Hittekaart
Matriksdatalêer word gebruik vir hittekaarttekening, wat matriksdata kan filter, normaliseer en groepeer.Dit word meestal gebruik vir groepontleding van geenuitdrukkingsvlak tussen verskillende monsters.
Gene Annotasie
Geenfunksie-annotasie word uitgevoer deur volgordes in FASTA-lêer teen verskeie databasisse te karteer.
Gene Annotasie
Basiese Plaaslike Belyning Soek Gereedskap
CDS_UTR_Voorspelling
Hierdie instrument is ontwerp om koderende streke (CDS) en nie-koderende streke (UTR) in gegewe transkripsievolgordes te voorspel gebaseer op ontploffing teen bekende proteïendatabasis en ORF-voorspelling.
Manhattan plot
Manhattan plot maak dit moontlik om data met 'n groot aantal datapunte te vertoon.Dit word algemeen gebruik in genoomwye assosiasiestudies (GWAS).
Circos
CIRCOS-diagram maak direkte aanbieding van SNP, InDeL, SV, CNV verspreidings op genoom moontlik.
GO_Verryking
TopGO is 'n instrument wat ontwerp is vir funksionele verryking.TopGO-Bioconductor-pakket bestaan uit differensiële uitdrukkingsanalise, GO-verrykingsanalise en visualisering van die resultate.Dit sal 'n gids genereer met uitvoer genaamd "Graph", wat resultate vir topGO_BP, topGO_CC en topGO_MF bevat.
WGCNA
WGCNA is 'n wyd gebruikte data-ontginningsmetode vir die ontdekking van geenko-uitdrukkingsmodules.Dit is van toepassing op verskeie uitdrukkingsdatastel, insluitend mikroskikkingdata en geenuitdrukkingdata wat van volgende generasie opeenvolging ontstaan het.
InterProScan
InterPro proteïenvolgorde analise en klassifikasie
GO_KEGG_Verryking
Hierdie instrument is ontwerp om GO-verrykingshistogram, KEGG-verrykingshistogram en KEGG-verrykingsroete te genereer, gebaseer op verskafde geenstel en ooreenstemmende annotasie.