Bakteriële en Swam Hele Genoom Hervolgordebepaling
Bakteriële en swam-gehele genoom-hervolgordebepalingsprojekte is van kardinale belang vir die bevordering van mikrobiese genomika deur die voltooiing en vergelyking van mikrobiese genome moontlik te maak. Dit fasiliteer fermentasie-ingenieurswese, die optimalisering van industriële prosesse en die verkenning van sekondêre metabolismepaaie. Verder is swam- en bakteriese hervolgordebepaling van kardinale belang vir die begrip van omgewingsaanpassing, die optimalisering van stamme en die openbaarmaking van genetiese evolusiedinamika, met breë implikasies in medisyne, landbou en omgewingswetenskap.
Diensvoordele
●Bioinformatiese Analise Sluit Variantroeping In:Verskaffing van funksionele insigte in die hersekwensieerde genome.
● Uitgebreide kundigheidMet duisende mikrobiese hervolgordebepalingsprojekte wat jaarliks uitgevoer word, bring ons meer as 'n dekade se ondervinding, 'n hoogs bekwame ontledingspan, omvattende inhoud en uitstekende na-verkope ondersteuning.
●Na-verkope ondersteuning:Ons verbintenis strek verder as projekvoltooiing met 'n 3-maande na-verkope dienstydperk. Gedurende hierdie tyd bied ons projekopvolg, hulp met probleemoplossing en vraag-en-antwoordsessies om enige navrae rakende die resultate te beantwoord.
Diensspesifikasies
| Volgordebepalingsplatform | Volgordebepalingstrategie | Aanbevole data | Gehaltebeheer |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Diepte van 100x | Q30≥85% |
Voorbeeldvereistes
| Konsentrasie (ng/µL) | Totale bedrag (ng) | Volume (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterieë: ≥1x107 selle
Eensellige swamme: ≥5x106-1x107 selle
Makro-swamme: ≥4g
Dienswerkvloei
Voorbeeld aflewering
Biblioteekkonstruksie
Volgordebepaling
Data-analise
Na-verkope dienste
Sluit die volgende analise in:
- Volgordebepaling Datakwaliteitsbeheer
- Belyning met die Verwysingsgenoom
- Variantroeping: SNP en InDel
- Variant-annotasie
Variantroeping: SNP-tipes
Variantroeping: InDel-lengteverspreiding
Verken die vooruitgang wat deur BMKGene se mikrobiese genoom-hervolgordebepalingsdienste gefasiliteer word deur 'n saamgestelde versameling publikasies.
Jia, Y. et al. (2023) 'Die kombinering van transkriptoom- en hele genoomhervolgordebepaling om siekteweerstandsgene vir koringdwergbont te ondersoek',Internasionale tydskrif vir molekulêre wetenskappe, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Ampisillien-beheerde glukosemetabolisme manipuleer die oorgang van toleransie na weerstand in bakterieë',Wetenskaplike vooruitgang, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., 'n haloalkalifiele bakterie geïsoleer uit 'n sodameer in die outonome streek Binne-Mongolië, China', Int. J. Syst. Evol.Mikrobiol, 72, bl. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. en Wang, G.-H. (2024) 'Genoomvolgorde van Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, geïsoleer van Nasonia vitripennis',Aankondigings oor Mikrobiologie-hulpbronnedoi: 10.1128/MRA.00802-23.
