lncrna

Lang nie-koderende RNS'e (lncRNA) is RNS'e langer as 200 nukleotiede met lae koderingspotensiaal, maar met kritieke regulatoriese funksies. Die BMKCloud lncRNA-pyplyn is ontwerp om rRNA-uitgeputte biblioteke met 'n hoë kwaliteit, goed geannoteerde verwysingsgenoom te analiseer, deur lncRNA- en mRNA-ekspressie saam te analiseer. Na leesafsnyding en kwaliteitsbeheer word lesings in lyn gebring met die verwysingsgenoom om transkripsies saam te stel, en daaropvolgende geenstruktuuranalise onthul alternatiewe splitsing en nuwe gene. Transkripsies word geïdentifiseer as mRNA's of lncRNA's, en differensiële ekspressie-analise identifiseer differensieel uitgedrukte lncRNA's, hul teikens en differensieel uitgedrukte gene (DEGS). Beide DEG's en differensieel uitgedrukte lncRNA-teikens word funksioneel geannoteer om verrykte funksionele kategorieë te vind.