条形 Banner-03

Produkte

Vergelykende genomika

Vergelykende genomika behels die ondersoek en vergelyking van die hele genoomvolgordes en strukture onder verskillende spesies. Hierdie veld poog om die evolusie van spesies te onthul, geenfunksies te dekodeer en die genetiese reguleringsmeganismes toe te lig deur gekonserveerde of uiteenlopende volgorde -strukture en elemente oor verskillende organismes te identifiseer. 'N Omvattende vergelykende genomika-studie omvat ontledings soos geenfamilies, evolusionêre ontwikkeling, dupliseringsgebeurtenisse van die hele genoom en die impak van selektiewe druk.


Diensbesonderhede

Demo -resultate

Gevallestudie

Diensvoordele

1 vergelykend-genomika

Uitgebreide kundigheid en publikasierekords: Met opgehoopte het BMKGene meer as 90 vergelykende genomika -projekte voltooi, met 'n kumulatiewe impakfaktor 900.

Omvattende bioinformatika -analise: Die ontledingspakket bevat die agt mees algemene ontledings, wat goed ontwerpte gereed-vir-publiek-syfers bied en 'n maklike interpretasie van die resultate moontlik maak

Hoogs bekwame bioinformatika -span en kort analise -siklus: Met groot ervaring in vergelykende genomika-analise, voldoen BMKGene se span in 'n kort omdraaityd uiteenlopende verpersoonlikte ontledingsvereistes

Ondersteuning na verkope:Ons verbintenis strek verder as die voltooiing van die projek met 'n 3-maande-nasale diensperiode. Gedurende hierdie tyd bied ons projekopvolging, probleemoplossing van hulp en vrae en vrae aan om enige vrae wat met die resultate verband hou, aan te spreek.

Dienspesifikasies

Geskatte ommekeertyd

Aantal spesies

Ontledings

30 Werksdae

6 - 12

Genesfamilie -groepering

Genesgesinsuitbreiding en sametrekking

Filogenetiese boomkonstruksie

Divergensie tydberaming (fossielkalibrasie benodig)

LTR -invoegtyd (vir plante)

Hele genoom duplisering (vir plante)

Selektiewe druk

Synteny -analise

Bioinformatika -ontledings

● Genesfamilie

● Filogenetika

● Divergensie tyd

● Selektiewe druk

● Synteny -analise

流程图 Vergelykende genomika

Voorbeeldvereistes en aflewering

Voorbeeldvereistes:

Weefsel of DNA vir genoomvolgorde en samestelling

Vir weefsel

Spesie

Weefsel

Opmeet

Pacbio CCS

Dier

Viscerale weefsel

0.5 ~ 1 g

≥ 3,5 g

Spierweefsel

≥ 5,0 g

≥ 5,0 ml

Soogdierbloed

≥ 0,5 ml

Pluimvee/visbloed

Plant

Vars blaar

1 ~ 2 g

≥ 5,0 g

 

Petal/Stam

1 ~ 2 g

≥ 10,0 g

 

Wortel/saad

1 ~ 2 g

≥ 20,0 g

Selle

Gekweekte sel

-

≥ 1 x 108

Data

Genoomvolgorde -lêers (.fasta) en annotasielêers (.gff3) van nou verwante spesies

Dienswerkvloei

Voorbeeld van QC

Eksperiment ontwerp

monster aflewering

Monster aflewering

Biblioteekvoorbereiding

Biblioteekbou

Volgorde

Volgorde

Data -analise

Data -analise

Na verkoopdienste

Na-verkoop dienste


  • Vorige:
  • Volgende:

  • *Demo -resultate wat hier getoon word, is alles van genome wat met Biomarker Technologies gepubliseer is

    1.LTR Voeg tydskatting in: die figuur het 'n unieke bimodale verdeling in LTR-RTS-invoegingstye in Weining Rye Genome getoon, in vergelyking met ander spesies. Die mees onlangse piek het ongeveer 0,5 miljoen jaar gelede verskyn.

    3LTR-insetsel-tyd-raming-in-weining-RYE

    Li Guang et al.,Natuurgenetika, 2021

     

     

    2. Filogenie en geengesinsanalise oor Chayote (Sechium Edule): Deur die ontleding van Chayote en die ander 13 verwante spesies in geenfamilie, is gevind dat Chayote die beste verband hou met slangbas (Trichosanthes anguina). Chayote afgelei van slangbaas in ongeveer 27-45 MYA en die hele genoom-duplisering (WGD) is in Chayote waargeneem in 25 ± 4 MYA, wat die derde WGD-gebeurtenis in Cucuibitaceae is.

    4filogenetiese boom-van-chayote

    Fu a et al.,Tuinbounavorsing, 2021

     

     

    3. Synteny -analise: Sommige gene wat verband hou met fitohormone in vrugontwikkeling is gevind in chayote, slangbas en pampoen. Korrelasie tussen chayote en pampoen is effens hoër as tussen chayote en slangpalebas.

    4filogenetiese boom-van-chayote

    Fu a et al.,Tuinbounavorsing, 2021

     

     

    4. Gene Gesinsanalise: KEGG -verryking op genetiese gesinsuitbreiding en sametrekking in G.Thurberi en G.Davidsonii -genome het getoon dat steroïedbiosintese en brassinosteroïede biosintese -verwante gene uitgebrei is.

    4filogenetiese boom-van-chayote

    Yang Z et al.,BMC Biologie, 2021

     

     

    5.WHOLE GENOME DUPLIKASIE -ANALISE: 4DTV en KS verspreidingsanalise het die hele genoom -dupliseringsgebeurtenis getoon. Pieke van intraspesies het dupliseringsgebeurtenisse getoon. Pieke van interspesieë wat gespesialiseer word. Die ontleding het aangedui dat O. europaea, vergelyking met die ander drie nou verwante spesies, meer onlangs deur 'n grootskaalse geen duplisering deurgemaak het.

    4filogenetiese boom-van-chayote

    Rao G et al.,Tuinbounavorsing, 2021

    BMK -saak

    Rose sonder prikel: Genomiese insigte gekoppel aan vogaanpassing

    Gepubliseer: Nasionale wetenskaplike oorsig, 2021

    Volgorde -strategie:

    'Basye s'nDoringloos'(R.Wichurainan) Genoom:
    Ongeveer. 93 x Pacbio + ongeveer 90 x nanopore + 267 x illumina

    Belangrike resultate

    1. Hoogkwaliteit R.Wichuraiana-genoom is gebou met behulp van langle geleesde volgorde-tegnieke, wat 'n samestelling van 530,07 Mb oplewer (die geskatte genoomgrootte was ongeveer 525,9 Mb deur vloeisitometrie en 525,5 deur genoomopname ; Heterozigositeit was ongeveer 1,03%). Die beraamde telling van Busco was 93,9%. In vergelyking met “Old Blush” (Haploob), is die kwaliteit en volledigheid van hierdie genoom bevestig deur die basis-basis-akkuraatheid en die LTR-monteerindeks (LAI = 20.03). R.Wichuraiana -genoom bevat 32.674 proteïenkoderende gene.

    2. Multi-omics-gesamentlike analise, bestaande uit vergelykende genomika, transkriptomika, QTL-analise van genetiese populasie, het die belangrike spesiasie tussen R. wichuraiana en rosa chinensis aan die lig gebring. Ook sou die uitdrukkingsvariasie van verwante gene in QTL waarskynlik geassosieer word met stamproppatroon.

    7KEGG-verryking-op-gen-geen-gesins-uitbreidings-en-kontraksie

    Vergelykende genomika -anaysis tussen Basye; s Thornless en Rosa Chinensis, insluitend sintetiese analise, geenfamilie -groep, uitbreidings- en sametrekkingsanalise, het 'n groot aantal variasies geopenbaar, wat verband hou met belangrike eienskappe in rose. Die unieke uitbreiding in NAC en FAR1/FRS -geenfamilie sou waarskynlik geassosieer word met weerstand teen swartvlek.

    81 vergelykend-genomika-analises-tussen-tussen-en-OB 82 vergelykend-genomika-analises-tussen-tussen-en-OB 83 vergelykend-genomika-analises-tussen-tussen-en-OB

    Vergelykende genomika -analise tussen BT- en Haploob -genome.

    Getuigskrif

    Zhong, M., et al. “Rose sonder prikel: genomiese insigte gekoppel aan vogaanpassing”Nasionale wetenskaplike oorsig, 2021;, NWAB092.

    Kry 'n kwotasie

    Skryf u boodskap hier en stuur dit aan ons

    Stuur u boodskap aan ons: