Metagenomika (NGS)

Haelgeweer-metagenomika met Illumina is 'n gewilde instrument vir die bestudering van mikrobiome deur DNS direk uit komplekse monsters te volgordebepaling, wat die studie van beide taksonomiese en funksionele diversiteit moontlik maak. Die BMKCloud-metagenomiese (NGS) pyplyn begin met kwaliteitsbeheer en metagenoomsamestelling, waaruit gene voorspel en gegroepeer word in nie-oorbodige datastelle wat geannoteer word vir funksie en taksonomie met behulp van verskeie databasisse. Hierdie inligting word gebruik om taksonomiese diversiteit binne die steekproef (alfa-diversiteit) en tussen-steekproef diversiteit (beta-diversiteit) te analiseer. Differensiële analise tussen groepe vind OTU's en biologiese funksies wat tussen die twee groepe verskil deur beide parametriese en nie-parametriese toetse te gebruik, terwyl korrelasie-analise hierdie verskille met omgewingsfaktore verbind.