Hervolgordebepaling van die hele genoom van bakterieë en swamme
Bakteriële en swam-heelgenoom-hervolgorde-projekte is deurslaggewend vir die bevordering van mikrobiese genomika deur die voltooiing en vergelyking van mikrobiese genome moontlik te maak. Dit vergemaklik fermentasie-ingenieurswese, die optimalisering van industriële prosesse, en die verkenning van sekondêre metabolisme-bane. Verder is swam- en bakteriese hervolgordebepaling van kardinale belang vir die begrip van omgewingsaanpassing, die optimalisering van stamme en die onthulling van genetiese evolusiedinamika, met breë implikasies in medisyne, landbou en omgewingswetenskap.
Diensvoordele
●Bioinformatiese analise sluit variante roeping in:Die verskaffing van funksionele insigte in die hervolgorde-genome.
● Uitgebreide Kundigheid: Met duisende mikrobiese hervolgorde-projekte wat jaarliks uitgevoer word, bring ons meer as 'n dekade se ondervinding, 'n hoogs bekwame ontledingspan, omvattende inhoud en uitstekende na-verkope ondersteuning.
●Ondersteuning na verkope:Ons verbintenis strek verder as projekvoltooiing met 'n 3-maande na-verkope dienstydperk. Gedurende hierdie tyd bied ons projekopvolging, probleemoplossingshulp en V&A-sessies aan om enige navrae wat met die resultate verband hou, aan te spreek.
Diensspesifikasies
| Volgorde-platform | Opeenvolgingstrategie | Data aanbeveel | Gehaltebeheer |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Diepte van 100x | Q30≥85% |
Voorbeeldvereistes
| Konsentrasie (ng/µL) | Totale bedrag (ng) | Volume (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterieë: ≥1x107 selle
Eensellige swamme: ≥5x106-1x107 selle
Makroswamme: ≥4g
Dienswerkvloei
Voorbeeld aflewering
Biblioteek konstruksie
Opeenvolging
Data-analise
Na-verkope dienste
Sluit die volgende ontleding in:
- Opeenvolging van datakwaliteitbeheer
- Belyning met die verwysingsgenoom
- Variant roeping: SNP en InDel
- Variant-aantekening
Variant roeping: SNP tipes
Variant roeping: InDel lengte verspreiding
Verken die vooruitgang wat deur BMKGene se mikrobiese genoom-hervolgorde-dienste gefasiliteer word deur 'n saamgestelde versameling publikasies.
Jia, Y. et al. (2023) 'Kombinering van transkriptoom- en hele genoomhervolgorde om siekteweerstandsgene vir koringdwergbunt te skerm',Internasionale joernaal vir molekulêre wetenskappe, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Ampicillien-beheerde glukosemetabolisme manipuleer die oorgang van verdraagsaamheid na weerstand in bakterieë',Wetenskap vooruitgang, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., 'n haloalkalifiele bakterie wat geïsoleer is uit 'n sodameer in die outonome streek binne-Mongolië, China', Int. J. Syst. Evol.Mikrobiol, 72, bl. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. en Wang, G.-H. (2024) 'Genoomvolgorde van Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, geïsoleer van Nasonia vitripennis',Mikrobiologie Hulpbron Aankondigings. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
