ซึ่งแต่ละจุดสอดคล้องกับตำแหน่งเชิงพื้นที่เฉพาะภายในเนื้อเยื่อจากนั้นโมเลกุล RNA ที่ถูกจับจากเนื้อเยื่อจะถูกติดป้ายกำกับด้วยตัวระบุโมเลกุลเฉพาะ (UMI) ในระหว่างกระบวนการถอดรหัสแบบย้อนกลับจุดบาร์โค้ดและ UMI เหล่านี้ช่วยให้สามารถจัดทำแผนที่เชิงพื้นที่และการหาปริมาณการแสดงออกของยีนได้อย่างแม่นยำด้วยความละเอียดเซลล์เดียวการผสมผสานระหว่างตัวอย่างบาร์โค้ดเชิงพื้นที่และ UMI ช่วยให้มั่นใจในความถูกต้องและความเฉพาะเจาะจงของข้อมูลที่สร้างขึ้นด้วยการใช้เทคโนโลยี Spatial Transcriptomics นี้ นักวิจัยจะได้รับความเข้าใจที่ลึกซึ้งยิ่งขึ้นเกี่ยวกับการจัดระเบียบเชิงพื้นที่ของเซลล์และปฏิสัมพันธ์ของโมเลกุลที่ซับซ้อนที่เกิดขึ้นภายในเนื้อเยื่อ ซึ่งนำเสนอข้อมูลเชิงลึกอันล้ำค่าเกี่ยวกับกลไกที่เป็นรากฐานของกระบวนการทางชีวภาพในหลากหลายสาขา รวมถึงเนื้องอกวิทยา ประสาทวิทยาศาสตร์ ชีววิทยาพัฒนาการ และภูมิคุ้มกันวิทยา และการศึกษาทางพฤกษศาสตร์
แพลตฟอร์ม: 10X Genomics Visium และ Illumina NovaSeq
