-
Genoomwye Assosiasie Analise
Genoomwye assosiasiestudie (GWAS) het ten doel om genetiese variante (genotipe) te identifiseer wat met spesifieke eienskappe (fenotipe) geassosieer word.GWAS-studie ondersoek genetiese merkers wat die hele genoom van groot aantal individue kruis en voorspel genotipe-fenotipe assosiasies deur statistiese analise op bevolkingsvlak.Dit is wyd toegepas in navorsing oor menslike siektes en funksionele geenontginning op komplekse eienskappe van diere of plante.
-
Enkelkern-RNA-volgordebepaling
Die vooruitgang in enkelselvaslegging en individuele biblioteekkonstruksietegniek, kombineer met hoë-deursetvolgordebepaling, laat geenuitdrukkingstudies op sel-vir-sel basis toe.Dit maak 'n dieper en volledige stelselanalise op komplekse selpopulasies moontlik, waarin dit grootliks die maskering van hul heterogeniteit vermy deur die gemiddelde van alle selle te neem.
Sommige selle is egter nie geskik om in enkelselsuspensie gemaak te word nie, dus ander monstervoorbereidingsmetodes – kernonttrekking uit weefsels is nodig, dit wil sê, kern word direk uit weefsels of sel onttrek en in enkelkernsuspensie voorberei vir enkel- selvolgordebepaling.
BMK verskaf 10× Genomics ChromiumTM-gebaseerde enkelsel-RNA-volgordebepalingsdiens.Hierdie diens is wyd gebruik in studies oor siekteverwante studies, soos immuunseldifferensiasie, tumorheterogeniteit, weefselontwikkeling, ens.
Ruimtelike transkriptoomskyfie: 10× Genomika
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Plant-/dier-heelgenoomvolgordebepaling
Heelgenoomhervolgordebepaling, ook bekend as WGS, maak die onthulling van beide algemene en seldsame mutasies op die hele genoom moontlik, insluitend enkelnukleotiedpolimorfisme (SNP), invoegingsuitwissing (InDel), struktuurvariasie (SV) en kopiegetalvariasie (CNV) ).SV's maak 'n groter deel van die variasiebasis uit as SNP's en het 'n groter impak op die genoom, wat 'n beduidende effek op lewende organismes het.Langlees hervolgorde maak voorsiening vir meer presiese identifikasie van groot fragmente en ingewikkelde variasies omdat lang lees dit baie makliker maak om chromosomale kruising oor ingewikkelde streke soos tandemherhalings, GC/AT-ryke streke en hiperveranderlike streke te maak.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Ruimtelike Transkriptoom
Ruimtelike organisasie van selle speel 'n belangrike rol in verskeie biologiese prosesse, soos immuuninfiltrasie, embrio-ontwikkeling, ens. Ruimtelike transkriptoomvolgordebepaling, wat geen-uitdrukking-profilering aandui terwyl inligting van ruimtelike posisie behou word, het groot insigte in transkriptoomvlak-weefselargitektuur verskaf.Met die ontwikkeling van tegnologie moet die ultra-helder weefselmorfologie en die werklike strukturele verskil van ruimtelike molekulêre uitdrukking met hoër resolusie bestudeer word.BMKGENE bied omvattende, eenstop ruimtelike transkripsievolgordebepalingsdiens van monsters tot biologiese insigte.
Ruimtelike transkriptomika-tegnologieë het nuwe perspektiewe in diverse navorsingsarena bemagtig deur geenuitdrukkingsprofiel met ruimtelike inhoud in heterogene monsters op te los.
Ruimtelike transkriptoomskyfie: BMKMANU S1000
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
10x Genomics Visium Ruimtelike Transkriptoom
Visium Ruimtelike Gene Expression is 'n hoofstroom ruimtelike transkriptoomvolgorde-tegnologie vir die klassifikasie van weefsel gebaseer op totale mRNA.Karteer die hele transkriptoom met morfologiese konteks om nuwe insigte in normale ontwikkeling, siektepatologie en kliniese translasienavorsing te ontdek.BMKGENE bied omvattende, eenstop ruimtelike transkripsievolgordebepalingsdiens van monsters tot biologiese insigte.
Ruimtelike transkriptomika-tegnologieë het nuwe perspektiewe in diverse navorsingsarena bemagtig deur geenuitdrukkingsprofiel met ruimtelike inhoud in heterogene monsters op te los.
Ruimtelike transkriptoomskyfie: 10x Genomics Visium
Platform:Illumina NovaSeq 6000
-
Vollengte mRNA-volgordebepaling-Nanopore
RNA-volgordebepaling was 'n waardevolle hulpmiddel vir omvattende transkriptomanalise.Tradisionele kortleesvolgorde het ongetwyfeld talle belangrike ontwikkelings hier bereik.Nietemin ondervind dit dikwels beperkings in vollengte isovorm-identifikasies, kwantifisering, PCR-vooroordeel.
Nanopore-volgordebepaling onderskei hom van ander volgordebepalingsplatforms deurdat die nukleotiede direk gelees word sonder DNA-sintese en genereer lang lees by tientalle kilobasisse.Dit bemagtig direkte uitlees wat vollengte transkripsies kruis en die uitdagings in isovormvlakstudies aanpak.
Platform:Nanopore PromethION
Biblioteek:cDNA-PKR
-
Vollengte mRNA-volgordebepaling -PacBio
De novovollengte transkriptoomvolgordebepaling, ook bekend asDe novoIso-Seq neem die voordele van PacBio-volgorder in leeslengte, wat opeenvolging van vollengte cDNA-molekules moontlik maak sonder enige onderbrekings.Dit vermy heeltemal enige foute wat in transkripsie-samestellingstappe gegenereer word en konstrueer unigeen-stelle met isovorm-vlak resolusie.Hierdie unigeen-stelle verskaf kragtige genetiese inligting as "verwysingsgenoom" op transkripsievlak.Daarbenewens, kombineer met die volgende generasie volgorde data, hierdie diens bemagtig 'n akkurate kwantifisering van isovorm-vlak uitdrukking.
Platform: PacBio Sequel IIBiblioteek: SMRT-klokbiblioteek -
Eukariotiese mRNA-volgordebepaling-Illumina
mRNA-volgordebepaling maak profilering moontlik van alle mRNA's wat uit selle getranskribeer is onder spesifieke toestande.Dit is 'n kragtige tegnologie om geenuitdrukkingprofiel, geenstrukture en molekulêre meganismes van sekere biologiese prosesse te openbaar.Tot op hede is mRNA-volgordebepaling wyd gebruik in fundamentele navorsing, kliniese diagnostiek, geneesmiddelontwikkeling, ens.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Nie-verwysingsgebaseerde mRNA-volgordebepaling-Illumina
mRNA-volgordebepaling neem die volgende generasie volgordebepalingstegniek (NGS) aan om die boodskapper-RNA(mRNA) van Eukariote vas te vang op spesifieke tydperk wat sommige spesiale funksies aktiveer.Die langste transkripsie wat gesplits is, is 'Unigene' genoem en gebruik as die verwysingsvolgorde vir daaropvolgende analise, wat 'n effektiewe manier is om die molekulêre meganisme en regulatoriese netwerk van die spesie sonder verwysing te bestudeer.
Na transkripsiedatasamestelling en unigeen funksionele annotasie
(1)SSR-analise, CDS-voorspelling en geenstruktuur sal vooraf gevorm word.
(2) Kwantifisering van unigene uitdrukking in elke monster sal uitgevoer word.
(3) Differensieel uitgedrukte unigenes tussen monsters (of groepe) sal ontdek word gebaseer op unigeen uitdrukking
(4) Groepering, funksionele annotasie en verrykingsanalise van differensieel uitgedrukte unigenene sal uitgevoer word
-
Lang nie-koderende volgorde-Illumina
Lang nie-koderende RNA's (lncRNA's) is 'n tipe RNA-molekules met 'n lengte van meer as 200 nt, wat gekenmerk word deur uiters lae koderingspotensiaal.LncRNA, as 'n sleutellid in nie-koderende RNA's, word hoofsaaklik in kern en plasma aangetref.Die ontwikkeling in volgordebepalingtegnologie en bioinformtika maak identifikasie van talle nuwe lncRNA's moontlik en assosieer dié met biologiese funksies.Akkumulatiewe bewyse dui daarop dat lncRNA wyd betrokke is by epigenetiese regulering, transkripsieregulering en post-transkripsieregulering.
