●Isolasie en verbouingsvrye metode vir mikrobiese gemeenskapsprofiel: Aktiveer opeenvolging van genetiese materiaal van onbewerkbare organismes.
●Hoë resolusie: Spesel 'n lae-oorvloed spesie in omgewingsmonsters.
●Uitgebreide bioinformatika -analise:Gefokus nie net op taksonomiese diversiteit nie, maar ook op die funksionele diversiteit van die gemeenskap.
●Uitgebreide ervaring:Met 'n goeie rekord van die suksesvolle sluiting van verskeie metagenomika -projekte in verskillende navorsingsdomeine en meer as 200,000 monsters verwerk, bring ons span 'n magdom ervaring aan elke projek.
Volgorde platform | Volgorde -strategie | Data aanbeveel | Kwaliteitskontrole |
Illumina Novasq of DNBSEQ-T7 | PE150 | 6-20 GB | Q30≥85% |
Konsentrasie (ng/µl) | Totale bedrag (NG) | Volume (µl) |
≥1 | ≥30 | ≥20 |
● Grond/slyk: 2-3g
● Intestinale inhoud-Animaal: 0,5-2G
● Intestinale inhoud-insek: 0.1-0.25g
● Plantoppervlak (verrykte sediment): 0,5-1g
● Fermentasie-sous verrykte sediment): 0.2-0.5g
● Fekelde (groot diere): 0,5-2g
● Fekelde (muis): 3-5graan
● Pulmonale alveolêre spoelvloeistof: filterpapier
● Vaginale depper: 5-6 deppers
● Vel/geslags depper/speeksel/orale sagte weefsel/faringeale depper/rektale depper: 2-3 deppers
● Oppervlakmikro-organisme: 5-6 deppers
● Waterliggaam/lug/biofilm: filterpapier
● Endofiete: 2-3g
● Tandheelkundige gedenkplaat: 0,5-1g
Sluit die volgende ontleding in:
● Opeenvolging van datakwaliteitskontrole
● Metagenoom -samestelling en geenvoorspelling
● Gene -aantekening
● Taksonomiese alfa -diversiteitsanalise
● Funksionele analise van die gemeenskap: biologiese funksie, metaboliese, antibiotiese weerstand
● Analise oor funksionele sowel as taksonomiese diversiteit:
Beta -diversiteitsanalise
Intergroepanalise
Korrelasie -analise: tussen omgewingsfaktore en outsamestelling en diversiteit
Funksionele analise: Kaart antibiotiese weerstandigheid
Differensiële analise van KEGG -metaboliese weë: hittekaart van beduidende weë
Alfa -diversiteit van taksonomiese verspreiding: ACE -indeks
Beta -diversiteit van taksonomiese verspreiding: PCOA
Ontdek die vooruitgang wat deur BMKGene se Metagenome -volgorde -dienste met Illumina vergemaklik word deur 'n saamgestelde versameling publikasies.
Hai, Q. et al. (2023) 'Metagenomiese en metabolomiese analise van veranderinge in die derminhoud van reënboogforel (Oncorhynchus mykiss) besmet met aansteeklike hematopoietiese nekrose -virus by verskillende kultuurwatertemperature',Grense in mikrobiologie, 14, p. 1275649. DOI: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
Mao, C. et al. (2023) 'Mikrobiese gemeenskappe, weerstandsgene en weerstandsrisiko's in stedelike mere van verskillende trofiese toestande: interne skakels en eksterne invloede',Tydskrif vir gevaarlike materiaal vooruitgang, 9, p. 100233. Doi: 10.1016/j.hazadv.2023.100233.
Su, M. et al. (2022) 'Metagenomiese analise het die verskille in samestelling en funksie tussen vloeistof-geassosieerde en vaste-geassosieerde mikroörganismes van skape rumen aan die lig gebring',Grense in mikrobiologie, 13, p. 851567. Doi: 10.3389/fmicb.2022.851567.
Yin, J. et al. (2023) 'Vetsugtige Ningxiang Pig-afgeleide mikrobiota herskryf karnitienmetabolisme om spiervetsuurneerslag in maer varke te bevorder',Die innovasie, 4 (5), p. 100486. Doi: 10.1016/j.xinn.2023.100486.
Zhao, X. et al. (2023) 'Metagenomiese insigte in die potensiële risiko's van verteenwoordigende bio/nie-afbreekbare plastiek en nie-plastiese puin in die boonste en onderste bereik van Haihe-riviermonding, China',Wetenskap van die totale omgewing, 887, p. 164026. Doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.164026.